RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375391.5

TMCO3-201, Transcript of transmembrane and coiled-coil domains 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMCO3, Length 2,132 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3-201ENST00000375391 NLRP4Q96MN2 994 aa22.37■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 TTLL13PA6NNM8 815 aa22.37■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 ADAM17P78536 824 aa22.37■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 PLCB2Q00722 1185 aa22.37■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 LINC01465Q8N7H1 131 aa22.37■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 WNT8BQ93098 351 aa22.37■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 STRA6Q9BX79 667 aa22.37■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 KCTD10Q9H3F6 313 aa22.37■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 KMT5AQ9NQR1 393 aa22.37■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 BECN2A8MW95 431 aa22.36■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 PPP1R37O75864 691 aa22.36■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 TTI2Q6NXR4 508 aa22.36■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa22.36■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 RNF149Q8NC42 400 aa22.36■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 GINS2Q9Y248 185 aa22.36■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa22.36■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 CST5P28325 142 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 P2RX5Q93086 422 aa22.36■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 CTAGE1Q96RT6 745 aa22.36■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 CDHR5Q9HBB8 845 aa22.36■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 AKT3Q9Y243 479 aa22.36■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 NRCAMQ92823 1304 aa22.36■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 DENND3A2RUS2 1198 aa22.35■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 PSMA7O14818 248 aa22.35■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 CLIC2O15247 247 aa22.35■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 NCKAP1LP55160 1127 aa22.35■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 MYL5Q02045 173 aa22.35■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 CENPPQ6IPU0 288 aa22.35■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 ZNF507Q8TCN5 953 aa22.35■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 DNAJB3Q8WWF6 145 aa22.35■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 ZNF333Q96JL9 665 aa22.35■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 MINDY3Q9H8M7 445 aa22.35■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 RWDD2AQ9UIY3 292 aa22.35■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 TGFB1I1O43294 461 aa22.34■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 IQCF3P0C7M6 154 aa22.34■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 PTPN21Q16825 1174 aa22.34■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 CREBRFQ8IUR6 639 aa22.34■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa22.34■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 BPIFA3Q9BQP9 254 aa22.34■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 TIPINQ9BVW5 301 aa22.34■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 PCDH10Q9P2E7 1040 aa22.34■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 SEL1LQ9UBV2 794 aa22.34■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 MSCO60682 206 aa22.34■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 IER5Q5VY09 327 aa22.34■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 KATNAL1Q9BW62 490 aa22.34■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 DACH1Q9UI36 760 aa22.34■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 C17orf102A2RUQ5 167 aa22.33■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 ZEB2O60315 1214 aa22.33■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 CCNE1P24864 410 aa22.33■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 KIZQ2M2Z5 673 aa22.33■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 IFT74Q96LB3 600 aa22.33■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa22.33■■□□□ 1.17
TMCO3-201ENST00000375391 A0A087WZ62 844 aa22.33■■□□□ 1.16
TMCO3-201ENST00000375391 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.16
TMCO3-201ENST00000375391 A0A1W2PQY0 241 aa22.33■■□□□ 1.16
TMCO3-201ENST00000375391 MAPTP10636 758 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
TMCO3-201ENST00000375391 CYP2C9P11712 490 aa22.33■■□□□ 1.16
TMCO3-201ENST00000375391 STIM1Q13586 685 aa22.33■■□□□ 1.16
TMCO3-201ENST00000375391 ITGA7Q13683 1181 aa22.33■■□□□ 1.16
TMCO3-201ENST00000375391 ZCWPW2Q504Y3 356 aa22.33■■□□□ 1.16
TMCO3-201ENST00000375391 RETREG2Q8NC44 543 aa22.33■■□□□ 1.16
TMCO3-201ENST00000375391 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.16
TMCO3-201ENST00000375391 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
TMCO3-201ENST00000375391 IFT122Q9HBG6 1241 aa22.33■■□□□ 1.16
TMCO3-201ENST00000375391 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa22.33■■□□□ 1.16
TMCO3-201ENST00000375391 FRMPD3Q5JV73 1810 aa22.33■■□□□ 1.16
TMCO3-201ENST00000375391 COL1A2P08123 1366 aa22.32■■□□□ 1.16
TMCO3-201ENST00000375391 GTF2BQ00403 316 aa22.32■■□□□ 1.16
TMCO3-201ENST00000375391 COBLL1Q53SF7 1204 aa22.32■■□□□ 1.16
TMCO3-201ENST00000375391 IRF2BP1Q8IU81 584 aa22.32■■□□□ 1.16
TMCO3-201ENST00000375391 TBX20Q9UMR3 447 aa22.32■■□□□ 1.16
TMCO3-201ENST00000375391 ANKRD63C9JTQ0 380 aa22.31■■□□□ 1.16
TMCO3-201ENST00000375391 MAGEB2O15479 319 aa22.31■■□□□ 1.16
TMCO3-201ENST00000375391 FGFR4P22455 802 aa22.31■■□□□ 1.16
TMCO3-201ENST00000375391 HOXC8P31273 242 aa22.31■■□□□ 1.16
TMCO3-201ENST00000375391 SMTNP53814 917 aa22.31■■□□□ 1.16
TMCO3-201ENST00000375391 RTP1P59025 263 aa22.31■■□□□ 1.16
TMCO3-201ENST00000375391 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
TMCO3-201ENST00000375391 DEPTORQ8TB45 409 aa22.31■■□□□ 1.16
TMCO3-201ENST00000375391 SPIRE2Q8WWL2 714 aa22.31■■□□□ 1.16
TMCO3-201ENST00000375391 RRN3P2A6NIE6 340 aa22.31■■□□□ 1.16
TMCO3-201ENST00000375391 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa22.31■■□□□ 1.16
TMCO3-201ENST00000375391 KPNA6O60684 536 aa22.31■■□□□ 1.16
TMCO3-201ENST00000375391 NAMPTP43490 491 aa22.31■■□□□ 1.16
TMCO3-201ENST00000375391 BMT2Q1RMZ1 405 aa22.31■■□□□ 1.16
TMCO3-201ENST00000375391 SPATA1Q5VX52 437 aa22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms