RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439890.3

NANOGP9-201, Transcript of Nanog homeobox pseudogene 9, humanhuman

BASIC

Gene NANOGP9, Length 892 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP9-201ENST00000439890 KRTAP10-2P60368 255 aa7.24□□□□□ -1.25
NANOGP9-201ENST00000439890 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
NANOGP9-201ENST00000439890 SPATC1Q76KD6 591 aa7.24□□□□□ -1.25
NANOGP9-201ENST00000439890 TTLL11Q8NHH1 800 aa7.24□□□□□ -1.25
NANOGP9-201ENST00000439890 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
NANOGP9-201ENST00000439890 CLEC4DQ8WXI8 215 aa7.24□□□□□ -1.25
NANOGP9-201ENST00000439890 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
NANOGP9-201ENST00000439890 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
NANOGP9-201ENST00000439890 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
NANOGP9-201ENST00000439890 IPPKQ9H8X2 491 aa7.24□□□□□ -1.25
NANOGP9-201ENST00000439890 PODXL2Q9NZ53 605 aa7.24□□□□□ -1.25
NANOGP9-201ENST00000439890 ZDHHC9Q9Y397 364 aa7.24□□□□□ -1.25
NANOGP9-201ENST00000439890 TRAF6Q9Y4K3 522 aa7.24□□□□□ -1.25
NANOGP9-201ENST00000439890 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa7.24□□□□□ -1.25
NANOGP9-201ENST00000439890 CRB1P82279 1406 aa7.24□□□□□ -1.25
NANOGP9-201ENST00000439890 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
NANOGP9-201ENST00000439890 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
NANOGP9-201ENST00000439890 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
NANOGP9-201ENST00000439890 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP7.23□□□□□ -1.25
NANOGP9-201ENST00000439890 LAMTOR5O43504 91 aa7.23□□□□□ -1.25
NANOGP9-201ENST00000439890 INSRRP14616 1297 aa7.23□□□□□ -1.25
NANOGP9-201ENST00000439890 GLRBP48167 497 aa7.23□□□□□ -1.25
NANOGP9-201ENST00000439890 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
NANOGP9-201ENST00000439890 DCTN1Q14203 1278 aa7.23□□□□□ -1.25
NANOGP9-201ENST00000439890 SURF1Q15526 300 aa7.23□□□□□ -1.25
NANOGP9-201ENST00000439890 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
NANOGP9-201ENST00000439890 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
NANOGP9-201ENST00000439890 C1orf141Q5JVX7 400 aa7.23□□□□□ -1.25
NANOGP9-201ENST00000439890 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
NANOGP9-201ENST00000439890 MCM10Q7L590 875 aa7.23□□□□□ -1.25
NANOGP9-201ENST00000439890 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
NANOGP9-201ENST00000439890 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
NANOGP9-201ENST00000439890 DLL4Q9NR61 685 aa7.23□□□□□ -1.25
NANOGP9-201ENST00000439890 IGSF5Q9NSI5 407 aa7.23□□□□□ -1.25
NANOGP9-201ENST00000439890 JAG2Q9Y219 1238 aa7.23□□□□□ -1.25
NANOGP9-201ENST00000439890 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
NANOGP9-201ENST00000439890 PKD1L3Q7Z443 1732 aa7.23□□□□□ -1.25
NANOGP9-201ENST00000439890 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa7.22□□□□□ -1.25
NANOGP9-201ENST00000439890 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa7.22□□□□□ -1.25
NANOGP9-201ENST00000439890 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
NANOGP9-201ENST00000439890 BCAR3O75815 825 aa7.22□□□□□ -1.25
NANOGP9-201ENST00000439890 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
NANOGP9-201ENST00000439890 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP7.22□□□□□ -1.25
NANOGP9-201ENST00000439890 EVA1CP58658 441 aa7.22□□□□□ -1.25
NANOGP9-201ENST00000439890 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP7.22□□□□□ -1.25
NANOGP9-201ENST00000439890 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
NANOGP9-201ENST00000439890 EP400NLQ6ZTU2 488 aa7.22□□□□□ -1.25
