RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VPS54Q9P1Q0 977 aa14.85□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DMDP11532 3685 aa14.84□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EDIL3O43854 480 aa14.84□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AVPR2P30518 371 aa14.84□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CA8P35219 290 aa14.84□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ITIH3Q06033 890 aa14.84□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DRP2Q13474 957 aa14.84□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NTRK3Q16288 839 aa14.84□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRCH2Q5VUJ6 765 aa14.84□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CES5AQ6NT32 575 aa14.84□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCNB2Q92953 911 aa14.84□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC136Q96JN2 1154 aa14.84□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADAM7Q9H2U9 754 aa14.84□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POMKQ9H5K3 350 aa14.84□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C2CD4DB7Z1M9 353 aa14.83□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa14.83□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 USP11P51784 963 aa14.83□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BCAR1P56945 870 aa14.83□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa14.83□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FBXL16Q8N461 479 aa14.83□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KREMEN2Q8NCW0 462 aa14.83□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RDM1Q8NG50 284 aa14.83□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RSPH1Q8WYR4 309 aa14.83□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GJA10Q969M2 543 aa14.83□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM169Q96HH4 297 aa14.83□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RIPOR3Q96MK2 946 aa14.83□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC26A6Q9BXS9 759 aa14.83□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AGXT2Q9BYV1 514 aa14.83□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZBP1Q9H171 429 aa14.83□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHST12Q9NRB3 414 aa14.83□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM86C1Q9NVL1 165 aa14.83□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SORCS3Q9UPU3 1222 aa14.83□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IFNAR1P17181 557 aa14.82□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP14.82□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PHKA2P46019 1235 aa14.82□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MTMR3Q13615 1198 aa14.82□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MTERF2Q49AM1 385 aa14.82□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MIER3Q7Z3K6 550 aa14.82□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa14.82□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SNX14Q9Y5W7 946 aa14.82□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DENND4AQ7Z401 1863 aa14.82□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CACNA1HO95180 2353 aa14.82□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A087WZ62 844 aa14.82□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa14.82□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ST18O60284 1047 aa14.82□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP14.82□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PSMD10O75832 226 aa14.82□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BRD1O95696 1058 aa14.82□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPS6KB1P23443 525 aa14.82□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HSPA4P34932 840 aa14.82□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MTHFRP42898 656 aa14.82□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NUBP1P53384 320 aa14.82□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDC42EP1Q00587 391 aa14.82□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 Q4G0T1 1027 aa14.82□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 XKR3Q5GH77 459 aa14.82□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UBALD2Q8IYN6 164 aa14.82□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VPS52Q8N1B4 723 aa14.82□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TBCKQ8TEA7 893 aa14.82□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CEP89Q96ST8 783 aa14.82□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRAIPQ9BWF2 469 aa14.82□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SH3GLB2Q9NR46 395 aa14.82□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DZANK1Q9NVP4 752 aa14.82□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CARNS1A5YM72 827 aa14.81□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM150BA6NC51 233 aa14.81□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CXCL14O95715 111 aa14.81□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NLRP5P59047 1200 aa14.81□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIAA1841Q6NSI8 718 aa14.81□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 B3GNT9Q6UX72 402 aa14.81□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF410Q86VK4 478 aa14.81□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AUTS2Q8WXX7 1259 aa14.81□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LPPQ93052 612 aa14.81□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SH2D3AQ9BRG2 576 aa14.81□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C22orf23Q9BZE7 217 aa14.81□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IRAK3Q9Y616 596 aa14.81□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLXNA3P51805 1871 aa14.81□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GFRA3O60609 400 aa14.8□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STBD1O95210 358 aa14.8□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TDP2O95551 362 aa14.8□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WEE2P0C1S8 567 aa14.8□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CTSAP10619 480 aa14.8□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SKIP12755 728 aa14.8□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DNM2P50570 870 aa14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms