RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000500401.2

SPCS2P3-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 2 pseudogene 3, humanhuman

BASIC

Gene SPCS2P3, Length 656 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS2P3-201ENST00000500401 EXOC8Q8IYI6 725 aa26.92■■□□□ 1.9
SPCS2P3-201ENST00000500401 GDPD5Q8WTR4 605 aa26.92■■□□□ 1.9
SPCS2P3-201ENST00000500401 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
SPCS2P3-201ENST00000500401 GAS2O43903 313 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
SPCS2P3-201ENST00000500401 ARL2P36404 184 aa26.91■■□□□ 1.9
SPCS2P3-201ENST00000500401 FAM189BP81408 668 aa26.91■■□□□ 1.9
SPCS2P3-201ENST00000500401 CDC42EP1Q00587 391 aa26.91■■□□□ 1.9
SPCS2P3-201ENST00000500401 GRB10Q13322 594 aa26.91■■□□□ 1.9
SPCS2P3-201ENST00000500401 SLC24A5Q71RS6 500 aa26.91■■□□□ 1.9
SPCS2P3-201ENST00000500401 RNF149Q8NC42 400 aa26.91■■□□□ 1.9
SPCS2P3-201ENST00000500401 TCP11Q8WWU5 503 aa26.91■■□□□ 1.9
SPCS2P3-201ENST00000500401 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
SPCS2P3-201ENST00000500401 C1orf112Q9NSG2 853 aa26.91■■□□□ 1.9
SPCS2P3-201ENST00000500401 KIAA1024Q9UPX6 916 aa26.91■■□□□ 1.9
SPCS2P3-201ENST00000500401 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa26.9■■□□□ 1.9
SPCS2P3-201ENST00000500401 VWA3AA6NCI4 1184 aa26.9■■□□□ 1.9
SPCS2P3-201ENST00000500401 GLRA2P23416 452 aa26.9■■□□□ 1.9
SPCS2P3-201ENST00000500401 GRIN1Q05586 938 aa26.9■■□□□ 1.9
SPCS2P3-201ENST00000500401 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
SPCS2P3-201ENST00000500401 FAM102BQ5T8I3 360 aa26.9■■□□□ 1.9
SPCS2P3-201ENST00000500401 KCNK18Q7Z418 384 aa26.9■■□□□ 1.9
SPCS2P3-201ENST00000500401 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
SPCS2P3-201ENST00000500401 RNF19AQ9NV58 838 aa26.9■■□□□ 1.9
SPCS2P3-201ENST00000500401 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa26.89■■□□□ 1.9
SPCS2P3-201ENST00000500401 E9PMD0 336 aa26.89■■□□□ 1.9
SPCS2P3-201ENST00000500401 CAPSQ13938 189 aa26.89■■□□□ 1.9
SPCS2P3-201ENST00000500401 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
SPCS2P3-201ENST00000500401 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
SPCS2P3-201ENST00000500401 POLD4Q9HCU8 107 aa26.89■■□□□ 1.9
SPCS2P3-201ENST00000500401 CLIC4Q9Y696 253 aa26.89■■□□□ 1.9
SPCS2P3-201ENST00000500401 TRANK1O15050 2925 aa26.89■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 STX6O43752 255 aa26.88■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 STAG3L1P0CL83 205 aa26.88■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 FGFR1P11362 822 aa26.88■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 MUTP22033 750 aa26.88■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 EPC2Q52LR7 807 aa26.88■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 PADI6Q6TGC4 694 aa26.88■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 FIBCD1Q8N539 461 aa26.88■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 PNMA5Q96PV4 448 aa26.88■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 RAB34Q9BZG1 259 aa26.88■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 BHMT2Q9H2M3 363 aa26.88■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 HCSTQ9UBK5 93 aa26.88■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 LRFN2Q9ULH4 789 aa26.88■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa26.88■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 MTCH2Q9Y6C9 303 aa26.88■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 REV3LO60673 3130 aa26.88■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 ARHGEF35A5YM69 484 aa26.87■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP26.87■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 KRT79Q5XKE5 535 aa26.87■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 CATSPER4Q7RTX7 472 aa26.87■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 ECHDC2Q86YB7 292 aa26.87■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 TMEM192Q8IY95 271 aa26.87■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa26.87■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 PPM1EQ8WY54 764 aa26.87■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 BSNDQ8WZ55 320 aa26.87■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 ASAP2O43150 1006 aa26.86■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 PTENP60484 403 aa26.86■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 PTPAQ15257 358 aa26.86■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa26.86■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 FBXO22Q8NEZ5 403 aa26.86■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 PLIN2Q99541 437 aa26.86■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 TMEM161AQ9NX61 479 aa26.86■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 CYP11B2P19099 503 aa26.85■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 PRDM6Q9NQX0 595 aa26.85■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa26.85■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 MYH15Q9Y2K3 1946 aa26.84■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 MICALL1Q8N3F8 863 aa26.84■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 LRRC15Q8TF66 581 aa26.84■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa26.84■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 A0A0U1RQF3 1178 aa26.83■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 TBKBP1A7MCY6 615 aa26.83■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 CTNNB1P35222 781 aa26.83■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 PHKA2P46019 1235 aa26.83■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 MBTD1Q05BQ5 628 aa26.83■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 CLLU1OSQ5K130 101 aa26.83■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 HYIQ5T013 277 aa26.83■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 RNF169Q8NCN4 708 aa26.83■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 MCPH1Q8NEM0 835 aa26.83■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 USP28Q96RU2 1077 aa26.83■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 CHST12Q9NRB3 414 aa26.83■■□□□ 1.89
SPCS2P3-201ENST00000500401 STK24Q9Y6E0 443 aa26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms