RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477216.1

SKIL-208, Transcript of SKI like proto-oncogene, human

TSL 4

Gene SKIL, Length 554 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKIL-208	ENST00000477216	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05
SKIL-208	ENST00000477216	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		27.86	■■■□□ 2.05
SKIL-208	ENST00000477216	UPP2	O95045	317 aa		27.86	■■■□□ 2.05
SKIL-208	ENST00000477216	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
SKIL-208	ENST00000477216	KRT85	P78386	507 aa		27.86	■■■□□ 2.05
SKIL-208	ENST00000477216	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		27.86	■■■□□ 2.05
SKIL-208	ENST00000477216	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
SKIL-208	ENST00000477216	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		27.86	■■■□□ 2.05
SKIL-208	ENST00000477216	FBXL18	Q96ME1	805 aa		27.86	■■■□□ 2.05
SKIL-208	ENST00000477216	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
SKIL-208	ENST00000477216	PPP6R2	O75170	966 aa		27.85	■■■□□ 2.05
SKIL-208	ENST00000477216	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
SKIL-208	ENST00000477216	MUT	P22033	750 aa		27.85	■■■□□ 2.05
SKIL-208	ENST00000477216	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
SKIL-208	ENST00000477216	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
SKIL-208	ENST00000477216	MTERF2	Q49AM1	385 aa		27.85	■■■□□ 2.05
SKIL-208	ENST00000477216	POTEG	Q6S5H5	508 aa		27.85	■■■□□ 2.05
SKIL-208	ENST00000477216	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		27.85	■■■□□ 2.05
SKIL-208	ENST00000477216	CLIC6	Q96NY7	704 aa		27.85	■■■□□ 2.05
SKIL-208	ENST00000477216	CSRNP2	Q9H175	543 aa		27.85	■■■□□ 2.05
SKIL-208	ENST00000477216	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		27.85	■■■□□ 2.05
SKIL-208	ENST00000477216	KAT6A	Q92794	2004 aa		27.85	■■■□□ 2.05
SKIL-208	ENST00000477216	ZBTB39	O15060	712 aa		27.84	■■■□□ 2.05
SKIL-208	ENST00000477216	KLRC1	P26715	233 aa		27.84	■■■□□ 2.05
SKIL-208	ENST00000477216	ECM1	Q16610	540 aa		27.84	■■■□□ 2.05
SKIL-208	ENST00000477216	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		27.84	■■■□□ 2.05
SKIL-208	ENST00000477216	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		27.84	■■■□□ 2.05
SKIL-208	ENST00000477216	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		27.84	■■■□□ 2.05
SKIL-208	ENST00000477216	C22orf31	O95567	290 aa		27.83	■■■□□ 2.05
SKIL-208	ENST00000477216	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
SKIL-208	ENST00000477216	CTNNB1	P35222	781 aa		27.83	■■■□□ 2.05
SKIL-208	ENST00000477216	NPEPPS	P55786	919 aa		27.83	■■■□□ 2.05
SKIL-208	ENST00000477216	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		27.83	■■■□□ 2.05
SKIL-208	ENST00000477216	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		27.83	■■■□□ 2.05
SKIL-208	ENST00000477216	RPAIN	Q86UA6	219 aa		27.83	■■■□□ 2.05
SKIL-208	ENST00000477216	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		27.83	■■■□□ 2.05
SKIL-208	ENST00000477216	PLVAP	Q9BX97	442 aa		27.83	■■■□□ 2.05
SKIL-208	ENST00000477216	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		27.83	■■■□□ 2.05
SKIL-208	ENST00000477216	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		27.83	■■■□□ 2.05
SKIL-208	ENST00000477216	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		27.83	■■■□□ 2.05
SKIL-208	ENST00000477216	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		27.83	■■■□□ 2.05
SKIL-208	ENST00000477216	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		27.83	■■■□□ 2.04
SKIL-208	ENST00000477216		A0A087WWV3	80 aa		27.82	■■■□□ 2.04
SKIL-208	ENST00000477216	UBA7	P41226	1012 aa		27.82	■■■□□ 2.04
SKIL-208	ENST00000477216	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
SKIL-208	ENST00000477216	RSPH3	Q86UC2	560 aa		27.82	■■■□□ 2.04
SKIL-208	ENST00000477216	CABP7	Q86V35	215 aa		27.82	■■■□□ 2.04
SKIL-208	ENST00000477216	CEP170P1	Q96L14	293 aa		27.82	■■■□□ 2.04
SKIL-208	ENST00000477216	NACC1	Q96RE7	527 aa		27.82	■■■□□ 2.04
SKIL-208	ENST00000477216	CEP89	Q96ST8	783 aa		27.82	■■■□□ 2.04
SKIL-208	ENST00000477216	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		27.82	■■■□□ 2.04
