RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 GPRC5CQ9NQ84 441 aa29.67■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 A0A1W2PQ27 194 aa29.66■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 A0A1W2PQ64 194 aa29.66■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 A0A1W2PQD8 194 aa29.66■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 PAK2Q13177 524 aa29.66■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 PPP2R5AQ15172 486 aa29.66■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 NAALADL2Q58DX5 795 aa29.66■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa29.66■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 RNF149Q8NC42 400 aa29.66■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM40Q8WWA1 233 aa29.66■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 IFT74Q96LB3 600 aa29.66■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 KCNG1Q9UIX4 513 aa29.66■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 PADI3Q9ULW8 664 aa29.66■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 MICAL3Q7RTP6 2002 aa29.65■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 A0A087X0B3 334 aa29.65■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 GLRA2P23416 452 aa29.65■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 CD52P31358 61 aa29.65■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 C9orf50Q5SZB4 431 aa29.65■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 GPBP1Q86WP2 473 aa29.65■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 ASAP3Q8TDY4 903 aa29.65■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 FTHL17Q9BXU8 183 aa29.65■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 C17orf75Q9HAS0 396 aa29.65■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 IFT122Q9HBG6 1241 aa29.65■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 KCNH3Q9ULD8 1083 aa29.65■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa29.64■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 HIP1RO75146 1068 aa29.64■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 PHKA2P46019 1235 aa29.64■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 ARSHQ5FYA8 562 aa29.64■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa29.64■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
CRIP1-201ENST00000330233 PTENP60484 403 aa29.63■■■□□ 2.33
CRIP1-201ENST00000330233 CAPSQ13938 189 aa29.63■■■□□ 2.33
CRIP1-201ENST00000330233 NFKBIZQ9BYH8 718 aa29.63■■■□□ 2.33
CRIP1-201ENST00000330233 LRRC27Q9C0I9 530 aa29.63■■■□□ 2.33
CRIP1-201ENST00000330233 ERVK-5Q9HDB9 667 aa29.63■■■□□ 2.33
CRIP1-201ENST00000330233 ODF2LQ9ULJ1 636 aa29.63■■■□□ 2.33
CRIP1-201ENST00000330233 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP29.62■■■□□ 2.33
CRIP1-201ENST00000330233 NAMPTP43490 491 aa29.62■■■□□ 2.33
CRIP1-201ENST00000330233 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP29.62■■■□□ 2.33
CRIP1-201ENST00000330233 E2F4Q16254 413 aa29.62■■■□□ 2.33
CRIP1-201ENST00000330233 RASIP1Q5U651 963 aa29.62■■■□□ 2.33
CRIP1-201ENST00000330233 FAM228AQ86W67 206 aa29.62■■■□□ 2.33
CRIP1-201ENST00000330233 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
CRIP1-201ENST00000330233 DHX58Q96C10 678 aa29.62■■■□□ 2.33
CRIP1-201ENST00000330233 ZBBXA8MT70 800 aa29.61■■■□□ 2.33
CRIP1-201ENST00000330233 KRT18P05783 430 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
CRIP1-201ENST00000330233 MAGEF1Q9HAY2 307 aa29.61■■■□□ 2.33
CRIP1-201ENST00000330233 POLD4Q9HCU8 107 aa29.61■■■□□ 2.33
CRIP1-201ENST00000330233 USP25Q9UHP3 1055 aa29.61■■■□□ 2.33
CRIP1-201ENST00000330233 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa29.6■■■□□ 2.33
CRIP1-201ENST00000330233 A0A1B0GVL5 298 aa29.6■■■□□ 2.33
CRIP1-201ENST00000330233 LRRIQ4A6NIV6 560 aa29.6■■■□□ 2.33
CRIP1-201ENST00000330233 PFKFB1P16118 471 aa29.6■■■□□ 2.33
CRIP1-201ENST00000330233 AMPD3Q01432 767 aa29.6■■■□□ 2.33
CRIP1-201ENST00000330233 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa29.6■■■□□ 2.33
CRIP1-201ENST00000330233 TCTN1Q2MV58 587 aa29.6■■■□□ 2.33
CRIP1-201ENST00000330233 DAW1Q8N136 415 aa29.6■■■□□ 2.33
CRIP1-201ENST00000330233 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
CRIP1-201ENST00000330233 C2orf40Q9H1Z8 148 aa29.6■■■□□ 2.33
CRIP1-201ENST00000330233 HPSEQ9Y251 543 aa29.6■■■□□ 2.33
CRIP1-201ENST00000330233 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa29.6■■■□□ 2.33
CRIP1-201ENST00000330233 KCNJ6P48051 423 aa29.59■■■□□ 2.33
CRIP1-201ENST00000330233 MAPK7Q13164 816 aa29.59■■■□□ 2.33
CRIP1-201ENST00000330233 GIT2Q14161 759 aa29.59■■■□□ 2.33
CRIP1-201ENST00000330233 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa29.59■■■□□ 2.33
CRIP1-201ENST00000330233 DEPTORQ8TB45 409 aa29.59■■■□□ 2.33
CRIP1-201ENST00000330233 BSNDQ8WZ55 320 aa29.59■■■□□ 2.33
CRIP1-201ENST00000330233 TNMDQ9H2S6 317 aa29.59■■■□□ 2.33
CRIP1-201ENST00000330233 KBTBD4Q9NVX7 518 aa29.59■■■□□ 2.33
CRIP1-201ENST00000330233 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
CRIP1-201ENST00000330233 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa29.58■■■□□ 2.33
CRIP1-201ENST00000330233 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
CRIP1-201ENST00000330233 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
CRIP1-201ENST00000330233 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa29.58■■■□□ 2.33
CRIP1-201ENST00000330233 REEP2Q9BRK0 252 aa29.58■■■□□ 2.33
CRIP1-201ENST00000330233 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
CRIP1-201ENST00000330233 CHST12Q9NRB3 414 aa29.58■■■□□ 2.33
CRIP1-201ENST00000330233 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
CRIP1-201ENST00000330233 ENPP3O14638 875 aa29.57■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 PLS3P13797 630 aa29.57■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 SYKP43405 635 aa29.57■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 EFNA5P52803 228 aa29.57■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 SMTNP53814 917 aa29.57■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 PEX3P56589 373 aa29.57■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 WDR5P61964 334 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 CATSPER4Q7RTX7 472 aa29.57■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 CEP57L1Q8IYX8 460 aa29.57■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 FSIP1Q8NA03 581 aa29.57■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 DDX12PQ92771 950 aa29.57■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 TMX1Q9H3N1 280 aa29.57■■■□□ 2.32
CRIP1-201ENST00000330233 TTC3P53804 2025 aa29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms