RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488923.1

HDLBP-243, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-243ENST00000488923 CPXCR1Q8N123 301 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 ACRBPQ8NEB7 543 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 CYP2W1Q8TAV3 490 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 TBC1D5Q92609 795 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 ATP6V0A1Q93050 837 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 GJA10Q969M2 543 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 AGBL1Q96MI9 1066 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 TRERF1Q96PN7 1200 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 WRNIP1Q96S55 665 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 SENP7Q9BQF6 1050 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 LXNQ9BS40 222 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 RUSC1Q9BVN2 902 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 TEX13BQ9BXU2 312 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 GBP3Q9H0R5 595 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 PXMP2Q9NR77 195 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 GPRC5DQ9NZD1 345 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 RGL1Q9NZL6 768 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 TBC1D7Q9P0N9 293 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 FBXO40Q9UH90 709 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 EXOC7Q9UPT5 735 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 MYH7BA7E2Y1 1941 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 CTAGE15A4D2H0 777 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 LRRC53A6NM62 1247 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 NFIBO00712 420 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 P4HA2O15460 535 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 PJA2O43164 708 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 CHMP2AO43633 222 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 ERLIN1O75477 346 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 CTAGE8P0CG41 777 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 ARP10275 920 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 KRT13P13646 458 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 PRLRP16471 622 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 JUNDP17535 347 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 ITGB5P18084 799 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 COPB2P35606 906 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 KIF11P52732 1056 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 CHMP4BP1P59074 171 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 PSMC5P62195 406 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 ENPEPQ07075 957 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 CETN1Q12798 172 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 BRD3Q15059 726 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 PGM5Q15124 567 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 ELF2Q15723 593 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 ASIC2Q16515 512 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 EXOC3L4Q17RC7 722 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 ODR4Q5SWX8 454 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 TMCO3Q6UWJ1 677 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 ZNF720Q7Z2F6 126 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 USP37Q86T82 979 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 CTAGE6Q86UF2 777 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 CTAGE4Q8IX94 777 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 FAM186BQ8IYM0 893 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 SLC35F6Q8N357 371 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 CHST13Q8NET6 341 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 DNERQ8NFT8 737 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 PIGOQ8TEQ8 1089 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 BAP1Q92560 729 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 RUBCNQ92622 972 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 RMDN3Q96TC7 470 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 PDCD2LQ9BRP1 358 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 ACAD9Q9H845 621 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 RNF146Q9NTX7 359 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 AIPL1Q9NZN9 384 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 OGFRQ9NZT2 677 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 RNF14Q9UBS8 474 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 GUCA1BQ9UMX6 200 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 JRKLQ9Y4A0 524 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 SAMM50Q9Y512 469 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 SAR1BQ9Y6B6 198 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 NFASCO94856 1347 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 BTNL10A8MVZ5 291 aa7.24□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 IGHA1P01876 353 aa7.24□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 MYBP10242 640 aa7.24□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 PLS3P13797 630 aa7.24□□□□□ -1.25
HDLBP-243ENST00000488923 FERP16591 822 aa7.24□□□□□ -1.25
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