RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335475.5

KCNQ1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-202ENST00000335475 USP38Q8NB14 1042 aa22.59■■□□□ 1.21
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KCNQ1-202ENST00000335475 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
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KCNQ1-202ENST00000335475 RFFLQ8WZ73 363 aa22.54■■□□□ 1.2
KCNQ1-202ENST00000335475 PNMA2Q9UL42 364 aa22.54■■□□□ 1.2
KCNQ1-202ENST00000335475 RIPK3Q9Y572 518 aa22.54■■□□□ 1.2
KCNQ1-202ENST00000335475 MAPK13O15264 365 aa22.53■■□□□ 1.2
KCNQ1-202ENST00000335475 ZBED4O75132 1171 aa22.53■■□□□ 1.2
KCNQ1-202ENST00000335475 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
KCNQ1-202ENST00000335475 PSMC5P62195 406 aa22.53■■□□□ 1.2
KCNQ1-202ENST00000335475 PTPROQ16827 1216 aa22.53■■□□□ 1.2
KCNQ1-202ENST00000335475 SAMD7Q7Z3H4 446 aa22.53■■□□□ 1.2
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