RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256474.2

VHL-201, Transcript of von Hippel-Lindau tumor suppressor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VHL, Length 3,737 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VHL-201ENST00000256474 DLATP10515 647 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 GUCY2CP25092 1073 aa14.62□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 SP8Q8IXZ3 490 aa14.62□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 FBXO25Q8TCJ0 367 aa14.62□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 CYFIP2Q96F07 1278 aa14.62□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 LXNQ9BS40 222 aa14.62□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 HIP1RO75146 1068 aa14.61□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 SLITRK3O94933 977 aa14.61□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 EYA4O95677 639 aa14.61□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 RDXP35241 583 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 STAT2P52630 851 aa14.61□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 SPIRE1Q08AE8 756 aa14.61□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 PPP1R7Q15435 360 aa14.61□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 CBWD1Q9BRT8 395 aa14.61□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 AZI2Q9H6S1 392 aa14.61□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa14.61□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 ACSL3O95573 720 aa14.61□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 POLR2MP0CAP2 368 aa14.61□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 AP3B2Q13367 1082 aa14.61□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 CRY2Q49AN0 593 aa14.61□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa14.61□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 CAPN12Q6ZSI9 719 aa14.61□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 LRRC57Q8N9N7 239 aa14.61□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 ALG3Q92685 438 aa14.61□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 LENG9Q96B70 501 aa14.61□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 KCNK9Q9NPC2 374 aa14.61□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 SIX2Q9NPC8 291 aa14.61□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa14.61□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 GMNCA6NCL1 334 aa14.61□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa14.61□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 DENND2CQ68D51 928 aa14.61□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 TMEM179Q6ZVK1 233 aa14.61□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 SIAH1Q8IUQ4 282 aa14.61□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 CDAN1Q8IWY9 1227 aa14.61□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 ALG6Q9Y672 507 aa14.61□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa14.6□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa14.6□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 ECE2O60344 883 aa14.6□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 PPP2R2AP63151 447 aa14.6□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 DGKZQ13574 1117 aa14.6□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 CUL1Q13616 776 aa14.6□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 DCAF4Q8WV16 495 aa14.6□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa14.6□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 TBK1Q9UHD2 729 aa14.6□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 CYP26A1O43174 497 aa14.6□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa14.6□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 SCFD2Q8WU76 684 aa14.6□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 C1orf54Q8WWF1 131 aa14.6□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 RAPGEF5Q92565 580 aa14.6□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 FAM20AQ96MK3 541 aa14.6□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 GLT8D2Q9H1C3 349 aa14.6□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 SLC16A4O15374 487 aa14.59□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 LMNB1P20700 586 aa14.59□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 PEX3P56589 373 aa14.59□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 SOX10P56693 466 aa14.59□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 SKOR1P84550 965 aa14.59□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 ARHGEF19Q8IW93 802 aa14.59□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 RFFLQ8WZ73 363 aa14.59□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 ALAS1P13196 640 aa14.59□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 CETN1Q12798 172 aa14.59□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 SLC29A2Q14542 456 aa14.59□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 FAM102BQ5T8I3 360 aa14.59□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 MIER3Q7Z3K6 550 aa14.59□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa14.59□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 TMOD2Q9NZR1 351 aa14.59□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 ASIC3Q9UHC3 531 aa14.59□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa14.59□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 FOSP01100 380 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 SREBF1P36956 1147 aa14.59□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 TBC1D31Q96DN5 1066 aa14.59□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 HEMGNQ9BXL5 484 aa14.59□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 UNC45AQ9H3U1 944 aa14.59□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 EFCC1Q9HA90 598 aa14.59□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 APEX2Q9UBZ4 518 aa14.59□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 COG5Q9UP83 839 aa14.59□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms