RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296098.4

TRIM54-201, Transcript of tripartite motif containing 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM54, Length 2,027 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54-201ENST00000296098 VIPAS39Q9H9C1 493 aa26.09■■□□□ 1.77
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TRIM54-201ENST00000296098 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
TRIM54-201ENST00000296098 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
TRIM54-201ENST00000296098 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
TRIM54-201ENST00000296098 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
TRIM54-201ENST00000296098 RDH13Q8NBN7 331 aa26.09■■□□□ 1.77
TRIM54-201ENST00000296098 REPS2Q8NFH8 660 aa26.09■■□□□ 1.77
TRIM54-201ENST00000296098 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP26.08■■□□□ 1.77
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TRIM54-201ENST00000296098 DNA2P51530 1060 aa26.08■■□□□ 1.77
TRIM54-201ENST00000296098 GTF2BQ00403 316 aa26.08■■□□□ 1.77
TRIM54-201ENST00000296098 HAUS6Q7Z4H7 955 aa26.08■■□□□ 1.77
TRIM54-201ENST00000296098 RDM1Q8NG50 284 aa26.08■■□□□ 1.77
TRIM54-201ENST00000296098 GPRASP2Q96D09 838 aa26.08■■□□□ 1.77
TRIM54-201ENST00000296098 MS4A14Q96JA4 679 aa26.08■■□□□ 1.77
TRIM54-201ENST00000296098 C12orf42Q96LP6 360 aa26.08■■□□□ 1.77
TRIM54-201ENST00000296098 SH2D3AQ9BRG2 576 aa26.08■■□□□ 1.77
TRIM54-201ENST00000296098 PCIF1Q9H4Z3 704 aa26.08■■□□□ 1.77
TRIM54-201ENST00000296098 ANKEF1Q9NU02 776 aa26.08■■□□□ 1.77
TRIM54-201ENST00000296098 INTUQ9ULD6 942 aa26.08■■□□□ 1.77
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TRIM54-201ENST00000296098 H2AFZP0C0S5 128 aa26.07■■□□□ 1.76
TRIM54-201ENST00000296098 OAZ1P54368 228 aa26.07■■□□□ 1.76
TRIM54-201ENST00000296098 HMGCS2P54868 508 aa26.07■■□□□ 1.76
TRIM54-201ENST00000296098 H2AFVQ71UI9 128 aa26.07■■□□□ 1.76
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TRIM54-201ENST00000296098 SLC17A8Q8NDX2 589 aa26.07■■□□□ 1.76
TRIM54-201ENST00000296098 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
TRIM54-201ENST00000296098 CBWD1Q9BRT8 395 aa26.07■■□□□ 1.76
TRIM54-201ENST00000296098 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
TRIM54-201ENST00000296098 ZNF541Q9H0D2 1346 aa26.06■■□□□ 1.76
TRIM54-201ENST00000296098 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
TRIM54-201ENST00000296098 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
TRIM54-201ENST00000296098 NOP2P46087 812 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
TRIM54-201ENST00000296098 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
TRIM54-201ENST00000296098 C8orf74Q6P047 294 aa26.06■■□□□ 1.76
TRIM54-201ENST00000296098 NLRX1Q86UT6 975 aa26.06■■□□□ 1.76
TRIM54-201ENST00000296098 VSIG10LQ86VR7 867 aa26.06■■□□□ 1.76
TRIM54-201ENST00000296098 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
TRIM54-201ENST00000296098 IWS1Q96ST2 819 aa26.06■■□□□ 1.76
TRIM54-201ENST00000296098 GPR88Q9GZN0 384 aa26.06■■□□□ 1.76
TRIM54-201ENST00000296098 GPRC5CQ9NQ84 441 aa26.06■■□□□ 1.76
TRIM54-201ENST00000296098 SLC16A4O15374 487 aa26.05■■□□□ 1.76
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TRIM54-201ENST00000296098 VAMP7P51809 220 aa26.05■■□□□ 1.76
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TRIM54-201ENST00000296098 TAF4BQ92750 862 aa26.05■■□□□ 1.76
TRIM54-201ENST00000296098 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
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TRIM54-201ENST00000296098 HSPBP1Q9NZL4 362 aa26.05■■□□□ 1.76
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TRIM54-201ENST00000296098 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
TRIM54-201ENST00000296098 FAM102BQ5T8I3 360 aa26.05■■□□□ 1.76
TRIM54-201ENST00000296098 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
TRIM54-201ENST00000296098 SLC30A5Q8TAD4 765 aa26.05■■□□□ 1.76
TRIM54-201ENST00000296098 SENP7Q9BQF6 1050 aa26.05■■□□□ 1.76
TRIM54-201ENST00000296098 SELENOOQ9BVL4 669 aa26.05■■□□□ 1.76
TRIM54-201ENST00000296098 STIM2Q9P246 746 aa26.05■■□□□ 1.76
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TRIM54-201ENST00000296098 DLG4P78352 724 aa26.04■■□□□ 1.76
TRIM54-201ENST00000296098 RPS6KA1Q15418 735 aa26.04■■□□□ 1.76
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TRIM54-201ENST00000296098 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
TRIM54-201ENST00000296098 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa26.04■■□□□ 1.76
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TRIM54-201ENST00000296098 CD2APQ9Y5K6 639 aa26.04■■□□□ 1.76
TRIM54-201ENST00000296098 ARID2Q68CP9 1835 aa26.04■■□□□ 1.76
TRIM54-201ENST00000296098 C19orf81C9J6K1 198 aa26.04■■□□□ 1.76
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TRIM54-201ENST00000296098 TPCN2Q8NHX9 752 aa26.04■■□□□ 1.76
TRIM54-201ENST00000296098 SYT11Q9BT88 431 aa26.04■■□□□ 1.76
TRIM54-201ENST00000296098 HPCAL4Q9UM19 191 aa26.04■■□□□ 1.76
TRIM54-201ENST00000296098 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa26.04■■□□□ 1.76
TRIM54-201ENST00000296098 WDR81Q562E7 1941 aa26.03■■□□□ 1.76
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