RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 B4GALT3O60512 393 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-202ENST00000370826 B4GALT4O60513 344 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-202ENST00000370826 CELA3BP08861 270 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-202ENST00000370826 MRE11P49959 708 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-202ENST00000370826 LGALS4P56470 323 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-202ENST00000370826 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-202ENST00000370826 BORAQ6PGQ7 559 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-202ENST00000370826 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-202ENST00000370826 FERMT3Q86UX7 667 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-202ENST00000370826 RTKN2Q8IZC4 609 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-202ENST00000370826 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-202ENST00000370826 CDYL2Q8N8U2 506 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-202ENST00000370826 RSAD2Q8WXG1 361 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-202ENST00000370826 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-202ENST00000370826 HIST1H2AJQ99878 128 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-202ENST00000370826 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-202ENST00000370826 KCTD10Q9H3F6 313 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-202ENST00000370826 PARD6AQ9NPB6 346 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-202ENST00000370826 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-202ENST00000370826 DNAI1Q9UI46 699 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-202ENST00000370826 EDARQ9UNE0 448 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-202ENST00000370826 VWA7Q9Y334 891 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-202ENST00000370826 DUSP10Q9Y6W6 482 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-202ENST00000370826 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 GPR15P49685 360 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 MEOX1P50221 254 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 CTSWP56202 376 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 ADAM15Q13444 863 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 KLHDC10Q6PID8 442 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 GAREM2Q75VX8 874 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 KCNK18Q7Z418 384 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 LGI4Q8N135 537 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 GAB3Q8WWW8 586 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 WDR92Q96MX6 357 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 OSBPL6Q9BZF3 934 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 PDGFRBP09619 1106 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 IARSP41252 1262 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 PPARAQ07869 468 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 TBR1Q16650 682 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 CCDC178Q5BJE1 867 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 ZMAT1Q5H9K5 638 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 TOR2AQ5JU69 321 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 AGBL4Q5VU57 503 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 PGM2L1Q6PCE3 622 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 USP30Q70CQ3 517 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 FRMD5Q7Z6J6 570 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 OR14C36Q8NHC7 312 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 RAX2Q96IS3 184 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 DNAJC28Q9NX36 388 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 DPP7Q9UHL4 492 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM184BQ9ULE4 1060 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 INVSQ9Y283 1065 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 CDY2AQ9Y6F7 541 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 TNKSO95271 1327 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 C2orf78A6NCI8 922 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 TRIM75PA6NK02 468 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 MT-CO1P00395 513 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 MYBL2P10244 700 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 XPAP23025 273 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 PPP2CBP62714 309 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 PPP2CAP67775 309 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 CD69Q07108 199 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 MAN2A1Q16706 1144 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 RNF151Q2KHN1 245 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 ABCB5Q2M3G0 1257 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 PLEKHH3Q7Z736 793 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 CLEC14AQ86T13 490 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 FAXDC2Q96IV6 333 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 OR10A2Q9H208 303 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 SHTN1A0MZ66 631 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 FZD9O00144 591 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 ARHGAP6O43182 974 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 DAPK3O43293 454 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 NRP2O60462 931 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 FSBPO95073 299 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 CFBP00751 764 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-202ENST00000370826 RBP3P10745 1247 aa5.24□□□□□ -1.57
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