SKIL-208	ENST00000477216	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		27.82	■■■□□ 2.04
SKIL-208	ENST00000477216	MAGEB2	O15479	319 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SKIL-208	ENST00000477216	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	27.81	■■■□□ 2.04
SKIL-208	ENST00000477216	BMPR1A	P36894	532 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SKIL-208	ENST00000477216	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SKIL-208	ENST00000477216	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
SKIL-208	ENST00000477216	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
SKIL-208	ENST00000477216	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SKIL-208	ENST00000477216	XKR9	Q5GH70	373 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SKIL-208	ENST00000477216	FAM26D	Q5JW98	314 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SKIL-208	ENST00000477216	SPECC1	Q5M775	1068 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SKIL-208	ENST00000477216	HYI	Q5T013	277 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SKIL-208	ENST00000477216	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
SKIL-208	ENST00000477216	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
SKIL-208	ENST00000477216	PPME1	Q9Y570	386 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SKIL-208	ENST00000477216	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	27.8	■■■□□ 2.04
SKIL-208	ENST00000477216	SLC26A4	O43511	780 aa		27.8	■■■□□ 2.04
SKIL-208	ENST00000477216	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	27.8	■■■□□ 2.04
SKIL-208	ENST00000477216	SPATA32	Q96LK8	384 aa		27.8	■■■□□ 2.04
SKIL-208	ENST00000477216	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
SKIL-208	ENST00000477216	PNMA5	Q96PV4	448 aa		27.8	■■■□□ 2.04
SKIL-208	ENST00000477216	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		27.79	■■■□□ 2.04
SKIL-208	ENST00000477216	CUTA	O60888	179 aa		27.79	■■■□□ 2.04
SKIL-208	ENST00000477216	CTSH	P09668	335 aa		27.79	■■■□□ 2.04
SKIL-208	ENST00000477216	ME1	P48163	572 aa		27.79	■■■□□ 2.04
SKIL-208	ENST00000477216	RARRES1	P49788	294 aa		27.79	■■■□□ 2.04
SKIL-208	ENST00000477216	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		27.79	■■■□□ 2.04
SKIL-208	ENST00000477216	USP49	Q70CQ1	688 aa		27.79	■■■□□ 2.04
SKIL-208	ENST00000477216	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		27.79	■■■□□ 2.04
SKIL-208	ENST00000477216	EPSTI1	Q96J88	318 aa		27.79	■■■□□ 2.04
SKIL-208	ENST00000477216	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		27.79	■■■□□ 2.04
SKIL-208	ENST00000477216	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		27.79	■■■□□ 2.04
SKIL-208	ENST00000477216	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
SKIL-208	ENST00000477216	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04
SKIL-208	ENST00000477216	IRS1	P35568	1242 aa		27.78	■■■□□ 2.04
SKIL-208	ENST00000477216	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		27.78	■■■□□ 2.04
SKIL-208	ENST00000477216	METTL13	Q8N6R0	699 aa		27.78	■■■□□ 2.04
SKIL-208	ENST00000477216	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
SKIL-208	ENST00000477216	CALML4	Q96GE6	196 aa		27.78	■■■□□ 2.04
SKIL-208	ENST00000477216	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
SKIL-208	ENST00000477216	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		27.78	■■■□□ 2.04
SKIL-208	ENST00000477216	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		27.77	■■■□□ 2.04
SKIL-208	ENST00000477216	MBTPS2	O43462	519 aa		27.77	■■■□□ 2.04
SKIL-208	ENST00000477216	RFC5	P40937	340 aa		27.77	■■■□□ 2.04
SKIL-208	ENST00000477216	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		27.77	■■■□□ 2.04
SKIL-208	ENST00000477216	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
SKIL-208	ENST00000477216	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		27.77	■■■□□ 2.04
SKIL-208	ENST00000477216	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
SKIL-208	ENST00000477216	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		27.77	■■■□□ 2.04

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