RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496565.5

LPIN3-204, Transcript of lipin 3, human

TSL 3

Gene LPIN3, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LPIN3-204	ENST00000496565	ZBTB39	O15060	712 aa		10.31	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	PEX10	O60683	326 aa		10.31	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	10.31	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	NR3C1	P04150	777 aa		10.31	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	RSPH10B	P0C881	870 aa		10.31	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	AKR1A1	P14550	325 aa		10.31	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	NPTX2	P47972	431 aa		10.31	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	NPEPPS	P55786	919 aa		10.31	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	PEX3	P56589	373 aa		10.31	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	10.31	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	SP3	Q02447	781 aa		10.31	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	UBXN1	Q04323	297 aa		10.31	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	CETN1	Q12798	172 aa		10.31	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	ARID5B	Q14865	1188 aa		10.31	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	10.31	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		10.31	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		10.31	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	10.31	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	10.31	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		10.31	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	TMC6	Q7Z403	805 aa		10.31	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	10.31	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		10.31	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		10.31	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	10.31	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		10.31	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	SPC25	Q9HBM1	224 aa		10.31	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		10.31	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		10.31	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	MYO6	Q9UM54	1294 aa		10.31	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	TBX20	Q9UMR3	447 aa		10.31	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	10.31	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	10.31	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	MCM3AP	O60318	1980 aa		10.31	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		10.31	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	ARID2	Q68CP9	1835 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565		H3BRB1	525 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	TGFB1I1	O43294	461 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	ZEB2	O60315	1214 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	MYB	P10242	640 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	GNAT1	P11488	350 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	HOXD13	P35453	343 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	STRN3	Q13033	797 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	PLCB4	Q15147	1175 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	LRRC41	Q15345	812 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	KYAT1	Q16773	422 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	MTERF2	Q49AM1	385 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	ZPBP2	Q6X784	338 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	FAM81B	Q96LP2	452 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	NRCAM	Q92823	1304 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	MGAM	O43451	1857 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	GOLGA6L9	A6NEM1	432 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	SFI1	A8K8P3	1242 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565		K7ERI5	159 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	ARHGAP6	O43182	974 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	ADCY3	O60266	1144 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	LGALS2	P05162	132 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	KRT13	P13646	458 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	SMPD1	P17405	629 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	RFX1	P22670	979 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	FECH	P22830	423 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	GTF2H1	P32780	548 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	PSMC4	P43686	418 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	CASP5	P51878	434 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	CDK17	Q00537	523 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	SURF1	Q15526	300 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	SPC24	Q8NBT2	197 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	HPS3	Q969F9	1004 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	FBXL18	Q96ME1	805 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	VPS16	Q9H269	839 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	TMX1	Q9H3N1	280 aa		10.29	□□□□□ -0.76

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