RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 FGFR4P22455 802 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP2-210ENST00000505941 PHKA2P46019 1235 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM189BP81408 668 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP2-210ENST00000505941 DSC3Q14574 896 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP2-210ENST00000505941 PTPROQ16827 1216 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP2-210ENST00000505941 ABI1Q8IZP0 508 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP2-210ENST00000505941 RNF149Q8NC42 400 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP2-210ENST00000505941 MCPH1Q8NEM0 835 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP2-210ENST00000505941 SNX29Q8TEQ0 813 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP2-210ENST00000505941 SNX21Q969T3 373 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
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SH3BP2-210ENST00000505941 BMP15O95972 392 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP2-210ENST00000505941 CTNNB1P35222 781 aa23.44■■□□□ 1.34
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SH3BP2-210ENST00000505941 CHD9Q3L8U1 2897 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP2-210ENST00000505941 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
SH3BP2-210ENST00000505941 GPM6BQ13491 265 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP2-210ENST00000505941 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP23.43■■□□□ 1.34
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SH3BP2-210ENST00000505941 IFT122Q9HBG6 1241 aa23.43■■□□□ 1.34
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SH3BP2-210ENST00000505941 BMPR1AP36894 532 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP2-210ENST00000505941 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
SH3BP2-210ENST00000505941 PADI6Q6TGC4 694 aa23.42■■□□□ 1.34
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SH3BP2-210ENST00000505941 RNF169Q8NCN4 708 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP2-210ENST00000505941 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
SH3BP2-210ENST00000505941 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
SH3BP2-210ENST00000505941 A0A0U1RQF3 1178 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP2-210ENST00000505941 TBKBP1A7MCY6 615 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP2-210ENST00000505941 H3BNC9 293 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP2-210ENST00000505941 SYT1P21579 422 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP2-210ENST00000505941 ARL2P36404 184 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP2-210ENST00000505941 POU5F1BQ06416 359 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM102BQ5T8I3 360 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP2-210ENST00000505941 ECHDC2Q86YB7 292 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP2-210ENST00000505941 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP23.41■■□□□ 1.34
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SH3BP2-210ENST00000505941 COL6A3P12111 3177 aa23.4■■□□□ 1.34
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SH3BP2-210ENST00000505941 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2-210ENST00000505941 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2-210ENST00000505941 CDH23Q9H251 3354 aa23.39■■□□□ 1.34
SH3BP2-210ENST00000505941 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa23.39■■□□□ 1.33
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SH3BP2-210ENST00000505941 CYP11B2P19099 503 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 PTENP60484 403 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 NAALADL2Q58DX5 795 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 KCTD17Q8N5Z5 321 aa23.39■■□□□ 1.33
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SH3BP2-210ENST00000505941 TMEM117Q9H0C3 514 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 BHMT2Q9H2M3 363 aa23.39■■□□□ 1.33
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SH3BP2-210ENST00000505941 C5orf67F2Z3F1 127 aa23.38■■□□□ 1.33
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SH3BP2-210ENST00000505941 FGFR1P11362 822 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 AXLP30530 894 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 GATMP50440 423 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 IL17AQ16552 155 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa23.38■■□□□ 1.33
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SH3BP2-210ENST00000505941 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 IFT74Q96LB3 600 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 AK8Q96MA6 479 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 NT5C3AQ9H0P0 336 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 LRRIQ4A6NIV6 560 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 GLRA2P23416 452 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 PPP2R5AQ15172 486 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 ASAP3Q8TDY4 903 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 NFKBIZQ9BYH8 718 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 LMAN2LQ9H0V9 348 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 CHD7Q9P2D1 2997 aa23.37■■□□□ 1.33
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