RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 NETO1Q8TDF5 533 aa18.77■□□□□ 0.6
SPCS1-201ENST00000233025 IGSF21Q96ID5 467 aa18.77■□□□□ 0.6
SPCS1-201ENST00000233025 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa18.77■□□□□ 0.6
SPCS1-201ENST00000233025 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
SPCS1-201ENST00000233025 ZSCAN32Q9NX65 697 aa18.77■□□□□ 0.6
SPCS1-201ENST00000233025 F5P12259 2224 aa18.76■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 ZBTB42B2RXF5 422 aa18.76■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 ACTR2P61160 394 aa18.76■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 TICAM2Q86XR7 235 aa18.76■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 RNF169Q8NCN4 708 aa18.76■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 STAMQ92783 540 aa18.76■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 KLHL5Q96PQ7 755 aa18.76■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa18.76■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 COL1A2P08123 1366 aa18.76■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 ANHXE9PGG2 379 aa18.75■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP18.75■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 SLC26A2P50443 739 aa18.75■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 HTR4Q13639 388 aa18.75■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 CUL5Q93034 780 aa18.75■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 COL26A1Q96A83 441 aa18.75■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 BCO2Q9BYV7 579 aa18.75■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 JADE2Q9NQC1 790 aa18.75■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 MAFGO15525 162 aa18.74■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 TBC1D4O60343 1298 aa18.74■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 HBP1O60381 514 aa18.74■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 VTNP04004 478 aa18.74■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 CNPP09543 421 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 PMLP29590 882 aa18.74■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 MAN1C1Q9NR34 630 aa18.74■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 GMEB2Q9UKD1 530 aa18.74■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa18.74■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 NFASCO94856 1347 aa18.74■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 GREB1Q4ZG55 1949 aa18.73■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa18.73■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 A0A0U1RQF3 1178 aa18.73■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 KANSL1LA0AUZ9 987 aa18.73■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 ATG7O95352 703 aa18.73■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 C22orf31O95567 290 aa18.73■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 KLRC2P26717 231 aa18.73■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 CYP26C1Q6V0L0 522 aa18.73■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 SHDQ96IW2 340 aa18.73■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 KRT23Q9C075 422 aa18.73■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 CARNS1A5YM72 827 aa18.72■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 LILRB3O75022 631 aa18.72■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 PAPLNO95428 1278 aa18.72■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 LAMP2P13473 410 aa18.72■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 SHC2P98077 582 aa18.72■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 ANKRD45Q5TZF3 282 aa18.72■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 PIBF1Q8WXW3 757 aa18.72■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa18.72■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 KCNH7Q9NS40 1196 aa18.72■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 NUMBLQ9Y6R0 609 aa18.72■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 DSPP15924 2871 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa18.71■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 INPPL1O15357 1258 aa18.71■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 GALTP07902 379 aa18.71■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 MAGEA9P43362 315 aa18.71■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 PDE1AP54750 535 aa18.71■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 SPEM2Q0P670 501 aa18.71■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF484Q5JVG2 852 aa18.71■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 CYB5R4Q7L1T6 521 aa18.71■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 OSBPL6Q9BZF3 934 aa18.71■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa18.71■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 SPAG17Q6Q759 2223 aa18.71■□□□□ 0.59
SPCS1-201ENST00000233025 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
SPCS1-201ENST00000233025 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
SPCS1-201ENST00000233025 TROAPQ12815 778 aa18.7■□□□□ 0.58
SPCS1-201ENST00000233025 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
SPCS1-201ENST00000233025 RSPH1Q8WYR4 309 aa18.7■□□□□ 0.58
SPCS1-201ENST00000233025 ADAMTS10Q9H324 1103 aa18.7■□□□□ 0.58
SPCS1-201ENST00000233025 CNNM2Q9H8M5 875 aa18.7■□□□□ 0.58
SPCS1-201ENST00000233025 TBC1D13Q9NVG8 400 aa18.7■□□□□ 0.58
SPCS1-201ENST00000233025 SDK1Q7Z5N4 2213 aa18.7■□□□□ 0.58
SPCS1-201ENST00000233025 B4GALT3O60512 393 aa18.69■□□□□ 0.58
SPCS1-201ENST00000233025 RFPL2O75678 378 aa18.69■□□□□ 0.58
SPCS1-201ENST00000233025 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP18.69■□□□□ 0.58
SPCS1-201ENST00000233025 SLC11A1P49279 550 aa18.69■□□□□ 0.58
SPCS1-201ENST00000233025 GPC5P78333 572 aa18.69■□□□□ 0.58
SPCS1-201ENST00000233025 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
SPCS1-201ENST00000233025 UBXN2BQ14CS0 331 aa18.69■□□□□ 0.58
SPCS1-201ENST00000233025 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
SPCS1-201ENST00000233025 TSSK4Q6SA08 328 aa18.69■□□□□ 0.58
SPCS1-201ENST00000233025 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
SPCS1-201ENST00000233025 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
SPCS1-201ENST00000233025 SDF4Q9BRK5 362 aa18.69■□□□□ 0.58
SPCS1-201ENST00000233025 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
SPCS1-201ENST00000233025 SENP2Q9HC62 589 aa18.69■□□□□ 0.58
SPCS1-201ENST00000233025 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms