RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397396.5

TSPAN4-202, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TSPAN4, Length 1,332 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-202ENST00000397396 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa25.98■■□□□ 1.75
TSPAN4-202ENST00000397396 C2orf40Q9H1Z8 148 aa25.98■■□□□ 1.75
TSPAN4-202ENST00000397396 STARD7Q9NQZ5 370 aa25.98■■□□□ 1.75
TSPAN4-202ENST00000397396 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
TSPAN4-202ENST00000397396 SMTNL1A8MU46 457 aa25.97■■□□□ 1.75
TSPAN4-202ENST00000397396 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa25.97■■□□□ 1.75
TSPAN4-202ENST00000397396 GLRA2P23416 452 aa25.97■■□□□ 1.75
TSPAN4-202ENST00000397396 POU5F1BQ06416 359 aa25.97■■□□□ 1.75
TSPAN4-202ENST00000397396 ITGA7Q13683 1181 aa25.97■■□□□ 1.75
TSPAN4-202ENST00000397396 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
TSPAN4-202ENST00000397396 FOXR2Q6PJQ5 311 aa25.97■■□□□ 1.75
TSPAN4-202ENST00000397396 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
TSPAN4-202ENST00000397396 DEPTORQ8TB45 409 aa25.97■■□□□ 1.75
TSPAN4-202ENST00000397396 HPS3Q969F9 1004 aa25.97■■□□□ 1.75
TSPAN4-202ENST00000397396 RWDD2AQ9UIY3 292 aa25.97■■□□□ 1.75
TSPAN4-202ENST00000397396 AKT3Q9Y243 479 aa25.97■■□□□ 1.75
TSPAN4-202ENST00000397396 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
TSPAN4-202ENST00000397396 A0A1W2PQY0 241 aa25.96■■□□□ 1.75
TSPAN4-202ENST00000397396 SGPL1O95470 568 aa25.96■■□□□ 1.75
TSPAN4-202ENST00000397396 MYCP01106 439 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
TSPAN4-202ENST00000397396 CYP2C9P11712 490 aa25.96■■□□□ 1.75
TSPAN4-202ENST00000397396 CLCN3P51790 818 aa25.96■■□□□ 1.75
TSPAN4-202ENST00000397396 SOX10P56693 466 aa25.96■■□□□ 1.75
TSPAN4-202ENST00000397396 HAUS6Q7Z4H7 955 aa25.96■■□□□ 1.75
TSPAN4-202ENST00000397396 ANKLE1Q8NAG6 615 aa25.96■■□□□ 1.75
TSPAN4-202ENST00000397396 ASAP3Q8TDY4 903 aa25.96■■□□□ 1.75
TSPAN4-202ENST00000397396 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
TSPAN4-202ENST00000397396 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
TSPAN4-202ENST00000397396 TSG101Q99816 390 aa25.96■■□□□ 1.75
TSPAN4-202ENST00000397396 TMEM206Q9H813 350 aa25.96■■□□□ 1.75
TSPAN4-202ENST00000397396 POLD4Q9HCU8 107 aa25.96■■□□□ 1.75
TSPAN4-202ENST00000397396 EXOC7Q9UPT5 735 aa25.96■■□□□ 1.75
TSPAN4-202ENST00000397396 LRRIQ4A6NIV6 560 aa25.95■■□□□ 1.75
TSPAN4-202ENST00000397396 BECN2A8MW95 431 aa25.95■■□□□ 1.75
TSPAN4-202ENST00000397396 NMT1P30419 496 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.75
TSPAN4-202ENST00000397396 EFNA5P52803 228 aa25.95■■□□□ 1.75
TSPAN4-202ENST00000397396 TPM4P67936 248 aa25.95■■□□□ 1.75
TSPAN4-202ENST00000397396 GTF2BQ00403 316 aa25.95■■□□□ 1.75
TSPAN4-202ENST00000397396 MYL5Q02045 173 aa25.95■■□□□ 1.75
TSPAN4-202ENST00000397396 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa25.95■■□□□ 1.75
TSPAN4-202ENST00000397396 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.75
TSPAN4-202ENST00000397396 KLHL10Q6JEL2 608 aa25.95■■□□□ 1.75
TSPAN4-202ENST00000397396 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa25.95■■□□□ 1.75
TSPAN4-202ENST00000397396 RSPH3Q86UC2 560 aa25.95■■□□□ 1.75
TSPAN4-202ENST00000397396 RHPN2Q8IUC4 686 aa25.95■■□□□ 1.75
TSPAN4-202ENST00000397396 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa25.95■■□□□ 1.75
TSPAN4-202ENST00000397396 NME8Q8N427 588 aa25.95■■□□□ 1.75
TSPAN4-202ENST00000397396 ZNF507Q8TCN5 953 aa25.95■■□□□ 1.75
TSPAN4-202ENST00000397396 SCFD1Q8WVM8 642 aa25.95■■□□□ 1.75
