RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428678.1

UPK3BP1-201, Transcript of uroplakin 3B pseudogene 1, humanhuman

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Gene UPK3BP1, Length 509 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BP1-201ENST00000428678 RASEFQ8IZ41 740 aa20.67■□□□□ 0.9
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UPK3BP1-201ENST00000428678 DACT1Q9NYF0 836 aa20.67■□□□□ 0.9
UPK3BP1-201ENST00000428678 PLXNA3P51805 1871 aa20.67■□□□□ 0.9
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UPK3BP1-201ENST00000428678 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
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UPK3BP1-201ENST00000428678 DNM2P50570 870 aa20.6■□□□□ 0.89
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UPK3BP1-201ENST00000428678 NOMO2Q5JPE7 1267 aa20.6■□□□□ 0.89
UPK3BP1-201ENST00000428678 MIER3Q7Z3K6 550 aa20.6■□□□□ 0.89
UPK3BP1-201ENST00000428678 SLC22A17Q8WUG5 538 aa20.6■□□□□ 0.89
UPK3BP1-201ENST00000428678 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
UPK3BP1-201ENST00000428678 SH2D3AQ9BRG2 576 aa20.6■□□□□ 0.89
UPK3BP1-201ENST00000428678 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa20.6■□□□□ 0.89
UPK3BP1-201ENST00000428678 TBC1D13Q9NVG8 400 aa20.6■□□□□ 0.89
UPK3BP1-201ENST00000428678 VPS54Q9P1Q0 977 aa20.6■□□□□ 0.89
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UPK3BP1-201ENST00000428678 PRR23AA6NEV1 266 aa20.59■□□□□ 0.89
UPK3BP1-201ENST00000428678 EDIL3O43854 480 aa20.59■□□□□ 0.89
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