RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475335.5

SIKE1-208, Transcript of suppressor of IKBKE 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIKE1, Length 470 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1-208ENST00000475335 PP2D1A8MPX8 630 aa23.41■■□□□ 1.34
SIKE1-208ENST00000475335 C5orf67F2Z3F1 127 aa23.41■■□□□ 1.34
SIKE1-208ENST00000475335 MUTP22033 750 aa23.41■■□□□ 1.34
SIKE1-208ENST00000475335 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP23.41■■□□□ 1.34
SIKE1-208ENST00000475335 ARL2P36404 184 aa23.41■■□□□ 1.34
SIKE1-208ENST00000475335 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
SIKE1-208ENST00000475335 HAUS3Q68CZ6 603 aa23.41■■□□□ 1.34
SIKE1-208ENST00000475335 ASAP3Q8TDY4 903 aa23.41■■□□□ 1.34
SIKE1-208ENST00000475335 NACC1Q96RE7 527 aa23.41■■□□□ 1.34
SIKE1-208ENST00000475335 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
SIKE1-208ENST00000475335 LRWD1Q9UFC0 647 aa23.41■■□□□ 1.34
SIKE1-208ENST00000475335 H3BNC9 293 aa23.4■■□□□ 1.34
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SIKE1-208ENST00000475335 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
SIKE1-208ENST00000475335 FAM102BQ5T8I3 360 aa23.4■■□□□ 1.34
SIKE1-208ENST00000475335 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
SIKE1-208ENST00000475335 ECHDC2Q86YB7 292 aa23.4■■□□□ 1.34
SIKE1-208ENST00000475335 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP23.4■■□□□ 1.34
SIKE1-208ENST00000475335 SLC17A8Q8NDX2 589 aa23.4■■□□□ 1.34
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SIKE1-208ENST00000475335 TRAIPQ9BWF2 469 aa23.4■■□□□ 1.34
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SIKE1-208ENST00000475335 LMCD1Q9NZU5 365 aa23.4■■□□□ 1.34
SIKE1-208ENST00000475335 LRFN2Q9ULH4 789 aa23.4■■□□□ 1.34
SIKE1-208ENST00000475335 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa23.4■■□□□ 1.34
SIKE1-208ENST00000475335 NLRC5Q86WI3 1866 aa23.4■■□□□ 1.34
SIKE1-208ENST00000475335 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
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SIKE1-208ENST00000475335 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
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SIKE1-208ENST00000475335 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
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SIKE1-208ENST00000475335 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
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SIKE1-208ENST00000475335 CTNNB1P35222 781 aa23.38■■□□□ 1.33
SIKE1-208ENST00000475335 BMPR1AP36894 532 aa23.38■■□□□ 1.33
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SIKE1-208ENST00000475335 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
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SIKE1-208ENST00000475335 HCSTQ9UBK5 93 aa23.37■■□□□ 1.33
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SIKE1-208ENST00000475335 KCNK18Q7Z418 384 aa23.35■■□□□ 1.33
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SIKE1-208ENST00000475335 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
SIKE1-208ENST00000475335 TMEM117Q9H0C3 514 aa23.35■■□□□ 1.33
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SIKE1-208ENST00000475335 KIAA1024Q9UPX6 916 aa23.35■■□□□ 1.33
SIKE1-208ENST00000475335 MTMR6Q9Y217 621 aa23.35■■□□□ 1.33
SIKE1-208ENST00000475335 STK24Q9Y6E0 443 aa23.35■■□□□ 1.33
SIKE1-208ENST00000475335 HYIQ5T013 277 aa23.34■■□□□ 1.33
SIKE1-208ENST00000475335 UBXN11Q5T124 520 aa23.34■■□□□ 1.33
SIKE1-208ENST00000475335 BSNDQ8WZ55 320 aa23.34■■□□□ 1.33
SIKE1-208ENST00000475335 PLVAPQ9BX97 442 aa23.34■■□□□ 1.33
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