RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326277.5

SNX18-201, Transcript of sorting nexin 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNX18, Length 2,063 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18-201ENST00000326277 MYL7Q01449 175 aa24.93■■□□□ 1.58
SNX18-201ENST00000326277 VGLL4Q14135 290 aa24.93■■□□□ 1.58
SNX18-201ENST00000326277 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
SNX18-201ENST00000326277 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
SNX18-201ENST00000326277 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
SNX18-201ENST00000326277 NAGPAQ9UK23 515 aa24.93■■□□□ 1.58
SNX18-201ENST00000326277 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa24.93■■□□□ 1.58
SNX18-201ENST00000326277 MYPNQ86TC9 1320 aa24.93■■□□□ 1.58
SNX18-201ENST00000326277 WDR90Q96KV7 1748 aa24.92■■□□□ 1.58
SNX18-201ENST00000326277 ZNF862O60290 1169 aa24.92■■□□□ 1.58
SNX18-201ENST00000326277 KRT13P13646 458 aa24.92■■□□□ 1.58
SNX18-201ENST00000326277 TCP1P17987 556 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
SNX18-201ENST00000326277 STAT1P42224 750 aa24.92■■□□□ 1.58
SNX18-201ENST00000326277 DLG4P78352 724 aa24.92■■□□□ 1.58
SNX18-201ENST00000326277 C10orf76Q5T2E6 689 aa24.92■■□□□ 1.58
SNX18-201ENST00000326277 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
SNX18-201ENST00000326277 PSMB7Q99436 277 aa24.92■■□□□ 1.58
SNX18-201ENST00000326277 DNAJC12Q9UKB3 198 aa24.92■■□□□ 1.58
SNX18-201ENST00000326277 PALMO75781 387 aa24.92■■□□□ 1.58
SNX18-201ENST00000326277 GFPT2O94808 682 aa24.92■■□□□ 1.58
SNX18-201ENST00000326277 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
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SNX18-201ENST00000326277 HSPBP1Q9NZL4 362 aa24.92■■□□□ 1.58
SNX18-201ENST00000326277 F8VZ95 297 aa24.91■■□□□ 1.58
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SNX18-201ENST00000326277 FERP16591 822 aa24.91■■□□□ 1.58
SNX18-201ENST00000326277 CXCR5P32302 372 aa24.91■■□□□ 1.58
SNX18-201ENST00000326277 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa24.91■■□□□ 1.58
SNX18-201ENST00000326277 ABCB6Q9NP58 842 aa24.91■■□□□ 1.58
SNX18-201ENST00000326277 PRDM10Q9NQV6 1147 aa24.91■■□□□ 1.58
SNX18-201ENST00000326277 NFASCO94856 1347 aa24.9■■□□□ 1.58
SNX18-201ENST00000326277 DDNO94850 711 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
SNX18-201ENST00000326277 STBD1O95210 358 aa24.9■■□□□ 1.58
SNX18-201ENST00000326277 ANXA13P27216 316 aa24.9■■□□□ 1.58
SNX18-201ENST00000326277 SOX5P35711 763 aa24.9■■□□□ 1.58
SNX18-201ENST00000326277 SP4Q02446 784 aa24.9■■□□□ 1.58
SNX18-201ENST00000326277 SWSAP1Q6NVH7 229 aa24.9■■□□□ 1.58
SNX18-201ENST00000326277 WDR93Q6P2C0 686 aa24.9■■□□□ 1.58
SNX18-201ENST00000326277 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
SNX18-201ENST00000326277 OTUD6AQ7L8S5 288 aa24.9■■□□□ 1.58
SNX18-201ENST00000326277 XXYLT1Q8NBI6 393 aa24.9■■□□□ 1.58
SNX18-201ENST00000326277 ATP6V0A1Q93050 837 aa24.9■■□□□ 1.58
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SNX18-201ENST00000326277 APEX2Q9UBZ4 518 aa24.9■■□□□ 1.58
SNX18-201ENST00000326277 NENFQ9UMX5 172 aa24.9■■□□□ 1.58
SNX18-201ENST00000326277 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa24.9■■□□□ 1.58
SNX18-201ENST00000326277 CCDC169A6NNP5 214 aa24.9■■□□□ 1.58
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SNX18-201ENST00000326277 C2orf54Q08AI8 447 aa24.9■■□□□ 1.58
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SNX18-201ENST00000326277 ST7Q9NRC1 585 aa24.9■■□□□ 1.58
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SNX18-201ENST00000326277 WDR81Q562E7 1941 aa24.89■■□□□ 1.58
SNX18-201ENST00000326277 DOCK5Q9H7D0 1870 aa24.89■■□□□ 1.58
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SNX18-201ENST00000326277 BTNL10A8MVZ5 291 aa24.89■■□□□ 1.58
SNX18-201ENST00000326277 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa24.89■■□□□ 1.58
SNX18-201ENST00000326277 SORBS3O60504 671 aa24.89■■□□□ 1.58
SNX18-201ENST00000326277 STAM2O75886 525 aa24.89■■□□□ 1.58
SNX18-201ENST00000326277 PSAPP07602 524 aa24.89■■□□□ 1.58
SNX18-201ENST00000326277 NPTX2P47972 431 aa24.89■■□□□ 1.58
SNX18-201ENST00000326277 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
SNX18-201ENST00000326277 VPS36Q86VN1 386 aa24.89■■□□□ 1.58
SNX18-201ENST00000326277 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa24.89■■□□□ 1.58
SNX18-201ENST00000326277 LMO3Q8TAP4 145 aa24.89■■□□□ 1.58
SNX18-201ENST00000326277 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa24.89■■□□□ 1.58
SNX18-201ENST00000326277 GPR88Q9GZN0 384 aa24.89■■□□□ 1.58
SNX18-201ENST00000326277 PEX10O60683 326 aa24.89■■□□□ 1.57
SNX18-201ENST00000326277 SOX10P56693 466 aa24.89■■□□□ 1.57
SNX18-201ENST00000326277 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
SNX18-201ENST00000326277 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.57
SNX18-201ENST00000326277 GNPTABQ3T906 1256 aa24.89■■□□□ 1.57
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SNX18-201ENST00000326277 TBX20Q9UMR3 447 aa24.89■■□□□ 1.57
SNX18-201ENST00000326277 LCTP09848 1927 aa24.88■■□□□ 1.57
SNX18-201ENST00000326277 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP24.88■■□□□ 1.572e-6■■■■■ 31.8
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SNX18-201ENST00000326277 SMTNP53814 917 aa24.88■■□□□ 1.57
SNX18-201ENST00000326277 ACTR2P61160 394 aa24.88■■□□□ 1.57
SNX18-201ENST00000326277 PPP3CAQ08209 521 aa24.88■■□□□ 1.57
SNX18-201ENST00000326277 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
SNX18-201ENST00000326277 BSNDQ8WZ55 320 aa24.88■■□□□ 1.57
SNX18-201ENST00000326277 MAF1Q9H063 256 aa24.88■■□□□ 1.57
SNX18-201ENST00000326277 LOC285556D6RIA3 1793 aa24.88■■□□□ 1.57
SNX18-201ENST00000326277 GRID2IPA4D2P6 1211 aa24.87■■□□□ 1.57
SNX18-201ENST00000326277 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP24.87■■□□□ 1.57
SNX18-201ENST00000326277 C1orf220Q5T0J3 134 aa24.87■■□□□ 1.57
SNX18-201ENST00000326277 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa24.87■■□□□ 1.57
SNX18-201ENST00000326277 ANKRD63C9JTQ0 380 aa24.87■■□□□ 1.57
SNX18-201ENST00000326277 SP2Q02086 613 aa24.87■■□□□ 1.57
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