RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427658.1

AFG3L1P-208, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, human

TSL 2

Gene AFG3L1P, Length 2,758 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AFG3L1P-208	ENST00000427658	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CGB2	Q6NT52	195 aa		11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TAF4B	Q92750	862 aa		11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DYDC2	Q96IM9	177 aa		11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CATSPER2	Q96P56	530 aa		11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LRRC53	A6NM62	1247 aa		11.27	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ATP5H	O75947	161 aa		11.27	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SERPINB3	P29508	390 aa		11.27	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		11.27	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		11.27	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		11.27	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TTI2	Q6NXR4	508 aa		11.27	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		11.27	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		11.27	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		11.27	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SEC14L1	Q92503	715 aa		11.27	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		11.27	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZNF180	Q9UJW8	692 aa		11.27	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		11.27	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZNF711	Q9Y462	761 aa		11.27	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	WNT7A	O00755	349 aa		11.27	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	BCR	P11274	1271 aa		11.27	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IDO1	P14902	403 aa		11.27	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CD97	P48960	835 aa		11.27	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CDK7	P50613	346 aa		11.27	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GSTM4	Q03013	218 aa		11.27	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KCNMA1	Q12791	1236 aa		11.27	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RPS6KA1	Q15418	735 aa		11.27	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GSTA3	Q16772	222 aa		11.27	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DENND2C	Q68D51	928 aa		11.27	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LRRC74B	Q6ZQY2	392 aa		11.27	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		11.27	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		11.27	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ERP27	Q96DN0	273 aa		11.27	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MYD88	Q99836	296 aa		11.27	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		11.27	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		11.27	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		11.27	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		11.27	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658		A0A087WZG4	1122 aa		11.26	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRIT1	O00522	736 aa		11.26	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RPS6KA4	O75676	772 aa		11.26	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	T-ENOL	P0DO92	83 aa		11.26	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PMS2	P54278	862 aa		11.26	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TCIRG1	Q13488	830 aa		11.26	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GCKR	Q14397	625 aa		11.26	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PTPRO	Q16827	1216 aa		11.26	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		11.26	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KLC3	Q6P597	504 aa		11.26	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		11.26	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PDCD7	Q8N8D1	485 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NEK9	Q8TD19	979 aa		11.26	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		11.26	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	EPS8L3	Q8TE67	593 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	INPP5D	Q92835	1189 aa		11.26	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	11.26	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PFDN4	Q9NQP4	134 aa		11.26	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	11.26	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		11.26	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CAPN9	O14815	690 aa		11.26	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TBX10	O75333	385 aa		11.26	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	POTEJ	P0CG39	1038 aa		11.26	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CREB1	P16220	341 aa		11.26	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GALK1	P51570	392 aa		11.26	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NEK3	P51956	506 aa		11.26	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TIMM10	P62072	90 aa		11.26	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GPSM2	P81274	684 aa		11.26	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	11.26	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		11.26	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LRRC43	Q8N309	656 aa		11.26	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	WASF1	Q92558	559 aa		11.26	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ABHD8	Q96I13	439 aa		11.26	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GOLPH3	Q9H4A6	298 aa		11.26	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		11.26	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	STK32B	Q9NY57	414 aa		11.26	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	UTP11	Q9Y3A2	253 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HTR3E	A5X5Y0	456 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRT36	O76013	467 aa		11.25	□□□□□ -0.61

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms