RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489379.1

EHD1-211, Transcript of EH domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene EHD1, Length 588 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD1-211ENST00000489379 GRB10Q13322 594 aa27.1■■□□□ 1.93
EHD1-211ENST00000489379 TFDP1Q14186 410 aa27.1■■□□□ 1.93
EHD1-211ENST00000489379 EPC2Q52LR7 807 aa27.1■■□□□ 1.93
EHD1-211ENST00000489379 TMEM192Q8IY95 271 aa27.1■■□□□ 1.93
EHD1-211ENST00000489379 SLC17A8Q8NDX2 589 aa27.1■■□□□ 1.93
EHD1-211ENST00000489379 MCPH1Q8NEM0 835 aa27.1■■□□□ 1.93
EHD1-211ENST00000489379 C17orf80Q9BSJ5 609 aa27.1■■□□□ 1.93
EHD1-211ENST00000489379 IFT122Q9HBG6 1241 aa27.1■■□□□ 1.93
EHD1-211ENST00000489379 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa27.1■■□□□ 1.93
EHD1-211ENST00000489379 MTCH2Q9Y6C9 303 aa27.1■■□□□ 1.93
EHD1-211ENST00000489379 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
EHD1-211ENST00000489379 RFXAPO00287 272 aa27.09■■□□□ 1.93
EHD1-211ENST00000489379 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
EHD1-211ENST00000489379 KRT79Q5XKE5 535 aa27.09■■□□□ 1.93
EHD1-211ENST00000489379 SPRED2Q7Z698 418 aa27.09■■□□□ 1.93
EHD1-211ENST00000489379 KSR1Q8IVT5 923 aa27.09■■□□□ 1.93
EHD1-211ENST00000489379 TRAIPQ9BWF2 469 aa27.09■■□□□ 1.93
EHD1-211ENST00000489379 MTUS1Q9ULD2 1270 aa27.09■■□□□ 1.93
EHD1-211ENST00000489379 C5orf67F2Z3F1 127 aa27.08■■□□□ 1.93
EHD1-211ENST00000489379 LPXNO60711 386 aa27.08■■□□□ 1.93
EHD1-211ENST00000489379 EOMESO95936 686 aa27.08■■□□□ 1.93
EHD1-211ENST00000489379 SKIP12755 728 aa27.08■■□□□ 1.93
EHD1-211ENST00000489379 PHKA2P46019 1235 aa27.08■■□□□ 1.93
EHD1-211ENST00000489379 CATSPER4Q7RTX7 472 aa27.08■■□□□ 1.93
EHD1-211ENST00000489379 KCTD17Q8N5Z5 321 aa27.08■■□□□ 1.93
EHD1-211ENST00000489379 RSPH1Q8WYR4 309 aa27.08■■□□□ 1.93
EHD1-211ENST00000489379 PLVAPQ9BX97 442 aa27.08■■□□□ 1.93
EHD1-211ENST00000489379 A0A0U1RQF3 1178 aa27.07■■□□□ 1.92
EHD1-211ENST00000489379 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
EHD1-211ENST00000489379 H3BNC9 293 aa27.07■■□□□ 1.92
EHD1-211ENST00000489379 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa27.07■■□□□ 1.92
EHD1-211ENST00000489379 ARL2P36404 184 aa27.07■■□□□ 1.92
EHD1-211ENST00000489379 BMPR1AP36894 532 aa27.07■■□□□ 1.92
EHD1-211ENST00000489379 POTEGQ6S5H5 508 aa27.07■■□□□ 1.92
EHD1-211ENST00000489379 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
EHD1-211ENST00000489379 RNF149Q8NC42 400 aa27.07■■□□□ 1.92
EHD1-211ENST00000489379 SNX29Q8TEQ0 813 aa27.07■■□□□ 1.92
EHD1-211ENST00000489379 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
EHD1-211ENST00000489379 ARHGEF35A5YM69 484 aa27.06■■□□□ 1.92
EHD1-211ENST00000489379 PTPROQ16827 1216 aa27.06■■□□□ 1.92
EHD1-211ENST00000489379 NAALADL2Q58DX5 795 aa27.06■■□□□ 1.92
EHD1-211ENST00000489379 ECHDC2Q86YB7 292 aa27.06■■□□□ 1.92
EHD1-211ENST00000489379 GDPD5Q8WTR4 605 aa27.06■■□□□ 1.92
EHD1-211ENST00000489379 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
EHD1-211ENST00000489379 NFKBIZQ9BYH8 718 aa27.06■■□□□ 1.92
EHD1-211ENST00000489379 USO1O60763 962 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
EHD1-211ENST00000489379 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
EHD1-211ENST00000489379 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
EHD1-211ENST00000489379 SYT1P21579 422 aa27.05■■□□□ 1.92
