RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 LCHNA4D1U4 455 aa24.76■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 SLC26A4O43511 780 aa24.76■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 CAPSQ13938 189 aa24.76■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 FAM117BQ6P1L5 589 aa24.76■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 KCTD17Q8N5Z5 321 aa24.76■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 RNF149Q8NC42 400 aa24.76■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 MCPH1Q8NEM0 835 aa24.76■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 RGS18Q9NS28 235 aa24.76■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 MSRAQ9UJ68 235 aa24.76■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 UBA7P41226 1012 aa24.75■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 PTENP60484 403 aa24.75■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 FAM189BP81408 668 aa24.75■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 POU5F1BQ06416 359 aa24.75■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 KARSQ15046 597 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 ODR4Q5SWX8 454 aa24.75■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 RINT1Q6NUQ1 792 aa24.75■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 C1orf186Q6ZWK4 172 aa24.75■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 BSNDQ8WZ55 320 aa24.75■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 CHAMP1Q96JM3 812 aa24.75■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 SCLT1Q96NL6 688 aa24.75■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 RAD9AQ99638 391 aa24.75■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 ADAM2Q99965 735 aa24.75■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 RUSC1Q9BVN2 902 aa24.75■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 NT5C3AQ9H0P0 336 aa24.75■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa24.75■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 TMEM265A0A087WTH1 108 aa24.74■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 C9IYK1 514 aa24.74■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 TLL1O43897 1013 aa24.74■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 UPP2O95045 317 aa24.74■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 YEATS4O95619 227 aa24.74■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 CA3P07451 260 aa24.74■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 SLC12A3P55017 1021 aa24.74■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa24.74■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 DEFB123Q8N688 67 aa24.74■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 COL4A6Q14031 1691 aa24.74■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 SPTLC2O15270 562 aa24.73■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 PPP6R2O75170 966 aa24.73■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 STK38Q15208 465 aa24.73■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 FAM102BQ5T8I3 360 aa24.73■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 SPRED2Q7Z698 418 aa24.73■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 DAW1Q8N136 415 aa24.73■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 ZNF576Q9H609 170 aa24.73■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 MTMR10Q9NXD2 777 aa24.73■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 PLA2G4BP0C869 781 aa24.72■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 PLCG1P19174 1290 aa24.72■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 MAPK7Q13164 816 aa24.72■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 ZNF697Q5TEC3 545 aa24.72■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 ATL3Q6DD88 541 aa24.72■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 SLC24A5Q71RS6 500 aa24.72■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 ZBED2Q9BTP6 218 aa24.72■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 NFKBIZQ9BYH8 718 aa24.72■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 SARSP49591 514 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 TAP1Q03518 808 aa24.71■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 AMHR2Q16671 573 aa24.71■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 ARSHQ5FYA8 562 aa24.71■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 CALML4Q96GE6 196 aa24.71■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 FAM161BQ96MY7 647 aa24.71■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 RCOR1Q9UKL0 485 aa24.71■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 INSL6Q9Y581 213 aa24.71■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 MYO9BQ13459 2157 aa24.71■■□□□ 1.55
SYF2-201ENST00000236273 DENND3A2RUS2 1198 aa24.7■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 DGKIO75912 1065 aa24.7■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP24.7■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 MBTD1Q05BQ5 628 aa24.7■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 GRIN2CQ14957 1233 aa24.7■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 NAALADL2Q58DX5 795 aa24.7■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa24.7■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 GUCD1Q96NT3 240 aa24.7■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 SLC28A3Q9HAS3 691 aa24.7■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 CHST12Q9NRB3 414 aa24.7■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 C1orf112Q9NSG2 853 aa24.7■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 A0A087X0B3 334 aa24.69■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 GUCY2CP25092 1073 aa24.69■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 PHKA2P46019 1235 aa24.69■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 TFDP1Q14186 410 aa24.69■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 CATSPER4Q7RTX7 472 aa24.69■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 NPAS4Q8IUM7 802 aa24.69■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 RAD54LQ92698 747 aa24.69■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 TRAIPQ9BWF2 469 aa24.69■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa24.69■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 TCHHQ07283 1943 aa24.68■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 LINC01553A4QN01 128 aa24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.2 ms