RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496298.5

USP40-217, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 2

Gene USP40, Length 665 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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USP40-217ENST00000496298 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
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USP40-217ENST00000496298 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
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USP40-217ENST00000496298 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
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USP40-217ENST00000496298 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa21.65■■□□□ 1.06
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USP40-217ENST00000496298 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
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