EHD1-211ENST00000489379 FGFR4P22455 802 aa27.05■■□□□ 1.92
EHD1-211ENST00000489379 CTNNB1P35222 781 aa27.05■■□□□ 1.92
EHD1-211ENST00000489379 RAB27AP51159 221 aa27.05■■□□□ 1.92
EHD1-211ENST00000489379 PTENP60484 403 aa27.05■■□□□ 1.92
EHD1-211ENST00000489379 HSCBQ8IWL3 235 aa27.05■■□□□ 1.92
EHD1-211ENST00000489379 LINC00271P0C7V0 271 aa27.04■■□□□ 1.92
EHD1-211ENST00000489379 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
EHD1-211ENST00000489379 GPM6BQ13491 265 aa27.04■■□□□ 1.92
EHD1-211ENST00000489379 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
EHD1-211ENST00000489379 P2RX5Q93086 422 aa27.04■■□□□ 1.92
EHD1-211ENST00000489379 TMEM117Q9H0C3 514 aa27.04■■□□□ 1.92
EHD1-211ENST00000489379 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa27.04■■□□□ 1.92
EHD1-211ENST00000489379 KIAA1024Q9UPX6 916 aa27.04■■□□□ 1.92
EHD1-211ENST00000489379 DNM3Q9UQ16 869 aa27.04■■□□□ 1.92
EHD1-211ENST00000489379 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
EHD1-211ENST00000489379 SLC26A4O43511 780 aa27.03■■□□□ 1.92
EHD1-211ENST00000489379 CYP11B2P19099 503 aa27.03■■□□□ 1.92
EHD1-211ENST00000489379 AXLP30530 894 aa27.03■■□□□ 1.92
EHD1-211ENST00000489379 IL17AQ16552 155 aa27.03■■□□□ 1.92
EHD1-211ENST00000489379 PADI6Q6TGC4 694 aa27.03■■□□□ 1.92
EHD1-211ENST00000489379 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP27.03■■□□□ 1.92
EHD1-211ENST00000489379 ABI1Q8IZP0 508 aa27.03■■□□□ 1.92
EHD1-211ENST00000489379 AK8Q96MA6 479 aa27.03■■□□□ 1.92
EHD1-211ENST00000489379 KIAA1671Q9BY89 1806 aa27.03■■□□□ 1.92
EHD1-211ENST00000489379 LMAN2LQ9H0V9 348 aa27.03■■□□□ 1.92
EHD1-211ENST00000489379 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
EHD1-211ENST00000489379 AAASQ9NRG9 546 aa27.03■■□□□ 1.92
EHD1-211ENST00000489379 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
EHD1-211ENST00000489379 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
EHD1-211ENST00000489379 A0A087WWV3 80 aa27.02■■□□□ 1.92
EHD1-211ENST00000489379 TBKBP1A7MCY6 615 aa27.02■■□□□ 1.92
EHD1-211ENST00000489379 ZNF623O75123 536 aa27.02■■□□□ 1.92
EHD1-211ENST00000489379 ERLIN2O94905 339 aa27.02■■□□□ 1.92
EHD1-211ENST00000489379 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
EHD1-211ENST00000489379 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
EHD1-211ENST00000489379 FAM102BQ5T8I3 360 aa27.02■■□□□ 1.92
EHD1-211ENST00000489379 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
EHD1-211ENST00000489379 PPM1EQ8WY54 764 aa27.02■■□□□ 1.92
EHD1-211ENST00000489379 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
EHD1-211ENST00000489379 NT5C3AQ9H0P0 336 aa27.02■■□□□ 1.92
EHD1-211ENST00000489379 EYA4O95677 639 aa27.01■■□□□ 1.91
EHD1-211ENST00000489379 GLRA2P23416 452 aa27.01■■□□□ 1.91
EHD1-211ENST00000489379 CAPSQ13938 189 aa27.01■■□□□ 1.91
EHD1-211ENST00000489379 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
EHD1-211ENST00000489379 ECM1Q16610 540 aa27.01■■□□□ 1.91
EHD1-211ENST00000489379 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa27.01■■□□□ 1.91
EHD1-211ENST00000489379 HYIQ5T013 277 aa27.01■■□□□ 1.91
EHD1-211ENST00000489379 MICALL1Q8N3F8 863 aa27.01■■□□□ 1.91
EHD1-211ENST00000489379 ASAP3Q8TDY4 903 aa27.01■■□□□ 1.91
EHD1-211ENST00000489379 BHMT2Q9H2M3 363 aa27.01■■□□□ 1.91
EHD1-211ENST00000489379 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.4 ms