RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470271.5

CTPS1-206, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-206ENST00000470271 FIBCD1Q8N539 461 aa22.14■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 SAMD11Q96NU1 681 aa22.14■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 C17orf80Q9BSJ5 609 aa22.14■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 FAM189BP81408 668 aa22.13■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 ECM1Q16610 540 aa22.13■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa22.13■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 RNF149Q8NC42 400 aa22.13■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 CHST12Q9NRB3 414 aa22.13■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 KIAA1024Q9UPX6 916 aa22.13■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 ARHGEF35A5YM69 484 aa22.12■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 VWA3AA6NCI4 1184 aa22.12■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 PP2D1A8MPX8 630 aa22.12■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 BMP15O95972 392 aa22.12■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 ARL2P36404 184 aa22.12■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 GRB10Q13322 594 aa22.12■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 TFDP1Q14186 410 aa22.12■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 CATSPER4Q7RTX7 472 aa22.12■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 MCPH1Q8NEM0 835 aa22.12■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 TMEM161AQ9NX61 479 aa22.12■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 DACT1Q9NYF0 836 aa22.12■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 MTMR6Q9Y217 621 aa22.12■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 CDC25AP30304 524 aa22.11■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 PHKA2P46019 1235 aa22.11■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 RESTQ13127 1097 aa22.11■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 EPC2Q52LR7 807 aa22.11■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 PADI6Q6TGC4 694 aa22.11■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 TMEM192Q8IY95 271 aa22.11■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 FBXO22Q8NEZ5 403 aa22.11■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 ASAP3Q8TDY4 903 aa22.11■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 GDPD5Q8WTR4 605 aa22.11■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 UNC80Q8N2C7 3258 aa22.11■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 STX6O43752 255 aa22.1■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 LPXNO60711 386 aa22.1■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 GLRA2P23416 452 aa22.1■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 POU5F1BQ06416 359 aa22.1■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 MAEAQ7L5Y9 396 aa22.1■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 ECHDC2Q86YB7 292 aa22.1■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 BHMT2Q9H2M3 363 aa22.1■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 MINDY3Q9H8M7 445 aa22.1■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 GPRC5CQ9NQ84 441 aa22.1■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 RWDD3Q9Y3V2 267 aa22.1■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 MTCH2Q9Y6C9 303 aa22.1■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 REV3LO60673 3130 aa22.1■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 A0A0C4DFX4 3053 aa22.1■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa22.09■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 NLRC5Q86WI3 1866 aa22.09■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 A0A0U1RQF3 1178 aa22.09■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 CYP11B2P19099 503 aa22.09■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 GATMP50440 423 aa22.09■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 PTENP60484 403 aa22.09■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 CAPSQ13938 189 aa22.09■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 FAM102BQ5T8I3 360 aa22.09■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa22.09■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 DNM3Q9UQ16 869 aa22.09■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 LINC00271P0C7V0 271 aa22.08■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 CTNNB1P35222 781 aa22.08■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 PPM1EQ8WY54 764 aa22.08■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 AK8Q96MA6 479 aa22.08■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 TRAIPQ9BWF2 469 aa22.08■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 TBKBP1A7MCY6 615 aa22.07■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 HOXA2O43364 376 aa22.07■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 EYA4O95677 639 aa22.07■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 EOMESO95936 686 aa22.07■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 RB1P06400 928 aa22.07■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 FGFR1P11362 822 aa22.07■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 BMPR1AP36894 532 aa22.07■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 FAM173BQ6P4H8 233 aa22.07■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 MICALL1Q8N3F8 863 aa22.07■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 RNF169Q8NCN4 708 aa22.07■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 NFKBIZQ9BYH8 718 aa22.07■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 LMCD1Q9NZU5 365 aa22.07■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 CLIC4Q9Y696 253 aa22.07■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 E9PMD0 336 aa22.06■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 C5orf67F2Z3F1 127 aa22.06■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 H3BNC9 293 aa22.06■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa22.06■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 ERLIN2O94905 339 aa22.06■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 SKIP12755 728 aa22.06■■□□□ 1.12
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