RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283228.6

PTPRR-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 3,529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-201ENST00000283228 CCDC152Q4G0S7 254 aa12.25□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 ISLR2Q6UXK2 745 aa12.25□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa12.25□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 PHC3Q8NDX5 983 aa12.25□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 ATP8B4Q8TF62 1192 aa12.25□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 PREBQ9HCU5 417 aa12.25□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 CHMP2BQ9UQN3 213 aa12.25□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa12.25□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 NFAT5O94916 1531 aa12.25□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 RAD21O60216 631 aa12.25□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 KRT36O76013 467 aa12.25□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 KRT15P19012 456 aa12.25□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 CTSWP56202 376 aa12.25□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 CDR2Q01850 454 aa12.25□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 MCL1Q07820 350 aa12.25□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 CALCRLQ16602 461 aa12.25□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 SEL1L2Q5TEA6 688 aa12.25□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 SLC35G2Q8TBE7 412 aa12.25□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 EDEM3Q9BZQ6 932 aa12.25□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 CARD9Q9H257 536 aa12.25□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa12.25□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 HDAC9Q9UKV0 1011 aa12.25□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 LRRC42Q9Y546 428 aa12.25□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 SMCO2A6NFE2 343 aa12.24□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa12.24□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 ATP6V1G1O75348 118 aa12.24□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 GM2AP17900 193 aa12.24□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 TNNI2P48788 182 aa12.24□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 MAPK7Q13164 816 aa12.24□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 LRRC36Q1X8D7 754 aa12.24□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 IRGCQ6NXR0 463 aa12.24□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 LRRC55Q6ZSA7 311 aa12.24□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 PNMA1Q8ND90 353 aa12.24□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 TBCKQ8TEA7 893 aa12.24□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 FBXO41Q8TF61 875 aa12.24□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 OCEL1Q9H607 264 aa12.24□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 CFAP69A5D8W1 941 aa12.24□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 AFPP02771 609 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 NUDT17P0C025 328 aa12.24□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 TFAP4Q01664 338 aa12.24□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 STRN3Q13033 797 aa12.24□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 GALNTL6Q49A17 601 aa12.24□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa12.24□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 ADGRA1Q86SQ6 560 aa12.24□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 NT5DC3Q86UY8 548 aa12.24□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 TBC1D16Q8TBP0 767 aa12.24□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP12.24□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 ZFP69BQ9UJL9 534 aa12.24□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 SERPINA10Q9UK55 444 aa12.24□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 RASA4BC9J798 803 aa12.24□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa12.24□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 O00370 1275 aa12.24□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 RASA4O43374 803 aa12.24□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 SPOPO43791 374 aa12.24□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 UCHL3P15374 230 aa12.24□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 TNFAIP3P21580 790 aa12.24□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 RCAN1P53805 252 aa12.24□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 PLS1Q14651 629 aa12.24□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 DUPD1Q68J44 220 aa12.24□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 ASAP3Q8TDY4 903 aa12.24□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 SMC6Q96SB8 1091 aa12.24□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 TTC1Q99614 292 aa12.24□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 MAGEF1Q9HAY2 307 aa12.24□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 CCDC87Q9NVE4 849 aa12.24□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 BCS1LQ9Y276 419 aa12.24□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 LRCH1Q9Y2L9 728 aa12.24□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 ANKRD62A6NC57 917 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 CCNFP41002 786 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 PTENP60484 403 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 LBRQ14739 615 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 RFWD3Q6PCD5 774 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 NEK8Q86SG6 692 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 HIC2Q96JB3 615 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 RUNDC3BQ96NL0 473 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 RAB34Q9BZG1 259 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 PARP2Q9UGN5 583 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 C1orf167Q5SNV9 1468 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 PFASO15067 1338 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 RPTORQ8N122 1335 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 A0A0G2JND7 137 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 LRRN2O75325 713 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 MARK3P27448 753 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 STAT1P42224 750 aa12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms