RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490478.5

CACNA2D3-210, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CACNA2D3, Length 3,557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3-210ENST00000490478 PPFIBP2Q8ND30 876 aa7.4□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 XDHP47989 1333 aa7.4□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 UMODL1Q5DID0 1318 aa7.4□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 PI4KAP2A4QPH2 592 aa7.4□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 TPPPO94811 219 aa7.4□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 MARK3P27448 753 aa7.4□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 CCT8P50990 548 aa7.4□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 NAA20P61599 178 aa7.4□□□□□ -1.22
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CACNA2D3-210ENST00000490478 NKX2-3Q8TAU0 364 aa7.4□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 CXorf38Q8TB03 319 aa7.4□□□□□ -1.22
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CACNA2D3-210ENST00000490478 TRPC7Q9HCX4 862 aa7.4□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 PRELID1Q9Y255 219 aa7.4□□□□□ -1.22
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CACNA2D3-210ENST00000490478 PTK7Q13308 1070 aa7.4□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 ACVR2BQ13705 512 aa7.4□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 MPP2Q14168 576 aa7.4□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 METTL21CQ5VZV1 264 aa7.4□□□□□ -1.23
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CACNA2D3-210ENST00000490478 DSCC1Q9BVC3 393 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 FAM117AQ9C073 453 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 NDEL1Q9GZM8 345 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 EBF3Q9H4W6 596 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 SYNCQ9H7C4 482 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 EXOC1Q9NV70 894 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 MKS1Q9NXB0 559 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 SELENONQ9NZV5 590 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 STX8Q9UNK0 236 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 DIP2AQ14689 1571 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 TTLL13PA6NNM8 815 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 CCDC169A6NNP5 214 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.23
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CACNA2D3-210ENST00000490478 ADCY3O60266 1144 aa7.39□□□□□ -1.23
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CACNA2D3-210ENST00000490478 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 DEPDC1Q5TB30 811 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 CYB5R4Q7L1T6 521 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 NELFCDQ8IXH7 590 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 KAZALD1Q96I82 304 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
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