RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490510.5

PITRM1-211, Transcript of pitrilysin metallopeptidase 1, humanhuman

TSL 2

Gene PITRM1, Length 778 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1-211ENST00000490510 MBTPS2O43462 519 aa21.47■■□□□ 1.03
PITRM1-211ENST00000490510 MARCH6O60337 910 aa21.47■■□□□ 1.03
PITRM1-211ENST00000490510 LAG3P18627 525 aa21.47■■□□□ 1.03
PITRM1-211ENST00000490510 ERVFC1P60507 584 aa21.47■■□□□ 1.03
PITRM1-211ENST00000490510 ZP2Q05996 745 aa21.47■■□□□ 1.03
PITRM1-211ENST00000490510 SPIRE1Q08AE8 756 aa21.47■■□□□ 1.03
PITRM1-211ENST00000490510 EFHBQ8N7U6 833 aa21.47■■□□□ 1.03
PITRM1-211ENST00000490510 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa21.47■■□□□ 1.03
PITRM1-211ENST00000490510 CEP170P1Q96L14 293 aa21.47■■□□□ 1.03
PITRM1-211ENST00000490510 C11orf16Q9NQ32 467 aa21.47■■□□□ 1.03
PITRM1-211ENST00000490510 TLR9Q9NR96 1032 aa21.47■■□□□ 1.03
PITRM1-211ENST00000490510 RGL1Q9NZL6 768 aa21.47■■□□□ 1.03
PITRM1-211ENST00000490510 CLEC1BQ9P126 229 aa21.47■■□□□ 1.03
PITRM1-211ENST00000490510 FAM50BQ9Y247 325 aa21.47■■□□□ 1.03
PITRM1-211ENST00000490510 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.03
PITRM1-211ENST00000490510 PBX3P40426 434 aa21.46■■□□□ 1.03
PITRM1-211ENST00000490510 NDUFV1P49821 464 aa21.46■■□□□ 1.03
PITRM1-211ENST00000490510 FOSBP53539 338 aa21.46■■□□□ 1.03
PITRM1-211ENST00000490510 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
PITRM1-211ENST00000490510 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa21.46■■□□□ 1.03
PITRM1-211ENST00000490510 NCAPH2Q6IBW4 605 aa21.46■■□□□ 1.03
PITRM1-211ENST00000490510 ZNF410Q86VK4 478 aa21.46■■□□□ 1.03
PITRM1-211ENST00000490510 C4orf19Q8IY42 314 aa21.46■■□□□ 1.03
PITRM1-211ENST00000490510 ABI1Q8IZP0 508 aa21.46■■□□□ 1.03
PITRM1-211ENST00000490510 LRRC43Q8N309 656 aa21.46■■□□□ 1.03
PITRM1-211ENST00000490510 MSLNLQ96KJ4 702 aa21.46■■□□□ 1.03
PITRM1-211ENST00000490510 NLRP4Q96MN2 994 aa21.46■■□□□ 1.03
PITRM1-211ENST00000490510 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
PITRM1-211ENST00000490510 LXNQ9BS40 222 aa21.46■■□□□ 1.03
PITRM1-211ENST00000490510 LRFN3Q9BTN0 628 aa21.46■■□□□ 1.03
PITRM1-211ENST00000490510 BRMS1Q9HCU9 246 aa21.46■■□□□ 1.03
PITRM1-211ENST00000490510 CHST12Q9NRB3 414 aa21.46■■□□□ 1.03
PITRM1-211ENST00000490510 DACT1Q9NYF0 836 aa21.46■■□□□ 1.03
PITRM1-211ENST00000490510 CD207Q9UJ71 328 aa21.46■■□□□ 1.03
PITRM1-211ENST00000490510 BTBD18B2RXH4 712 aa21.45■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 WNT7AO00755 349 aa21.45■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 FSCN2O14926 492 aa21.45■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 PER2O15055 1255 aa21.45■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 GLP2RO95838 553 aa21.45■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 EOMESO95936 686 aa21.45■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 PLCB3Q01970 1234 aa21.45■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 KCNT2Q6UVM3 1135 aa21.45■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 HELQQ8TDG4 1101 aa21.45■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 DYDC2Q96IM9 177 aa21.45■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 TLE6Q9H808 572 aa21.45■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 PRKAG3Q9UGI9 489 aa21.45■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 C19orf67A6NJJ6 358 aa21.44■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 ZBTB39O15060 712 aa21.44■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 YWHABP31946 246 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 PHKA2P46019 1235 aa21.44■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 TMEM31Q5JXX7 168 aa21.44■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 ADHFE1Q8IWW8 467 aa21.44■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 SLFN12Q8IYM2 578 aa21.44■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 SLC7A3Q8WY07 619 aa21.44■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 TMEM143Q96AN5 459 aa21.44■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 IFT122Q9HBG6 1241 aa21.44■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 LZTS1Q9Y250 596 aa21.44■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa21.44■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 FAM86C2PA6NEL3 165 aa21.43■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 BAG4O95429 457 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 EYA4O95677 639 aa21.43■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 RBM10P98175 930 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 CYP4A11Q02928 519 aa21.43■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 CATSPER4Q7RTX7 472 aa21.43■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 VN1R2Q8NFZ6 395 aa21.43■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 LPPQ93052 612 aa21.43■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 ZNF558Q96NG5 402 aa21.43■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 TRAIPQ9BWF2 469 aa21.43■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa21.43■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 PPME1Q9Y570 386 aa21.43■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 GPR37L1O60883 481 aa21.42■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 SLITRK3O94933 977 aa21.42■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 RFC5P40937 340 aa21.42■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 DUSP6Q16828 381 aa21.42■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 LONRF3Q496Y0 759 aa21.42■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 PLPP4Q5VZY2 271 aa21.42■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 MINDY3Q9H8M7 445 aa21.42■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 MEIS3P2A8K0S8 358 aa21.41■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa21.41■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa21.41■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 COASYQ13057 564 aa21.41■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 CALCRLQ16602 461 aa21.41■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 XKR9Q5GH70 373 aa21.41■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 OTUD6AQ7L8S5 288 aa21.41■■□□□ 1.02
PITRM1-211ENST00000490510 TPH2Q8IWU9 490 aa21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms