RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP23.68■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 PSMB7Q99436 277 aa23.68■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 GRID2IPA4D2P6 1211 aa23.67■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 NFIAQ12857 509 aa23.67■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 USP17L2Q6R6M4 530 aa23.67■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 CLEC10AQ8IUN9 316 aa23.67■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 KIF2BQ8N4N8 673 aa23.67■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 MDM1Q8TC05 714 aa23.67■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 RASGRP4Q8TDF6 673 aa23.67■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 SLC35B4Q969S0 331 aa23.67■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 MLXIPQ9HAP2 919 aa23.67■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa23.67■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 LGALS16A8MUM7 142 aa23.67■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 E2F6O75461 281 aa23.67■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 MMEP08473 750 aa23.67■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 TTC38Q5R3I4 469 aa23.67■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 NIM1KQ8IY84 436 aa23.67■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 STK32AQ8WU08 396 aa23.67■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 DNAJC9Q8WXX5 260 aa23.67■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 AGAP3Q96P47 875 aa23.67■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 TLR10Q9BXR5 811 aa23.67■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa23.66■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 KLRF2D3W0D1 207 aa23.66■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 ECHS1P30084 290 aa23.66■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 NOVP48745 357 aa23.66■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 GALNT17Q6IS24 598 aa23.66■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 HHIPL2Q6UWX4 724 aa23.66■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 SMYD1Q8NB12 490 aa23.66■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 TEKT1Q969V4 418 aa23.66■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 SART1O43290 800 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 AKR1B1P15121 316 aa23.65■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 TRADDQ15628 312 aa23.65■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 DACT2Q5SW24 774 aa23.65■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 ZFPM1Q8IX07 1006 aa23.65■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 ASAP3Q8TDY4 903 aa23.65■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 EPSTI1Q96J88 318 aa23.65■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 A0A087X0B3 334 aa23.65■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 ZNF263O14978 683 aa23.65■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 OAS1P00973 400 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 TPBGLP0DKB5 382 aa23.65■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 CRKP46108 304 aa23.65■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 STRIP1Q5VSL9 837 aa23.65■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 LONP2Q86WA8 852 aa23.65■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 ZNF507Q8TCN5 953 aa23.65■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 KRT12Q99456 494 aa23.65■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 TTYH3Q9C0H2 523 aa23.65■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 VIL1P09327 827 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 CACNB3P54284 484 aa23.64■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 BPIFB4P59827 614 aa23.64■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 BLIDQ8IZY5 108 aa23.64■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 PPP1R14BQ96C90 147 aa23.64■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 PAGE5Q96GU1 130 aa23.64■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 CYP39A1Q9NYL5 469 aa23.64■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 CHN1P15882 459 aa23.64■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 PTGDRQ13258 359 aa23.64■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP23.64■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 RETREG2Q8NC44 543 aa23.64■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 JDP2Q8WYK2 163 aa23.64■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 MS4A14Q96JA4 679 aa23.64■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 SNX3O60493 162 aa23.63■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 EIF6P56537 245 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 KRT71Q3SY84 523 aa23.63■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa23.63■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 SH3GLB2Q9NR46 395 aa23.63■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 USP17L5A8MUK1 530 aa23.63■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 M0R2N6 131 aa23.63■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 NCK2O43639 380 aa23.63■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 PEX11AO75192 247 aa23.63■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 PAK1Q13153 545 aa23.63■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 SMC1BQ8NDV3 1235 aa23.63■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 MTRQ99707 1265 aa23.63■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 MTMR4Q9NYA4 1195 aa23.63■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 SPATA7Q9P0W8 599 aa23.63■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 SERPINB13Q9UIV8 391 aa23.63■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 ZNRF3Q9ULT6 936 aa23.63■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 PCDHA4Q9UN74 947 aa23.63■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 LRCH1Q9Y2L9 728 aa23.63■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa23.63■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 RAD51CO43502 376 aa23.62■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 AFMP43652 599 aa23.62■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 SH2D4BQ5SQS7 431 aa23.62■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 ZNF365Q70YC5 407 aa23.62■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 PDP2Q9P2J9 529 aa23.62■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 PLIN4Q96Q06 1357 aa23.62■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 CCNB1P14635 433 aa23.62■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 CALML3P27482 149 aa23.62■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 SHMT1P34896 483 aa23.62■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 TNNC1P63316 161 aa23.62■■□□□ 1.37
PITX1-201ENST00000265340 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms