RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468807.1

TTC28-204, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene TTC28, Length 594 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-204ENST00000468807 CWH43Q9H720 699 aa24.4■■□□□ 1.5
TTC28-204ENST00000468807 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
TTC28-204ENST00000468807 DACT1Q9NYF0 836 aa24.4■■□□□ 1.5
TTC28-204ENST00000468807 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP24.39■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa24.39■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 SLFN12Q8IYM2 578 aa24.39■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 CASD1Q96PB1 797 aa24.39■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 LXNQ9BS40 222 aa24.39■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 TLR9Q9NR96 1032 aa24.39■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 TBX10O75333 385 aa24.38■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 CYP4A11Q02928 519 aa24.38■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 UBE3AQ05086 875 aa24.38■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 EPHA7Q15375 998 aa24.38■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 ZNF410Q86VK4 478 aa24.38■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 LRRC43Q8N309 656 aa24.38■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 HELQQ8TDG4 1101 aa24.38■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 DYDC2Q96IM9 177 aa24.38■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 RNF19AQ9NV58 838 aa24.38■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 RGL1Q9NZL6 768 aa24.38■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 A0A0U1RQF3 1178 aa24.37■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 BTBD18B2RXH4 712 aa24.37■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 PBX3P40426 434 aa24.37■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 ADAM15Q13444 863 aa24.37■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 LRRC55Q6ZSA7 311 aa24.37■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 CATSPER4Q7RTX7 472 aa24.37■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 TNFRSF25Q93038 417 aa24.37■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 TLE6Q9H808 572 aa24.37■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa24.37■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 CD207Q9UJ71 328 aa24.37■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 YWHABP31946 246 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 CALCRLQ16602 461 aa24.36■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 LONRF3Q496Y0 759 aa24.36■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 CLLU1OSQ5K130 101 aa24.36■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 OTUD6AQ7L8S5 288 aa24.36■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 TMEM143Q96AN5 459 aa24.36■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 CHST12Q9NRB3 414 aa24.36■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa24.36■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 PER2O15055 1255 aa24.35■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 EOMESO95936 686 aa24.35■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa24.35■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 RFC5P40937 340 aa24.35■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 ERVFC1P60507 584 aa24.35■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 XKR9Q5GH70 373 aa24.35■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 PLPP4Q5VZY2 271 aa24.35■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 KCNT2Q6UVM3 1135 aa24.35■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 TPH2Q8IWU9 490 aa24.35■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 C4orf19Q8IY42 314 aa24.35■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 EXOC8Q8IYI6 725 aa24.35■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 EFHBQ8N7U6 833 aa24.35■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 ZNF558Q96NG5 402 aa24.35■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa24.35■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 MBTPS2O43462 519 aa24.34■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 GUCY1B3Q02153 619 aa24.34■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa24.34■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 PCDHA12Q9UN75 941 aa24.34■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 ARID2Q68CP9 1835 aa24.33■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 FAM86C2PA6NEL3 165 aa24.33■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 NEMFO60524 1076 aa24.33■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 ATP2B1P20020 1258 aa24.33■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 PPM1AP35813 382 aa24.33■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 PHKA2P46019 1235 aa24.33■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 KRT17Q04695 432 aa24.33■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 ZP2Q05996 745 aa24.33■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 SPIRE1Q08AE8 756 aa24.33■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 ST3GAL1Q11201 340 aa24.33■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 EMC2Q15006 297 aa24.33■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 TMEM31Q5JXX7 168 aa24.33■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 CCDC83Q8IWF9 413 aa24.33■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 ADHFE1Q8IWW8 467 aa24.33■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 LPPQ93052 612 aa24.33■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 TCF25Q9BQ70 676 aa24.33■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 PRKAG3Q9UGI9 489 aa24.33■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa24.33■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 PPME1Q9Y570 386 aa24.33■■□□□ 1.49
TTC28-204ENST00000468807 ZBTB39O15060 712 aa24.32■■□□□ 1.48
TTC28-204ENST00000468807 SKIP12755 728 aa24.32■■□□□ 1.48
TTC28-204ENST00000468807 TXKP42681 527 aa24.32■■□□□ 1.48
TTC28-204ENST00000468807 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP24.32■■□□□ 1.48
TTC28-204ENST00000468807 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
TTC28-204ENST00000468807 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
TTC28-204ENST00000468807 MTRQ99707 1265 aa24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms