RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393537.4

ANKRD39-201, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD39, Length 976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-201ENST00000393537 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa22.56■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 ERMNQ8TAM6 284 aa22.56■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 PIGOQ8TEQ8 1089 aa22.56■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 ASB2Q96Q27 587 aa22.56■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 PLVAPQ9BX97 442 aa22.56■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 IFT122Q9HBG6 1241 aa22.56■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 TUFT1Q9NNX1 390 aa22.56■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa22.56■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 DACT1Q9NYF0 836 aa22.56■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 SMC3Q9UQE7 1217 aa22.56■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa22.56■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 GRM6O15303 877 aa22.55■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 MED24O75448 989 aa22.55■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 RARRES1P49788 294 aa22.55■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 TIGD5Q53EQ6 642 aa22.55■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 CATSPER4Q7RTX7 472 aa22.55■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 FERMT3Q86UX7 667 aa22.55■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 CATSPER3Q86XQ3 398 aa22.55■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 C4orf32Q8N8J7 132 aa22.55■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 RNF169Q8NCN4 708 aa22.55■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 CHST12Q9NRB3 414 aa22.55■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 UNC80Q8N2C7 3258 aa22.55■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 A0A0U1RQF3 1178 aa22.54■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 H3BQV1 296 aa22.54■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 HOXA2O43364 376 aa22.54■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 DGAT1O75907 488 aa22.54■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 RNF149Q8NC42 400 aa22.54■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 P2RX5Q93086 422 aa22.54■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 HLA-CQ95604 372 aa22.54■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM117Q9H0C3 514 aa22.54■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 LMAN2LQ9H0V9 348 aa22.54■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 RNF19AQ9NV58 838 aa22.54■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 HCSTQ9UBK5 93 aa22.54■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 COG5Q9UP83 839 aa22.54■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 ASAP2O43150 1006 aa22.53■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP22.53■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 PTGDRQ13258 359 aa22.53■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa22.53■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 PLAGL2Q9UPG8 496 aa22.53■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 MYO7AQ13402 2215 aa22.53■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 USO1O60763 962 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 CSPG5O95196 566 aa22.52■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 RPA1P27694 616 aa22.52■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP22.52■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 AAK1Q2M2I8 961 aa22.52■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 NAALADL2Q58DX5 795 aa22.52■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 POTEGQ6S5H5 508 aa22.52■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 ABI1Q8IZP0 508 aa22.52■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 KLHL23Q8NBE8 558 aa22.52■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 NACC1Q96RE7 527 aa22.52■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 MINDY3Q9H8M7 445 aa22.52■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
ANKRD39-201ENST00000393537 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa22.51■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 EOMESO95936 686 aa22.51■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 ITGB1P05556 798 aa22.51■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 PHKA2P46019 1235 aa22.51■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 TCEAL5Q5H9L2 206 aa22.51■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 CLLU1OSQ5K130 101 aa22.51■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 HAUS3Q68CZ6 603 aa22.51■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 ASAP3Q8TDY4 903 aa22.51■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 CASD1Q96PB1 797 aa22.51■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 AAASQ9NRG9 546 aa22.51■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa22.51■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa22.51■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 REV3LO60673 3130 aa22.51■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 ARL2P36404 184 aa22.5■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 KCNQ1P51787 676 aa22.5■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 TFDP1Q14186 410 aa22.5■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 RILPL1Q5EBL4 403 aa22.5■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 SPPL3Q8TCT6 385 aa22.5■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 HELQQ8TDG4 1101 aa22.5■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 TRAIPQ9BWF2 469 aa22.5■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 CWH43Q9H720 699 aa22.5■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM105AQ9NUU6 356 aa22.5■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 LRWD1Q9UFC0 647 aa22.5■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 BRWD1Q9NSI6 2320 aa22.49■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 LAD1O00515 517 aa22.49■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 SKIP12755 728 aa22.49■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 PTENP60484 403 aa22.49■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 CAMK1Q14012 370 aa22.49■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 LRRC55Q6ZSA7 311 aa22.49■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 MAEAQ7L5Y9 396 aa22.49■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 LRRC43Q8N309 656 aa22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms