RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460909.1

RPUSD3-210, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene RPUSD3, Length 578 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD3-210ENST00000460909 CRIPAKQ8N1N5 446 aa22.9■■□□□ 1.26
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RPUSD3-210ENST00000460909 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa22.9■■□□□ 1.26
RPUSD3-210ENST00000460909 MYOGP15173 224 aa22.89■■□□□ 1.25
RPUSD3-210ENST00000460909 FGFR4P22455 802 aa22.89■■□□□ 1.25
RPUSD3-210ENST00000460909 POU5F1BQ06416 359 aa22.89■■□□□ 1.25
RPUSD3-210ENST00000460909 CAPSQ13938 189 aa22.89■■□□□ 1.25
RPUSD3-210ENST00000460909 KARSQ15046 597 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
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RPUSD3-210ENST00000460909 MYOCDQ8IZQ8 938 aa22.89■■□□□ 1.25
RPUSD3-210ENST00000460909 RNF149Q8NC42 400 aa22.89■■□□□ 1.25
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RPUSD3-210ENST00000460909 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
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RPUSD3-210ENST00000460909 CHD7Q9P2D1 2997 aa22.89■■□□□ 1.25
RPUSD3-210ENST00000460909 SLC12A3P55017 1021 aa22.88■■□□□ 1.25
RPUSD3-210ENST00000460909 RAB30Q15771 203 aa22.88■■□□□ 1.25
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RPUSD3-210ENST00000460909 C1orf186Q6ZWK4 172 aa22.88■■□□□ 1.25
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RPUSD3-210ENST00000460909 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
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RPUSD3-210ENST00000460909 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
RPUSD3-210ENST00000460909 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa22.88■■□□□ 1.25
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RPUSD3-210ENST00000460909 FAM102BQ5T8I3 360 aa22.87■■□□□ 1.25
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RPUSD3-210ENST00000460909 CHAMP1Q96JM3 812 aa22.87■■□□□ 1.25
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RPUSD3-210ENST00000460909 RCOR1Q9UKL0 485 aa22.87■■□□□ 1.25
RPUSD3-210ENST00000460909 PLA2G4BP0C869 781 aa22.86■■□□□ 1.25
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RPUSD3-210ENST00000460909 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
RPUSD3-210ENST00000460909 FAM117BQ6P1L5 589 aa22.86■■□□□ 1.25
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RPUSD3-210ENST00000460909 CFAP45Q9UL16 551 aa22.86■■□□□ 1.25
RPUSD3-210ENST00000460909 C9IYK1 514 aa22.85■■□□□ 1.25
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RPUSD3-210ENST00000460909 UPP2O95045 317 aa22.85■■□□□ 1.25
RPUSD3-210ENST00000460909 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP22.85■■□□□ 1.25
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RPUSD3-210ENST00000460909 ARHGEF15O94989 841 aa22.84■■□□□ 1.25
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RPUSD3-210ENST00000460909 C1orf112Q9NSG2 853 aa22.84■■□□□ 1.25
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RPUSD3-210ENST00000460909 CCDC39Q9UFE4 941 aa22.83■■□□□ 1.25
RPUSD3-210ENST00000460909 INSL6Q9Y581 213 aa22.83■■□□□ 1.25
RPUSD3-210ENST00000460909 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP22.82■■□□□ 1.24
RPUSD3-210ENST00000460909 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
RPUSD3-210ENST00000460909 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
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RPUSD3-210ENST00000460909 AMHR2Q16671 573 aa22.82■■□□□ 1.24
RPUSD3-210ENST00000460909 ZNF697Q5TEC3 545 aa22.82■■□□□ 1.24
RPUSD3-210ENST00000460909 SHC4Q6S5L8 630 aa22.82■■□□□ 1.24
RPUSD3-210ENST00000460909 NPAS4Q8IUM7 802 aa22.82■■□□□ 1.24
RPUSD3-210ENST00000460909 RASSF8Q8NHQ8 419 aa22.82■■□□□ 1.24
RPUSD3-210ENST00000460909 TIPINQ9BVW5 301 aa22.82■■□□□ 1.24
RPUSD3-210ENST00000460909 TRAIPQ9BWF2 469 aa22.82■■□□□ 1.24
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