RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430766.1

PTPRD-AS1-201, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRD-AS1, Length 1,959 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RGS18Q9NS28 235 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TMEM161AQ9NX61 479 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DPP7Q9UHL4 492 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ADSSP30520 456 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC24A5Q71RS6 500 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FAM3CQ92520 227 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ARID3AQ99856 593 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MRVI1Q9Y6F6 885 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MGEA5O60502 916 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RFPL2O75678 378 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RHOBTB1O94844 696 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HOXC13P31276 330 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP10.06□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ELF2Q15723 593 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 STXBP2Q15833 593 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GMCL1Q96IK5 515 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TRIM4Q9C037 500 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PIDD1Q9HB75 910 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LRBAP50851 2863 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TERTO14746 1132 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CNPP09543 421 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CCDC158Q5M9N0 1113 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DNAJB3Q8WWF6 145 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KXD1Q9BQD3 176 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C2orf42Q9NWW7 574 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HOXA2O43364 376 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FSHRP23945 695 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP10.05□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IRX4P78413 519 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FAM189BP81408 668 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LMAN2Q12907 356 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RNF19AQ9NV58 838 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TRABD2BA6NFA1 517 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FTH1P19P0C7X4 201 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RHDQ02161 417 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LRRC32Q14392 662 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IER5Q5VY09 327 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HDAC7Q8WUI4 952 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IWS1Q96ST2 819 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NT5C3AQ9H0P0 336 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TRPV2Q9Y5S1 764 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FRMPD4Q14CM0 1322 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PATE3B3GLJ2 98 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GGPS1O95749 300 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF280BQ86YH2 543 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 AMOTL1Q8IY63 956 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ADAM2Q99965 735 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CCDC171Q6TFL3 1326 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ECI2O75521 394 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RASA1P20936 1047 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC1A4P43007 532 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BCAR1P56945 870 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DENND3A2RUS2 1198 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TTLL1O95922 423 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF710Q8N1W2 664 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LCORLQ8N3X6 602 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PNPLA1Q8N8W4 532 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FGF13Q92913 245 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PRKD2Q9BZL6 878 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MKNK2Q9HBH9 465 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MTMR4Q9NYA4 1195 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NAV3Q8IVL0 2385 aa10.02□□□□□ -0.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PI4KAP42356 2102 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 F8P00451 2351 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CARNS1A5YM72 827 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SORBS3O60504 671 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CAMK2BQ13554 666 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KCNV1Q6PIU1 500 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 Q6ZS52 159 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.5 ms