NANOGP9-201ENST00000439890 LIMS2Q7Z4I7 341 aa7.22□□□□□ -1.25
NANOGP9-201ENST00000439890 GGNQ86UU5 652 aa7.22□□□□□ -1.25
NANOGP9-201ENST00000439890 KBTBD2Q8IY47 623 aa7.22□□□□□ -1.25
NANOGP9-201ENST00000439890 IL17REQ8NFR9 667 aa7.22□□□□□ -1.25
NANOGP9-201ENST00000439890 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
NANOGP9-201ENST00000439890 C8orf49Q96NF6 230 aa7.22□□□□□ -1.25
NANOGP9-201ENST00000439890 CHMP4AQ9BY43 222 aa7.22□□□□□ -1.25
NANOGP9-201ENST00000439890 CD244Q9BZW8 370 aa7.22□□□□□ -1.25
NANOGP9-201ENST00000439890 CACNA1FO60840 1977 aa7.22□□□□□ -1.25
NANOGP9-201ENST00000439890 KIF16BQ96L93 1317 aa7.22□□□□□ -1.25
NANOGP9-201ENST00000439890 SCN11AQ9UI33 1791 aa7.21□□□□□ -1.25
NANOGP9-201ENST00000439890 AQP7O14520 342 aa7.21□□□□□ -1.26
NANOGP9-201ENST00000439890 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
NANOGP9-201ENST00000439890 B4GALT3O60512 393 aa7.21□□□□□ -1.26
NANOGP9-201ENST00000439890 FAHP16930 419 aa7.21□□□□□ -1.26
NANOGP9-201ENST00000439890 CANXP27824 592 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
NANOGP9-201ENST00000439890 SKIDA1Q1XH10 827 aa7.21□□□□□ -1.26
NANOGP9-201ENST00000439890 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
NANOGP9-201ENST00000439890 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa7.21□□□□□ -1.26
NANOGP9-201ENST00000439890 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa7.21□□□□□ -1.26
NANOGP9-201ENST00000439890 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa7.21□□□□□ -1.26
NANOGP9-201ENST00000439890 KCTD1Q719H9 257 aa7.21□□□□□ -1.26
NANOGP9-201ENST00000439890 IFNL2Q8IZJ0 200 aa7.21□□□□□ -1.26
NANOGP9-201ENST00000439890 DTX3Q8N9I9 347 aa7.21□□□□□ -1.26
NANOGP9-201ENST00000439890 SMC4Q9NTJ3 1288 aa7.21□□□□□ -1.26
NANOGP9-201ENST00000439890 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa7.21□□□□□ -1.26
NANOGP9-201ENST00000439890 TSPYL4Q9UJ04 414 aa7.21□□□□□ -1.26
NANOGP9-201ENST00000439890 ZFP69BQ9UJL9 534 aa7.21□□□□□ -1.26
NANOGP9-201ENST00000439890 WASF3Q9UPY6 502 aa7.21□□□□□ -1.26
NANOGP9-201ENST00000439890 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa7.2□□□□□ -1.26
NANOGP9-201ENST00000439890 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa7.2□□□□□ -1.26
NANOGP9-201ENST00000439890 RNMTO43148 476 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
NANOGP9-201ENST00000439890 PLIN1O60240 522 aa7.2□□□□□ -1.26
NANOGP9-201ENST00000439890 CKMP06732 381 aa7.2□□□□□ -1.26
NANOGP9-201ENST00000439890 IL2RBP14784 551 aa7.2□□□□□ -1.26
NANOGP9-201ENST00000439890 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
NANOGP9-201ENST00000439890 ADAM17P78536 824 aa7.2□□□□□ -1.26
NANOGP9-201ENST00000439890 TEFQ10587 303 aa7.2□□□□□ -1.26
NANOGP9-201ENST00000439890 PAK1Q13153 545 aa7.2□□□□□ -1.26
NANOGP9-201ENST00000439890 RASGRF1Q13972 1273 aa7.2□□□□□ -1.26
NANOGP9-201ENST00000439890 SCUBE1Q8IWY4 988 aa7.2□□□□□ -1.26
NANOGP9-201ENST00000439890 KLHL36Q8N4N3 616 aa7.2□□□□□ -1.26
NANOGP9-201ENST00000439890 SSH1Q8WYL5 1049 aa7.2□□□□□ -1.26
NANOGP9-201ENST00000439890 ARHGAP45Q92619 1136 aa7.2□□□□□ -1.26
NANOGP9-201ENST00000439890 SAMD11Q96NU1 681 aa7.2□□□□□ -1.26
NANOGP9-201ENST00000439890 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP7.2□□□□□ -1.26
NANOGP9-201ENST00000439890 CATSPERZQ9NTU4 200 aa7.2□□□□□ -1.26
NANOGP9-201ENST00000439890 MSRB2Q9Y3D2 182 aa7.2□□□□□ -1.26
NANOGP9-201ENST00000439890 NWD2Q9ULI1 1742 aa7.2□□□□□ -1.26
NANOGP9-201ENST00000439890 MEGF6O75095 1541 aa7.2□□□□□ -1.26
NANOGP9-201ENST00000439890 JCADQ9P266 1359 aa7.2□□□□□ -1.26
NANOGP9-201ENST00000439890 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
NANOGP9-201ENST00000439890 KDM3BQ7LBC6 1761 aa7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms