RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ODC1-201ENST00000234111 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
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ODC1-201ENST00000234111 ERVV-2B6SEH9 535 aa22.89■■□□□ 1.25
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ODC1-201ENST00000234111 SNX29Q8TEQ0 813 aa22.89■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 CARD9Q9H257 536 aa22.89■■□□□ 1.25
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ODC1-201ENST00000234111 RARGP13631 454 aa22.88■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 PRKCIP41743 596 aa22.88■■□□□ 1.25
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ODC1-201ENST00000234111 ZNF384Q8TF68 577 aa22.87■■□□□ 1.25
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ODC1-201ENST00000234111 LRP5O75197 1615 aa22.87■■□□□ 1.25
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ODC1-201ENST00000234111 CCDC152Q4G0S7 254 aa22.87■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 IRGCQ6NXR0 463 aa22.87■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 TTC27Q6P3X3 843 aa22.87■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 GJB7Q6PEY0 223 aa22.87■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa22.87■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa22.87■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa22.87■■□□□ 1.25
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ODC1-201ENST00000234111 BRAFP15056 766 aa22.86■■□□□ 1.25
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ODC1-201ENST00000234111 ECM1Q16610 540 aa22.86■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 SEPT14Q6ZU15 432 aa22.86■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 TRIM74Q86UV6 250 aa22.86■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 TRIM73Q86UV7 250 aa22.86■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 IL17RBQ9NRM6 502 aa22.86■■□□□ 1.25
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ODC1-201ENST00000234111 EXOC3L4Q17RC7 722 aa22.86■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 ZNF449Q6P9G9 518 aa22.86■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 SCOCQ9UIL1 159 aa22.86■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa22.86■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 SMCO2A6NFE2 343 aa22.85■■□□□ 1.25
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