TSPAN4-202ENST00000397396 BSNDQ8WZ55 320 aa25.95■■□□□ 1.75
TSPAN4-202ENST00000397396 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa25.95■■□□□ 1.75
TSPAN4-202ENST00000397396 CTNND2Q9UQB3 1225 aa25.95■■□□□ 1.75
TSPAN4-202ENST00000397396 IKBKBO14920 756 aa25.94■■□□□ 1.74
TSPAN4-202ENST00000397396 SLC16A4O15374 487 aa25.94■■□□□ 1.74
TSPAN4-202ENST00000397396 PPP1R37O75864 691 aa25.94■■□□□ 1.74
TSPAN4-202ENST00000397396 TFRCP02786 760 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
TSPAN4-202ENST00000397396 MYBP10242 640 aa25.94■■□□□ 1.74
TSPAN4-202ENST00000397396 CD44P16070 742 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
TSPAN4-202ENST00000397396 CCNE1P24864 410 aa25.94■■□□□ 1.74
TSPAN4-202ENST00000397396 LRRC63Q05C16 580 aa25.94■■□□□ 1.74
TSPAN4-202ENST00000397396 CAPSQ13938 189 aa25.94■■□□□ 1.74
TSPAN4-202ENST00000397396 ZNF410Q86VK4 478 aa25.94■■□□□ 1.74
TSPAN4-202ENST00000397396 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa25.94■■□□□ 1.74
TSPAN4-202ENST00000397396 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
TSPAN4-202ENST00000397396 NELFBQ8WX92 580 aa25.94■■□□□ 1.74
TSPAN4-202ENST00000397396 P2RX5Q93086 422 aa25.94■■□□□ 1.74
TSPAN4-202ENST00000397396 ACCSQ96QU6 501 aa25.94■■□□□ 1.74
TSPAN4-202ENST00000397396 TMEM106CQ9BVX2 250 aa25.94■■□□□ 1.74
TSPAN4-202ENST00000397396 NFKBIZQ9BYH8 718 aa25.94■■□□□ 1.74
TSPAN4-202ENST00000397396 TREHO43280 583 aa25.93■■□□□ 1.74
TSPAN4-202ENST00000397396 PHKA2P46019 1235 aa25.93■■□□□ 1.74
TSPAN4-202ENST00000397396 GJA8P48165 433 aa25.93■■□□□ 1.74
TSPAN4-202ENST00000397396 DRP2Q13474 957 aa25.93■■□□□ 1.74
TSPAN4-202ENST00000397396 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
TSPAN4-202ENST00000397396 CENPPQ6IPU0 288 aa25.93■■□□□ 1.74
TSPAN4-202ENST00000397396 GOLGA5Q8TBA6 731 aa25.93■■□□□ 1.74
TSPAN4-202ENST00000397396 STRA6Q9BX79 667 aa25.93■■□□□ 1.74
TSPAN4-202ENST00000397396 TMEM134Q9H6X4 195 aa25.93■■□□□ 1.74
TSPAN4-202ENST00000397396 CBX8Q9HC52 389 aa25.93■■□□□ 1.74
TSPAN4-202ENST00000397396 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa25.93■■□□□ 1.74
TSPAN4-202ENST00000397396 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa25.92■■□□□ 1.74
TSPAN4-202ENST00000397396 CASP5P51878 434 aa25.92■■□□□ 1.74
TSPAN4-202ENST00000397396 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
TSPAN4-202ENST00000397396 STRN3Q13033 797 aa25.92■■□□□ 1.74
TSPAN4-202ENST00000397396 GSE1Q14687 1217 aa25.92■■□□□ 1.74
TSPAN4-202ENST00000397396 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
TSPAN4-202ENST00000397396 GAS2L3Q86XJ1 694 aa25.92■■□□□ 1.74
TSPAN4-202ENST00000397396 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa25.92■■□□□ 1.74
TSPAN4-202ENST00000397396 SLC43A3Q8NBI5 491 aa25.92■■□□□ 1.74
TSPAN4-202ENST00000397396 RNF149Q8NC42 400 aa25.92■■□□□ 1.74
TSPAN4-202ENST00000397396 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
TSPAN4-202ENST00000397396 NOD1Q9Y239 953 aa25.92■■□□□ 1.74
TSPAN4-202ENST00000397396 DENND3A2RUS2 1198 aa25.91■■□□□ 1.74
TSPAN4-202ENST00000397396 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa25.91■■□□□ 1.74
TSPAN4-202ENST00000397396 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
TSPAN4-202ENST00000397396 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
TSPAN4-202ENST00000397396 HS2ST1Q7LGA3 356 aa25.91■■□□□ 1.74
TSPAN4-202ENST00000397396 MAP4K3Q8IVH8 894 aa25.91■■□□□ 1.74
TSPAN4-202ENST00000397396 AOPEPQ8N6M6 819 aa25.91■■□□□ 1.74
TSPAN4-202ENST00000397396 NLRP4Q96MN2 994 aa25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms