RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490435.5

ITGA4-211, Transcript of integrin subunit alpha 4, humanhuman

TSL 5

Gene ITGA4, Length 720 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4-211ENST00000490435 PACSIN3Q9UKS6 424 aa6.55□□□□□ -1.36
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ITGA4-211ENST00000490435 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
ITGA4-211ENST00000490435 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
ITGA4-211ENST00000490435 OTOP1Q7RTM1 612 aa6.54□□□□□ -1.36
ITGA4-211ENST00000490435 MB21D1Q8N884 522 aa6.54□□□□□ -1.36
ITGA4-211ENST00000490435 MDGA1Q8NFP4 955 aa6.54□□□□□ -1.36
ITGA4-211ENST00000490435 PROKR1Q8TCW9 393 aa6.54□□□□□ -1.36
ITGA4-211ENST00000490435 DYDC2Q96IM9 177 aa6.54□□□□□ -1.36
ITGA4-211ENST00000490435 MAML3Q96JK9 1138 aa6.54□□□□□ -1.36
ITGA4-211ENST00000490435 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
ITGA4-211ENST00000490435 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa6.54□□□□□ -1.36
ITGA4-211ENST00000490435 FZD1Q9UP38 647 aa6.54□□□□□ -1.36
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ITGA4-211ENST00000490435 ABHD16AO95870 558 aa6.53□□□□□ -1.36
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ITGA4-211ENST00000490435 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
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ITGA4-211ENST00000490435 C1QL3Q5VWW1 255 aa6.52□□□□□ -1.37
ITGA4-211ENST00000490435 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
ITGA4-211ENST00000490435 ABHD17CQ6PCB6 329 aa6.52□□□□□ -1.37
ITGA4-211ENST00000490435 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa6.52□□□□□ -1.37
ITGA4-211ENST00000490435 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
ITGA4-211ENST00000490435 NCDNQ9UBB6 729 aa6.52□□□□□ -1.37
ITGA4-211ENST00000490435 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa6.52□□□□□ -1.37
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ITGA4-211ENST00000490435 CMTM4Q8IZR5 234 aa6.51□□□□□ -1.37
ITGA4-211ENST00000490435 ST8SIA2Q92186 375 aa6.51□□□□□ -1.37
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ITGA4-211ENST00000490435 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa6.5□□□□□ -1.37
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ITGA4-211ENST00000490435 CPT1CQ8TCG5 803 aa6.49□□□□□ -1.37
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ITGA4-211ENST00000490435 PCIF1Q9H4Z3 704 aa6.49□□□□□ -1.37
ITGA4-211ENST00000490435 HS3ST4Q9Y661 456 aa6.49□□□□□ -1.37
ITGA4-211ENST00000490435 GRID2IPA4D2P6 1211 aa6.48□□□□□ -1.37
ITGA4-211ENST00000490435 ZAR1LA6NP61 321 aa6.48□□□□□ -1.37
ITGA4-211ENST00000490435 CYP17A1P05093 508 aa6.48□□□□□ -1.37
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ITGA4-211ENST00000490435 TIGD2Q4W5G0 525 aa6.48□□□□□ -1.37
ITGA4-211ENST00000490435 FGD2Q7Z6J4 655 aa6.48□□□□□ -1.37
ITGA4-211ENST00000490435 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
ITGA4-211ENST00000490435 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa6.48□□□□□ -1.37
ITGA4-211ENST00000490435 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
ITGA4-211ENST00000490435 TOR3AQ9H497 397 aa6.48□□□□□ -1.37
ITGA4-211ENST00000490435 DVL2O14641 736 aa6.47□□□□□ -1.37
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ITGA4-211ENST00000490435 MTSS1O43312 755 aa6.47□□□□□ -1.37
ITGA4-211ENST00000490435 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP6.47□□□□□ -1.37
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ITGA4-211ENST00000490435 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa6.47□□□□□ -1.37
ITGA4-211ENST00000490435 TRIM39Q9HCM9 518 aa6.47□□□□□ -1.37
ITGA4-211ENST00000490435 B4E1Z4 1266 aa6.46□□□□□ -1.38
ITGA4-211ENST00000490435 MASP2O00187 686 aa6.46□□□□□ -1.38
ITGA4-211ENST00000490435 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
ITGA4-211ENST00000490435 GYPEP15421 78 aa6.46□□□□□ -1.38
ITGA4-211ENST00000490435 HK1P19367 917 aa6.46□□□□□ -1.38
ITGA4-211ENST00000490435 ATP2B1P20020 1258 aa6.46□□□□□ -1.38
ITGA4-211ENST00000490435 TAP1Q03518 808 aa6.46□□□□□ -1.38
ITGA4-211ENST00000490435 EPHA7Q15375 998 aa6.46□□□□□ -1.38
ITGA4-211ENST00000490435 MAN2A1Q16706 1144 aa6.46□□□□□ -1.38
ITGA4-211ENST00000490435 HECTD2Q5U5R9 776 aa6.46□□□□□ -1.38
ITGA4-211ENST00000490435 LRCH2Q5VUJ6 765 aa6.46□□□□□ -1.38
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