RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000257552.6

MSI1-201, Transcript of musashi RNA binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MSI1, Length 2,975 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1-201ENST00000257552 EMILIN3Q9NT22 766 aa15.96■□□□□ 0.15
MSI1-201ENST00000257552 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa15.96■□□□□ 0.15
MSI1-201ENST00000257552 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP15.96■□□□□ 0.15
MSI1-201ENST00000257552 CETN3O15182 167 aa15.96■□□□□ 0.15
MSI1-201ENST00000257552 GFPT2O94808 682 aa15.96■□□□□ 0.15
MSI1-201ENST00000257552 KRT18P05783 430 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
MSI1-201ENST00000257552 AKR1B1P15121 316 aa15.96■□□□□ 0.15
MSI1-201ENST00000257552 CALRP27797 417 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
MSI1-201ENST00000257552 GALCP54803 685 aa15.96■□□□□ 0.15
MSI1-201ENST00000257552 C10orf76Q5T2E6 689 aa15.96■□□□□ 0.15
MSI1-201ENST00000257552 ZFPM1Q8IX07 1006 aa15.96■□□□□ 0.15
MSI1-201ENST00000257552 GPCPD1Q9NPB8 672 aa15.96■□□□□ 0.15
MSI1-201ENST00000257552 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa15.96■□□□□ 0.15
MSI1-201ENST00000257552 FOXO6A8MYZ6 492 aa15.96■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 GNA14O95837 355 aa15.96■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 DCAF12L1Q5VU92 463 aa15.96■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 CCDC25Q86WR0 208 aa15.96■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 CCHCR1Q8TD31 782 aa15.96■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 ZBTB10Q96DT7 871 aa15.96■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 SAAL1Q96ER3 474 aa15.96■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 TMOD4Q9NZQ9 345 aa15.96■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 TCP11X1B4DZS4 312 aa15.95■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 SNX3O60493 162 aa15.95■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 PON1P27169 355 aa15.95■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP15.95■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 KLRC3Q07444 240 aa15.95■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 DUPD1Q68J44 220 aa15.95■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 PGM2Q96G03 612 aa15.95■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 HES6Q96HZ4 224 aa15.95■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa15.95■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 KCNMB3Q9NPA1 279 aa15.95■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 KIAA1024Q9UPX6 916 aa15.95■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 MYH7BA7E2Y1 1941 aa15.95■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 EVI5O60447 810 aa15.95■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 MYBL1P10243 752 aa15.95■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 TRIM68Q6AZZ1 485 aa15.95■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 ANKRD42Q8N9B4 389 aa15.95■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 C18orf8Q96DM3 657 aa15.95■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 ZNF287Q9HBT7 754 aa15.95■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa15.95■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 NUDT17P0C025 328 aa15.94■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 CREB1P16220 341 aa15.94■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 PLCG2P16885 1265 aa15.94■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa15.94■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 SLFN11Q7Z7L1 901 aa15.94■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 VPS36Q86VN1 386 aa15.94■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 GPBP1Q86WP2 473 aa15.94■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 JAMLQ86YT9 394 aa15.94■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 GLYCTKQ8IVS8 523 aa15.94■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 SYCE1Q8N0S2 351 aa15.94■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 SLC35G2Q8TBE7 412 aa15.94■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 PARD3BQ8TEW8 1205 aa15.94■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 LRRC27Q9C0I9 530 aa15.94■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 EDIL3O43854 480 aa15.94■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 SLC16A2P36021 539 aa15.94■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 CASP5P51878 434 aa15.94■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 PTENP60484 403 aa15.94■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 UBE2SQ16763 222 aa15.94■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 NUGGCQ68CJ6 796 aa15.94■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 ZDHHC24Q6UX98 284 aa15.94■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 CCDC65Q8IXS2 484 aa15.94■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 NEDD1Q8NHV4 660 aa15.94■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 COA1Q9GZY4 146 aa15.94■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 SLC5A4Q9NY91 659 aa15.94■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 SNED1Q8TER0 1413 aa15.94■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 NPR1P16066 1061 aa15.93■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 PDE6CP51160 858 aa15.93■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 CNGA2Q16280 664 aa15.93■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 TMEM119Q4V9L6 283 aa15.93■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa15.93■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 SLF2Q8IX21 1173 aa15.93■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 GDAP1Q8TB36 358 aa15.93■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 KCTD10Q9H3F6 313 aa15.93■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 RPTORQ8N122 1335 aa15.93■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa15.93■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 RASGRF2O14827 1237 aa15.93■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP15.93■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 AFPP02771 609 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 CCND1P24385 295 aa15.93■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 LLGL1Q15334 1064 aa15.93■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa15.93■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 C6orf118Q5T5N4 469 aa15.93■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa15.93■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa15.93■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa15.93■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 KIF3CO14782 793 aa15.93■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 COPS2P61201 443 aa15.93■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 ADCY1Q08828 1119 aa15.93■□□□□ 0.14
MSI1-201ENST00000257552 SLC17A8Q8NDX2 589 aa15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms