RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	19.72	■□□□□ 0.75
USP19-210	ENST00000465902	RNF149	Q8NC42	400 aa		19.72	■□□□□ 0.75
USP19-210	ENST00000465902	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		19.72	■□□□□ 0.75
USP19-210	ENST00000465902	LINC01599	Q8WXQ3	324 aa		19.72	■□□□□ 0.75
USP19-210	ENST00000465902	TOP1MT	Q969P6	601 aa		19.72	■□□□□ 0.75
USP19-210	ENST00000465902	YME1L1	Q96TA2	773 aa		19.72	■□□□□ 0.75
USP19-210	ENST00000465902	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	19.72	■□□□□ 0.75
USP19-210	ENST00000465902	MGEA5	O60502	916 aa		19.71	■□□□□ 0.75
USP19-210	ENST00000465902	FOSL2	P15408	326 aa		19.71	■□□□□ 0.75
USP19-210	ENST00000465902	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	19.71	■□□□□ 0.75
USP19-210	ENST00000465902	GRIN1	Q05586	938 aa		19.71	■□□□□ 0.75
USP19-210	ENST00000465902	TFDP1	Q14186	410 aa		19.71	■□□□□ 0.75
USP19-210	ENST00000465902	STK38	Q15208	465 aa		19.71	■□□□□ 0.75
USP19-210	ENST00000465902	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		19.71	■□□□□ 0.75
USP19-210	ENST00000465902	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	19.71	■□□□□ 0.75
USP19-210	ENST00000465902	CALML4	Q96GE6	196 aa		19.71	■□□□□ 0.75
USP19-210	ENST00000465902	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		19.71	■□□□□ 0.75
USP19-210	ENST00000465902	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	19.71	■□□□□ 0.75
USP19-210	ENST00000465902	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		19.71	■□□□□ 0.75
USP19-210	ENST00000465902	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		19.71	■□□□□ 0.75
USP19-210	ENST00000465902	INSL6	Q9Y581	213 aa		19.71	■□□□□ 0.75
USP19-210	ENST00000465902	MYH11	P35749	1972 aa		19.71	■□□□□ 0.75
USP19-210	ENST00000465902	LCHN	A4D1U4	455 aa		19.7	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	EYA4	O95677	639 aa		19.7	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	CYP11B2	P19099	503 aa		19.7	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	ARL2	P36404	184 aa		19.7	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	PHKA2	P46019	1235 aa		19.7	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	SPECC1	Q5M775	1068 aa		19.7	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		19.7	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	CSRNP2	Q9H175	543 aa		19.7	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	EYS	Q5T1H1	3165 aa		19.69	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	STAG3L1	P0CL83	205 aa		19.69	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	GRB10	Q13322	594 aa		19.69	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	SLC39A14	Q15043	492 aa		19.69	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		19.69	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	KCNK18	Q7Z418	384 aa		19.69	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		19.69	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	CLIC6	Q96NY7	704 aa		19.69	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	PNMA5	Q96PV4	448 aa		19.69	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	CERS4	Q9HA82	394 aa		19.69	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		19.69	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	POLD4	Q9HCU8	107 aa		19.69	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	RGS18	Q9NS28	235 aa		19.69	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		19.69	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	19.69	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		19.69	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	19.69	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		19.69	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		19.68	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		19.68	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		19.68	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	GLRA2	P23416	452 aa		19.68	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	19.68	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	CAPS	Q13938	189 aa		19.68	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	19.68	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		19.68	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	19.68	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	19.68	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	19.68	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		19.67	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	ERLIN2	O94905	339 aa		19.67	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	TXLNA	P40222	546 aa		19.67	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	19.67	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	TAP1	Q03518	808 aa		19.67	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	19.67	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	19.67	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	HYI	Q5T013	277 aa		19.67	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	19.67	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	RNF169	Q8NCN4	708 aa		19.67	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	EPSTI1	Q96J88	318 aa		19.67	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		19.67	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	DACT1	Q9NYF0	836 aa		19.67	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	SPTLC2	O15270	562 aa		19.66	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	SLC26A4	O43511	780 aa		19.66	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	ARHGEF15	O94989	841 aa		19.66	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	PLA2G4B	P0C869	781 aa		19.66	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	19.66	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	PTEN	P60484	403 aa		19.66	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	19.66	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	DSC3	Q14574	896 aa		19.66	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		19.66	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	19.66	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		19.66	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		19.66	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		19.66	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	IFT74	Q96LB3	600 aa		19.66	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	19.66	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		19.66	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		19.66	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		19.66	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		19.66	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	TCHH	Q07283	1943 aa		19.66	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902		C9IYK1	514 aa		19.65	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	DLL1	O00548	723 aa		19.65	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	PLCG1	P19174	1290 aa		19.65	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		19.65	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	19.65	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	19.65	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		19.65	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	USP49	Q70CQ1	688 aa		19.65	■□□□□ 0.74

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