RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 CTAGE6Q86UF2 777 aa22.25■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 CTAGE4Q8IX94 777 aa22.25■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 CPLX3Q8WVH0 158 aa22.25■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa22.24■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 BACH1O14867 736 aa22.24■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 SYF2O95926 243 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 IGHA2P01877 340 aa22.24■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 CCT5P48643 541 aa22.24■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa22.24■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 RINT1Q6NUQ1 792 aa22.24■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 SPATA33Q96N06 139 aa22.24■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 GPR20Q99678 358 aa22.24■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 EXOC1Q9NV70 894 aa22.24■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 CTAGE9A4FU28 777 aa22.24■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 IDEP14735 1019 aa22.24■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 STX17P56962 302 aa22.24■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 TUBB4BP68371 445 aa22.24■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 ARHGAP1Q07960 439 aa22.24■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 PCYT2Q99447 389 aa22.24■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 GDAQ9Y2T3 454 aa22.24■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 A0A1B0GTH6 734 aa22.23■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa22.23■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 SEPT1Q8WYJ6 367 aa22.23■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 REEP2Q9BRK0 252 aa22.23■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF302Q9NR11 478 aa22.23■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 ARID2Q68CP9 1835 aa22.23■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 ADCY6O43306 1168 aa22.23■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 STBD1O95210 358 aa22.23■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 KRT18P05783 430 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 CD44P16070 742 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 RARRES1P49788 294 aa22.23■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 PRKCEQ02156 737 aa22.23■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 PRKCZQ05513 592 aa22.23■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 GIT2Q14161 759 aa22.23■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 HPS3Q969F9 1004 aa22.23■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 ADGRG1Q9Y653 693 aa22.23■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 FAM169AQ9Y6X4 670 aa22.23■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 ARHGEF35A5YM69 484 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 NOP56O00567 594 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 SMPD1P17405 629 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 USP8P40818 1118 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 FLT3LGP49771 235 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 RBL2Q08999 1139 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 KIF22Q14807 665 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 PLA2G4FQ68DD2 849 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 RAD9BQ6WBX8 426 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 C1orf186Q6ZWK4 172 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 ANO5Q75V66 913 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 SH2D3AQ9BRG2 576 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 GH1P01241 217 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 EHHADHQ08426 723 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 SLC35F6Q8N357 371 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 EBAG9O00559 213 aa22.21■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP22.21■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 COASYQ13057 564 aa22.21■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 PANK4Q9NVE7 773 aa22.21■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa22.21■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa22.21■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 ATP4AP20648 1035 aa22.21■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 TUBB2AQ13885 445 aa22.21■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 DUSP28Q4G0W2 176 aa22.21■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 CD99L2Q8TCZ2 262 aa22.21■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 PANX2Q96RD6 677 aa22.21■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 TUBB2BQ9BVA1 445 aa22.21■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 ANKEF1Q9NU02 776 aa22.21■■□□□ 1.15
UBE2B-201ENST00000265339 FRMD3A2A2Y4 597 aa22.2■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 GPR25O00155 361 aa22.2■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 STK4Q13043 487 aa22.2■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 IRF5Q13568 498 aa22.2■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 PADI6Q6TGC4 694 aa22.2■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 PPFIBP1Q86W92 1011 aa22.2■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 RABEP2Q9H5N1 569 aa22.2■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 RSPH10B2B2RC85 870 aa22.2■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 RSPH10BP0C881 870 aa22.2■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 NPEPPSP55786 919 aa22.2■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 LAMC2Q13753 1193 aa22.2■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 IQSEC1Q6DN90 963 aa22.2■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 KIAA0895Q8NCT3 520 aa22.2■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 TRIB2Q92519 343 aa22.2■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 POLD4Q9HCU8 107 aa22.2■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 TUBBP07437 444 aa22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.9 ms