RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495399.1

C9orf135-204, Transcript of chromosome 9 open reading frame 135, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf135, Length 502 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-204ENST00000495399 GPR149Q86SP6 731 aa8.58□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 LMBR1Q8WVP7 490 aa8.58□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 ATRIPQ8WXE1 791 aa8.58□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 ESR2Q92731 530 aa8.58□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 KRT23Q9C075 422 aa8.58□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 CNNM2Q9H8M5 875 aa8.58□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 ARHGEF3Q9NR81 526 aa8.58□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 SEMA4GQ9NTN9 838 aa8.58□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa8.58□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa8.58□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 FAM181BA6NEQ2 426 aa8.57□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 MGEA5O60502 916 aa8.57□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 SORBS3O60504 671 aa8.57□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 SCG2P13521 617 aa8.57□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 NCLP19338 710 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 LIMK1P53667 647 aa8.57□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 ZNF543Q08ER8 600 aa8.57□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 SEC23AQ15436 765 aa8.57□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 CSRP2Q16527 193 aa8.57□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 RNF20Q5VTR2 975 aa8.57□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 TSSK4Q6SA08 328 aa8.57□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 THNSL1Q8IYQ7 743 aa8.57□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 NCOA7Q8NI08 942 aa8.57□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP8.57□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 IWS1Q96ST2 819 aa8.57□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 UBA5Q9GZZ9 404 aa8.57□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 SENP2Q9HC62 589 aa8.57□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 KAT6AQ92794 2004 aa8.57□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 WDR19Q8NEZ3 1342 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 NRCAMQ92823 1304 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 TMEM8BA6NDV4 472 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 B4DLN1 442 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 LAMTOR5O43504 91 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 GGPS1O95749 300 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 CAPNS1P04632 268 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 STAG3L1P0CL83 205 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 CPA1P15085 419 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 NT5C2P49902 561 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 FZD5Q13467 585 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 TMC5Q6UXY8 1006 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 ADAM32Q8TC27 787 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 SPATA33Q96N06 139 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 GPR20Q99678 358 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 RXFP3Q9NSD7 469 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 RNF19AQ9NV58 838 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 GMEB2Q9UKD1 530 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 PADI3Q9ULW8 664 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 MRVI1Q9Y6F6 885 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 CDY2AQ9Y6F7 541 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 GREB1Q4ZG55 1949 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 TBKBP1A7MCY6 615 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 KCNK5O95279 499 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 RETP07949 1114 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 NR3C2P08235 984 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 SNHG28P0DPA3 235 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 SPINK2P20155 84 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 PBX3P40426 434 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 SARSP49591 514 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 TRDNQ13061 729 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 WTAPQ15007 396 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 LPAL2Q16609 132 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 LETM2Q2VYF4 491 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 MARCH8Q5T0T0 291 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 LAIR1Q6GTX8 287 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 PRR23BQ6ZRT6 265 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 CCDC149Q6ZUS6 474 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 TMC7Q7Z402 723 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 TRIM50Q86XT4 487 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 TCEANC2Q96MN5 208 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 TTC14Q96N46 770 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 MYADMQ96S97 322 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 RMDN3Q96TC7 470 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 FTHL17Q9BXU8 183 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 LRRC2Q9BYS8 371 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf135-204ENST00000495399 BACH2Q9BYV9 841 aa8.55□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.9 ms