RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 B2RBV5 119 aa17.09■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 KCNQ3O43525 872 aa17.09■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 ATP6V1B1P15313 513 aa17.09■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 KYNUQ16719 465 aa17.09■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 IZUMO3Q5VZ72 239 aa17.09■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 PPM1NQ8N819 430 aa17.09■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 KCNK16Q96T55 309 aa17.09■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 C15orf41Q9Y2V0 281 aa17.09■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 SERPINB2P05120 415 aa17.09■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 ADD2P35612 726 aa17.09■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 PRAMEP78395 509 aa17.09■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 TRAPPC3LQ5T215 181 aa17.09■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 ACSBG1Q96GR2 724 aa17.09■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa17.09■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa17.09■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 TMTC4Q5T4D3 741 aa17.08■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 DDI1Q8WTU0 396 aa17.08■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 ATP6V1E2Q96A05 226 aa17.08■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 EME1Q96AY2 570 aa17.08■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 WNT8AQ9H1J5 351 aa17.08■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 PCIF1Q9H4Z3 704 aa17.08■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 GJA3Q9Y6H8 435 aa17.08■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 RSPH10B2B2RC85 870 aa17.08■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 CAPN9O14815 690 aa17.08■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 CIAO1O76071 339 aa17.08■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 RSPH10BP0C881 870 aa17.08■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 FOXR1Q6PIV2 292 aa17.08■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa17.08■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 SLC17A8Q8NDX2 589 aa17.08■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 NSL1Q96IY1 281 aa17.08■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 TMEM206Q9H813 350 aa17.08■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 CNGB3Q9NQW8 809 aa17.08■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 DYTNA2CJ06 578 aa17.08■□□□□ 0.32
CTIF-201ENST00000256413 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
CTIF-201ENST00000256413 GCP02774 474 aa17.08■□□□□ 0.32
CTIF-201ENST00000256413 TMEM191BP0C7N4 346 aa17.08■□□□□ 0.32
CTIF-201ENST00000256413 GHRP10912 638 aa17.08■□□□□ 0.32
CTIF-201ENST00000256413 IL10P22301 178 aa17.08■□□□□ 0.32
CTIF-201ENST00000256413 BTNL9Q6UXG8 535 aa17.08■□□□□ 0.32
CTIF-201ENST00000256413 KLC2Q9H0B6 622 aa17.08■□□□□ 0.32
CTIF-201ENST00000256413 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
CTIF-201ENST00000256413 SUN2Q9UH99 717 aa17.08■□□□□ 0.32
CTIF-201ENST00000256413 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
CTIF-201ENST00000256413 RFFLQ8WZ73 363 aa17.08■□□□□ 0.32
CTIF-201ENST00000256413 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
CTIF-201ENST00000256413 MAML3Q96JK9 1138 aa17.08■□□□□ 0.32
CTIF-201ENST00000256413 RIMBP2O15034 1052 aa17.08■□□□□ 0.32
CTIF-201ENST00000256413 IL2RBP14784 551 aa17.08■□□□□ 0.32
CTIF-201ENST00000256413 KRT17Q04695 432 aa17.08■□□□□ 0.32
CTIF-201ENST00000256413 KCNH2Q12809 1159 aa17.08■□□□□ 0.32
CTIF-201ENST00000256413 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
CTIF-201ENST00000256413 TUBE1Q9UJT0 475 aa17.08■□□□□ 0.32
CTIF-201ENST00000256413 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
CTIF-201ENST00000256413 FOXP2O15409 715 aa17.07■□□□□ 0.32
CTIF-201ENST00000256413 HSD17B3P37058 310 aa17.07■□□□□ 0.32
CTIF-201ENST00000256413 ITKQ08881 620 aa17.07■□□□□ 0.32
CTIF-201ENST00000256413 NLRX1Q86UT6 975 aa17.07■□□□□ 0.32
CTIF-201ENST00000256413 CCNYQ8ND76 341 aa17.07■□□□□ 0.32
CTIF-201ENST00000256413 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa17.07■□□□□ 0.32
CTIF-201ENST00000256413 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa17.07■□□□□ 0.32
CTIF-201ENST00000256413 CTSWP56202 376 aa17.07■□□□□ 0.32
CTIF-201ENST00000256413 TTC13Q8NBP0 860 aa17.07■□□□□ 0.32
CTIF-201ENST00000256413 CATSPER2Q96P56 530 aa17.07■□□□□ 0.32
CTIF-201ENST00000256413 MXD3Q9BW11 206 aa17.07■□□□□ 0.32
CTIF-201ENST00000256413 DCLRE1BQ9H816 532 aa17.07■□□□□ 0.32
CTIF-201ENST00000256413 UBN2Q6ZU65 1347 aa17.07■□□□□ 0.32
CTIF-201ENST00000256413 STRNO43815 780 aa17.07■□□□□ 0.32
CTIF-201ENST00000256413 TARSP26639 723 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
CTIF-201ENST00000256413 POTEAQ6S8J7 498 aa17.07■□□□□ 0.32
CTIF-201ENST00000256413 PI4K2BG5E9Z4 385 aa17.07■□□□□ 0.32
CTIF-201ENST00000256413 SEMA3FQ13275 785 aa17.07■□□□□ 0.32
CTIF-201ENST00000256413 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
CTIF-201ENST00000256413 CATSPER3Q86XQ3 398 aa17.07■□□□□ 0.32
CTIF-201ENST00000256413 PBXIP1Q96AQ6 731 aa17.07■□□□□ 0.32
CTIF-201ENST00000256413 ASXL2Q76L83 1435 aa17.07■□□□□ 0.32
CTIF-201ENST00000256413 GPS1Q13098 491 aa17.06■□□□□ 0.32
CTIF-201ENST00000256413 SLC13A1Q9BZW2 595 aa17.06■□□□□ 0.32
CTIF-201ENST00000256413 FOSP01100 380 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
CTIF-201ENST00000256413 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
CTIF-201ENST00000256413 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
CTIF-201ENST00000256413 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
CTIF-201ENST00000256413 VPS11Q9H270 941 aa17.06■□□□□ 0.32
CTIF-201ENST00000256413 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa17.06■□□□□ 0.32
CTIF-201ENST00000256413 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
CTIF-201ENST00000256413 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa17.06■□□□□ 0.32
CTIF-201ENST00000256413 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
CTIF-201ENST00000256413 SASH1O94885 1247 aa17.06■□□□□ 0.32
CTIF-201ENST00000256413 FSBPO95073 299 aa17.06■□□□□ 0.32
CTIF-201ENST00000256413 CACNA2D1P54289 1103 aa17.06■□□□□ 0.32
CTIF-201ENST00000256413 TRIM60Q495X7 471 aa17.06■□□□□ 0.32
CTIF-201ENST00000256413 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa17.06■□□□□ 0.32
CTIF-201ENST00000256413 ZNF408Q9H9D4 720 aa17.06■□□□□ 0.32
CTIF-201ENST00000256413 CHEK2O96017 543 aa17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms