RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa22.15■■□□□ 1.14
ODC1-202ENST00000405333 UBE4BO95155 1302 aa22.15■■□□□ 1.14
ODC1-202ENST00000405333 FKTNO75072 461 aa22.14■■□□□ 1.14
ODC1-202ENST00000405333 NR3C1P04150 777 aa22.14■■□□□ 1.14
ODC1-202ENST00000405333 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
ODC1-202ENST00000405333 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
ODC1-202ENST00000405333 SYCP3Q8IZU3 236 aa22.14■■□□□ 1.14
ODC1-202ENST00000405333 IFT74Q96LB3 600 aa22.14■■□□□ 1.14
ODC1-202ENST00000405333 GBP3Q9H0R5 595 aa22.14■■□□□ 1.14
ODC1-202ENST00000405333 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
ODC1-202ENST00000405333 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa22.14■■□□□ 1.14
ODC1-202ENST00000405333 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
ODC1-202ENST00000405333 TBX20Q9UMR3 447 aa22.14■■□□□ 1.14
ODC1-202ENST00000405333 LRRIQ4A6NIV6 560 aa22.14■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa22.14■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 F2P00734 622 aa22.14■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 MYL3P08590 195 aa22.14■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 KLRC1P26715 233 aa22.14■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 CASP4P49662 377 aa22.14■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 SPAG1Q07617 926 aa22.14■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 CAPSQ13938 189 aa22.14■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 EFCAB12Q6NXP0 572 aa22.14■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa22.14■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa22.14■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa22.14■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 Q9Y3F1 56 aa22.14■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 N4BP3O15049 544 aa22.13■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 CBFA2T2O43439 604 aa22.13■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 CALUO43852 315 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 PTMAP06454 111 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 HOXD10P28358 340 aa22.13■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 CPT1AP50416 773 aa22.13■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 KIAA0753Q2KHM9 967 aa22.13■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 MARCH8Q5T0T0 291 aa22.13■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 TMC6Q7Z403 805 aa22.13■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa22.13■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 RAET1EQ8TD07 263 aa22.13■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 SAGE1Q9NXZ1 904 aa22.13■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 SEPT4O43236 478 aa22.12■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 PPFIA1Q13136 1202 aa22.12■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 ZNF484Q5JVG2 852 aa22.12■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 MIIPQ5JXC2 388 aa22.12■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 FAM114A1Q8IWE2 563 aa22.12■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 ERO1AQ96HE7 468 aa22.12■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 ACCSQ96QU6 501 aa22.12■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 CTAGE1Q96RT6 745 aa22.12■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 SETD4Q9NVD3 440 aa22.12■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 PPME1Q9Y570 386 aa22.12■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 AKAP3O75969 853 aa22.12■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa22.12■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 ALCAMQ13740 583 aa22.12■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 HIC1Q14526 733 aa22.12■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 ARID5BQ14865 1188 aa22.12■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 GRIK4Q16099 956 aa22.12■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 VSTM4Q8IW00 320 aa22.12■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa22.12■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 CEP63Q96MT8 703 aa22.12■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 SIP14410 1827 aa22.11■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 ANKRD63C9JTQ0 380 aa22.11■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 PES1O00541 588 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 EDN1P05305 212 aa22.11■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa22.11■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 NAMPTP43490 491 aa22.11■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 CYP2J2P51589 502 aa22.11■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 IER5Q5VY09 327 aa22.11■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 CEP135Q66GS9 1140 aa22.11■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 CCDC186Q7Z3E2 898 aa22.11■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 RHPN2Q8IUC4 686 aa22.11■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 MAP4K3Q8IVH8 894 aa22.11■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa22.11■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 PPP1R16BQ96T49 567 aa22.11■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 CBWD1Q9BRT8 395 aa22.11■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 PCIF1Q9H4Z3 704 aa22.11■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 CETN3O15182 167 aa22.1■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 HMGCRP04035 888 aa22.1■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa22.1■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa22.1■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 HSPA6P17066 643 aa22.1■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 MFSD10Q14728 455 aa22.1■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 CCDC40Q4G0X9 1142 aa22.1■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 GNASQ5JWF2 1037 aa22.1■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 SLC39A4Q6P5W5 647 aa22.1■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 MTHFD1LQ6UB35 978 aa22.1■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 HS2ST1Q7LGA3 356 aa22.1■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 LMBR1Q8WVP7 490 aa22.1■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 TMEM206Q9H813 350 aa22.1■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 GJA9P57773 515 aa22.1■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 PURAQ00577 322 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 SLC17A8Q8NDX2 589 aa22.1■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 DEPTORQ8TB45 409 aa22.1■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.7 ms