RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518136.3

HOXA13-202, Transcript of homeobox A13, humanhuman

TSL 2

Gene HOXA13, Length 871 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13-202ENST00000518136 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 UBA7P41226 1012 aa9.31□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 KRT76Q01546 638 aa9.31□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 SP4Q02446 784 aa9.31□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 PNOCQ13519 176 aa9.31□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 EPHA7Q15375 998 aa9.31□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 SWI5Q1ZZU3 235 aa9.31□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 CCDC144BQ3MJ40 725 aa9.31□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 HSDL1Q3SXM5 330 aa9.31□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 CCDC183Q5T5S1 534 aa9.31□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 METTL7BQ6UX53 244 aa9.31□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 MIER3Q7Z3K6 550 aa9.31□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 SCFD2Q8WU76 684 aa9.31□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 RAD54LQ92698 747 aa9.31□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 PAGE5Q96GU1 130 aa9.31□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 CDHR1Q96JP9 859 aa9.31□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 GPR20Q99678 358 aa9.31□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 NUP62CLQ9H1M0 184 aa9.31□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa9.31□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 KBTBD4Q9NVX7 518 aa9.31□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 SLC9A2Q9UBY0 812 aa9.31□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 WDR64B1ANS9 1081 aa9.3□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa9.3□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 TXNP10599 105 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 TGFB3P10600 412 aa9.3□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 BMP6P22004 513 aa9.3□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 NOS2P35228 1153 aa9.3□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 STAT6P42226 847 aa9.3□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 JAK3P52333 1124 aa9.3□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 TEAD4Q15561 434 aa9.3□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa9.3□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 KRT79Q5XKE5 535 aa9.3□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 CKAP2LQ8IYA6 745 aa9.3□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 SPATA20Q8TB22 786 aa9.3□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 SDF4Q9BRK5 362 aa9.3□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 LXNQ9BS40 222 aa9.3□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 RAB34Q9BZG1 259 aa9.3□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 TUFT1Q9NNX1 390 aa9.3□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 ZNF232Q9UNY5 417 aa9.3□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 A0A1B0GTH6 734 aa9.29□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 SYCE3A1L190 88 aa9.29□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 SERTM1A2A2V5 107 aa9.29□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 MYMKA6NI61 221 aa9.29□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 B4DLN1 442 aa9.29□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 TERTO14746 1132 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 SLC26A4O43511 780 aa9.29□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 KLRC4O43908 158 aa9.29□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 KINO60870 393 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 LYPLA2O95372 231 aa9.29□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 SFNP31947 248 aa9.29□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 AFMP43652 599 aa9.29□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 SARSP49591 514 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 SLC12A3P55017 1021 aa9.29□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 CUL4BQ13620 913 aa9.29□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 NEDD9Q14511 834 aa9.29□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 TTLL4Q14679 1199 aa9.29□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 DUSP28Q4G0W2 176 aa9.29□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 ARSHQ5FYA8 562 aa9.29□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 RRAGBQ5VZM2 374 aa9.29□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 KCNV1Q6PIU1 500 aa9.29□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa9.29□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 GAS2L3Q86XJ1 694 aa9.29□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa9.29□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 IQUBQ8NA54 791 aa9.29□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 CNNM3Q8NE01 707 aa9.29□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 RDM1Q8NG50 284 aa9.29□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 PIGOQ8TEQ8 1089 aa9.29□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 DNAJC19Q96DA6 116 aa9.29□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 ERO1AQ96HE7 468 aa9.29□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 CEP89Q96ST8 783 aa9.29□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 RUSC1Q9BVN2 902 aa9.29□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 BLZF1Q9H2G9 400 aa9.29□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 SLC5A4Q9NY91 659 aa9.29□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 STK17AQ9UEE5 414 aa9.29□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 TUBE1Q9UJT0 475 aa9.29□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa9.29□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa9.29□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa9.28□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 MYADML2A6NDP7 307 aa9.28□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 ADCY3O60266 1144 aa9.28□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 F11P03951 625 aa9.28□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 P4HBP07237 508 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 PLA2G4BP0C869 781 aa9.28□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms