RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355530.6

SPNS3-201, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SPNS3, Length 2,133 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-201ENST00000355530 E7EVH7 732 aa19.78■□□□□ 0.76
SPNS3-201ENST00000355530 CHMP2AO43633 222 aa19.78■□□□□ 0.76
SPNS3-201ENST00000355530 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
SPNS3-201ENST00000355530 GH2P01242 217 aa19.78■□□□□ 0.76
SPNS3-201ENST00000355530 COG2Q14746 738 aa19.78■□□□□ 0.76
SPNS3-201ENST00000355530 DACT2Q5SW24 774 aa19.78■□□□□ 0.76
SPNS3-201ENST00000355530 KAT2BQ92831 832 aa19.78■□□□□ 0.76
SPNS3-201ENST00000355530 KCNQ5Q9NR82 932 aa19.78■□□□□ 0.76
SPNS3-201ENST00000355530 SERPINA10Q9UK55 444 aa19.78■□□□□ 0.76
SPNS3-201ENST00000355530 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa19.78■□□□□ 0.76
SPNS3-201ENST00000355530 ABCB4P21439 1286 aa19.78■□□□□ 0.76
SPNS3-201ENST00000355530 FLT3P36888 993 aa19.78■□□□□ 0.76
SPNS3-201ENST00000355530 CYP2J2P51589 502 aa19.78■□□□□ 0.76
SPNS3-201ENST00000355530 STAT2P52630 851 aa19.78■□□□□ 0.76
SPNS3-201ENST00000355530 SEC24CP53992 1094 aa19.78■□□□□ 0.76
SPNS3-201ENST00000355530 KIF22Q14807 665 aa19.78■□□□□ 0.76
SPNS3-201ENST00000355530 DCAF12L1Q5VU92 463 aa19.78■□□□□ 0.76
SPNS3-201ENST00000355530 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
SPNS3-201ENST00000355530 SEPT12Q8IYM1 358 aa19.78■□□□□ 0.76
SPNS3-201ENST00000355530 NACC1Q96RE7 527 aa19.78■□□□□ 0.76
SPNS3-201ENST00000355530 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
SPNS3-201ENST00000355530 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa19.78■□□□□ 0.76
SPNS3-201ENST00000355530 GAS7O60861 476 aa19.77■□□□□ 0.76
SPNS3-201ENST00000355530 FSBPO95073 299 aa19.77■□□□□ 0.76
SPNS3-201ENST00000355530 PDE6BP35913 854 aa19.77■□□□□ 0.76
SPNS3-201ENST00000355530 PLS1Q14651 629 aa19.77■□□□□ 0.76
SPNS3-201ENST00000355530 SLC9A9Q8IVB4 645 aa19.77■□□□□ 0.76
SPNS3-201ENST00000355530 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
SPNS3-201ENST00000355530 FMO2Q99518 471 aa19.77■□□□□ 0.76
SPNS3-201ENST00000355530 WDR11Q9BZH6 1224 aa19.77■□□□□ 0.76
SPNS3-201ENST00000355530 EHMT1Q9H9B1 1298 aa19.77■□□□□ 0.76
SPNS3-201ENST00000355530 ANKRD62A6NC57 917 aa19.76■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 TRIM49P0CI25 452 aa19.76■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 TRIM49CP0CI26 452 aa19.76■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 TNFAIP3P21580 790 aa19.76■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 PPP2R2AP63151 447 aa19.76■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 BFSP1Q12934 665 aa19.76■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 ODR4Q5SWX8 454 aa19.76■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 SMCHD1A6NHR9 2005 aa19.76■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 PPFIA2O75334 1257 aa19.76■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 ENTPD3O75355 529 aa19.76■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 TRIM37O94972 964 aa19.76■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 CFBP00751 764 aa19.76■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 HADHBP55084 474 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 DR1Q01658 176 aa19.76■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 MYBPC2Q14324 1141 aa19.76■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 KSR1Q8IVT5 923 aa19.76■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 RHOT2Q8IXI1 618 aa19.76■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 CNPY4Q8N129 248 aa19.76■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 ATP8B4Q8TF62 1192 aa19.76■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 MASTLQ96GX5 879 aa19.76■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 DPH5Q9H2P9 285 aa19.76■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 A0A1W2PRG0 241 aa19.75■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 PAEPP09466 180 aa19.75■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 POLR2MP0CAP2 368 aa19.75■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 GUCY2CP25092 1073 aa19.75■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 JAG1P78504 1218 aa19.75■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 SPICE1Q8N0Z3 855 aa19.75■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 ARHGEF26Q96DR7 871 aa19.75■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 CYFIP2Q96F07 1278 aa19.75■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 TRIM51Q9BSJ1 452 aa19.75■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 THAP2Q9H0W7 228 aa19.75■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 FAM187AA6NFU0 413 aa19.75■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 ZBTB39O15060 712 aa19.75■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 TRAPPC3O43617 180 aa19.75■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 SETQ01105 290 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 KRT71Q3SY84 523 aa19.75■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 ODF2Q5BJF6 829 aa19.75■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 VTI1AQ96AJ9 217 aa19.75■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 TXLNGYQ9BZA5 131 aa19.75■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP19.75■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa19.75■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 GMNCA6NCL1 334 aa19.74■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 EXOC3O60645 756 aa19.74■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 BCRP11274 1271 aa19.74■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 CEP55Q53EZ4 464 aa19.74■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 C11orf63Q6NUN7 778 aa19.74■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 SLC30A10Q6XR72 485 aa19.74■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 NLGN1Q8N2Q7 840 aa19.74■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa19.74■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP19.74■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 CAPN7Q9Y6W3 813 aa19.74■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 PFASO15067 1338 aa19.74■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 ECE2O60344 883 aa19.73■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 USP8P40818 1118 aa19.73■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 DUPD1Q68J44 220 aa19.73■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 SYCP3Q8IZU3 236 aa19.73■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 AGPAT1Q99943 283 aa19.73■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 ERP44Q9BS26 406 aa19.73■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 STRA6Q9BX79 667 aa19.73■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 NR2E1Q9Y466 385 aa19.73■□□□□ 0.75
SPNS3-201ENST00000355530 KRT13P13646 458 aa19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.6 ms