RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440835.6

PTPRR-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 2,818 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-204ENST00000440835 RAB27AP51159 221 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP6.75□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 GALNT17Q6IS24 598 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 THNSL1Q8IYQ7 743 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 KCNB2Q92953 911 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 RIPOR3Q96MK2 946 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 KIF2CQ99661 725 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 S1PR5Q9H228 398 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 CWH43Q9H720 699 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 USTQ9Y2C2 406 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 KIF3AQ9Y496 699 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 IRAK3Q9Y616 596 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 EVPLQ92817 2033 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 TBKBP1A7MCY6 615 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 SLFN14P0C7P3 912 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 ARP10275 920 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 DNAJB1P25685 340 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 MOXD1Q6UVY6 613 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF410Q86VK4 478 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 GPR65Q8IYL9 337 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 ABI1Q8IZP0 508 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 PIBF1Q8WXW3 757 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 PBXIP1Q96AQ6 731 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 ZBTB9Q96C00 473 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF577Q9BSK1 485 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 MYL10Q9BUA6 226 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 IGFLR1Q9H665 355 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 LMBRD1Q9NUN5 540 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 DPP7Q9UHL4 492 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 MUTYHQ9UIF7 546 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 GOLGA8AA7E2F4 631 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 GOLGA8BA8MQT2 603 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 ZBTB42B2RXF5 422 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 GLP2RO95838 553 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 CCNE2O96020 404 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 CES5AQ6NT32 575 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 FAM228AQ86W67 206 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 MICU3Q86XE3 530 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 ANKRD7Q92527 254 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 TAF6LQ9Y6J9 622 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 DENND4AQ7Z401 1863 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 A0A0U1RQF3 1178 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 LINC01565O15544 149 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 DNM2P50570 870 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 MCTP1Q6DN14 999 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 KCNT2Q6UVM3 1135 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 ECHDC2Q86YB7 292 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 CASD1Q96PB1 797 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 ADAM7Q9H2U9 754 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 ADAMTS10Q9H324 1103 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 TMEM260Q9NX78 707 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 TELO2Q9Y4R8 837 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 V9GY48 417 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 GOLGA6L22H0YM25 854 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 GAS2O43903 313 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 OATP04181 439 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 CYP3A7P24462 503 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 SWSAP1Q6NVH7 229 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 CKAP2LQ8IYA6 745 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 GPT2Q8TD30 523 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 HDAC7Q8WUI4 952 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 SORCS3Q9UPU3 1222 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 TULP2O00295 520 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 MGEA5O60502 916 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF623O75123 536 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 PAPLNO95428 1278 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 DARSP14868 501 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP6.73□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 PSMA5P28066 241 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 EVCP57679 992 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 MTMR3Q13615 1198 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP6.73□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 Q4G0T1 1027 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 KIAA1841Q6NSI8 718 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 SLC39A11Q8N1S5 342 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRR-204ENST00000440835 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.3 ms