RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394272.7

HDDC3-202, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HDDC3, Length 1,880 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-202ENST00000394272 A6NJR5 290 aa22.3■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 TPM2P07951 284 aa22.3■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 ZNF286BP0CG31 522 aa22.3■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 GLRA2P23416 452 aa22.3■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 VEGFBP49765 207 aa22.3■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 DNM2P50570 870 aa22.3■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 EXOC8Q8IYI6 725 aa22.3■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 SYCP3Q8IZU3 236 aa22.3■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 DMAC2Q9NW81 257 aa22.3■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 RNF186Q9NXI6 227 aa22.3■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 TBX20Q9UMR3 447 aa22.3■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 EVPLQ92817 2033 aa22.3■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 THSD7BQ9C0I4 1608 aa22.3■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 DENND3A2RUS2 1198 aa22.3■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 GAS2O43903 313 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 DGKDQ16760 1214 aa22.3■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 CCDC40Q4G0X9 1142 aa22.3■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 VWA3BQ502W6 1294 aa22.3■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 ARMCX5Q6P1M9 558 aa22.3■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 ZSCAN30Q86W11 494 aa22.3■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 SLC9A9Q8IVB4 645 aa22.3■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 MAP4K3Q8IVH8 894 aa22.3■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 TRIM59Q8IWR1 403 aa22.3■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 LRRC8AQ8IWT6 810 aa22.3■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 CENPFP49454 3210 aa22.29■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 A0A1W2PQC6 194 aa22.29■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 AKAP3O75969 853 aa22.29■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 NAMPTP43490 491 aa22.29■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 PRKCZQ05513 592 aa22.29■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 DRP2Q13474 957 aa22.29■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 MYBPC2Q14324 1141 aa22.29■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 PPP2R5AQ15172 486 aa22.29■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 TLK2Q86UE8 772 aa22.29■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 TRIB2Q92519 343 aa22.29■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 FAM184BQ9ULE4 1060 aa22.29■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 KAT6AQ92794 2004 aa22.29■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 H0YCG3 227 aa22.28■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 H3BRB1 525 aa22.28■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 TRPA1O75762 1119 aa22.28■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 ZNF484Q5JVG2 852 aa22.28■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 FRMD5Q7Z6J6 570 aa22.28■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 C12orf56Q8IXR9 622 aa22.28■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 NDST4Q9H3R1 872 aa22.28■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 Q9Y3F1 56 aa22.28■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 ABCD1P33897 745 aa22.28■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 CASP4P49662 377 aa22.28■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 LRMPQ12912 555 aa22.28■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 IER5Q5VY09 327 aa22.28■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 TAS1R3Q7RTX0 852 aa22.28■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 CCDC150Q8NCX0 1101 aa22.28■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 TRPV1Q8NER1 839 aa22.28■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa22.28■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 EXOC7Q9UPT5 735 aa22.28■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 PES1O00541 588 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 INSRRP14616 1297 aa22.27■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 SCP2P22307 547 aa22.27■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 HTRA3P83110 453 aa22.27■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 KIF22Q14807 665 aa22.27■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 CEP135Q66GS9 1140 aa22.27■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 TCP11Q8WWU5 503 aa22.27■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 MKNK1Q9BUB5 465 aa22.27■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 COL1A2P08123 1366 aa22.26■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 TISP43B9A030 160 aa22.26■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 C22orf31O95567 290 aa22.26■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 CYBAP13498 195 aa22.26■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 BORCS6Q96GS4 357 aa22.26■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 ERGIC2Q96RQ1 377 aa22.26■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 ESPNB1AK53 854 aa22.26■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 EPB41P11171 864 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 AKR1A1P14550 325 aa22.26■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 CAPSQ13938 189 aa22.26■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 MFSD14CQ5VZR4 134 aa22.26■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 LRRC71Q8N4P6 559 aa22.26■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 SUGCTQ9HAC7 445 aa22.26■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP22.25■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP22.25■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP22.25■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 LRRIQ4A6NIV6 560 aa22.24■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 F2P00734 622 aa22.24■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 GYPCP04921 128 aa22.24■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 CYP2J2P51589 502 aa22.24■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 FKBP15Q5T1M5 1219 aa22.24■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 DEPTORQ8TB45 409 aa22.24■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 CBWD1Q9BRT8 395 aa22.24■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 CNGA1P29973 690 aa22.24■■□□□ 1.15
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