RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000221770.7

POP4-201, Transcript of POP4 homolog, ribonuclease P/MRP subunit, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene POP4, Length 2,321 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4-201ENST00000221770 TMEM59LQ9UK28 342 aa17.06■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 F8VZ95 297 aa17.05■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 EXOC3O60645 756 aa17.05■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 HSF2BPO75031 334 aa17.05■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 PAK2Q13177 524 aa17.05■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 DNAAF5Q86Y56 855 aa17.05■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 SLC30A5Q8TAD4 765 aa17.05■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 ACTRT1Q8TDG2 376 aa17.05■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 PGAP2Q9UHJ9 254 aa17.05■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 ZNF536O15090 1300 aa17.05■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 RPTORQ8N122 1335 aa17.05■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 KLHL33A6NCF5 533 aa17.05■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 GOLGA8KD6RF30 607 aa17.05■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 PPP1R37O75864 691 aa17.05■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 CARSP49589 748 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 MAPK7Q13164 816 aa17.05■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 CBWD6Q4V339 395 aa17.05■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 CBWD3Q5JTY5 395 aa17.05■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 CBWD5Q5RIA9 395 aa17.05■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 SLFN11Q7Z7L1 901 aa17.05■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 IFT81Q8WYA0 676 aa17.05■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 TMEM206Q9H813 350 aa17.05■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 ZNRF3Q9ULT6 936 aa17.05■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 GOLGA6CA6NDK9 693 aa17.04■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 CEP104O60308 925 aa17.04■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 CLSTN1O94985 981 aa17.04■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 GOLGA6DP0CG33 693 aa17.04■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 MAPTP10636 758 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 CALRP27797 417 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 RXRBP28702 533 aa17.04■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 ALCAMQ13740 583 aa17.04■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 FOXR1Q6PIV2 292 aa17.04■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 PEX26Q7Z412 305 aa17.04■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 DAW1Q8N136 415 aa17.04■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 FAM76AQ8TAV0 307 aa17.04■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 SH3GL2Q99962 352 aa17.04■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 ZNF341Q9BYN7 854 aa17.04■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa17.04■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 NFU1Q9UMS0 254 aa17.04■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 KIF13BQ9NQT8 1826 aa17.04■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 TRIM49P0CI25 452 aa17.04■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 TRIM49CP0CI26 452 aa17.04■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 KRT13P13646 458 aa17.04■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 GALCP54803 685 aa17.04■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 MYL7Q01449 175 aa17.04■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 BFSP1Q12934 665 aa17.04■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 PLS1Q14651 629 aa17.04■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 SCFD2Q8WU76 684 aa17.04■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 CLEC4DQ8WXI8 215 aa17.04■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 HOOK2Q96ED9 719 aa17.04■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 RUFY1Q96T51 708 aa17.04■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 PKD2L1Q9P0L9 805 aa17.04■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 COL20A1Q9P218 1284 aa17.04■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 APEX2Q9UBZ4 518 aa17.04■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 TMCO5BA8MYB1 307 aa17.03■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 K7ENM7 598 aa17.03■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 DHX15O43143 795 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 INHBEP58166 350 aa17.03■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 PPFIA1Q13136 1202 aa17.03■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 NIM1KQ8IY84 436 aa17.03■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 RDH13Q8NBN7 331 aa17.03■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 GOLPH3Q9H4A6 298 aa17.03■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa17.03■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa17.03■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 PSME4Q14997 1843 aa17.03■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 NFIBO00712 420 aa17.03■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 WDR46O15213 610 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 TKFCQ3LXA3 575 aa17.03■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 MAEAQ7L5Y9 396 aa17.03■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 GLYCTKQ8IVS8 523 aa17.03■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 KLHL7Q8IXQ5 586 aa17.03■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 METTL13Q8N6R0 699 aa17.03■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 ZHX2Q9Y6X8 837 aa17.03■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 RAD51CO43502 376 aa17.02■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 TNFAIP3P21580 790 aa17.02■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 SCP2P22307 547 aa17.02■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 RFX1P22670 979 aa17.02■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 SSR1P43307 286 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 GHRHRQ02643 423 aa17.02■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 PCNX4Q63HM2 1172 aa17.02■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 DAAM2Q86T65 1068 aa17.02■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa17.02■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP17.02■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 LPAR1Q92633 364 aa17.02■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 ACCSQ96QU6 501 aa17.02■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP17.02■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 GPR88Q9GZN0 384 aa17.02■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 SAMM50Q9Y512 469 aa17.02■□□□□ 0.32
POP4-201ENST00000221770 ESYT3A0FGR9 886 aa17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms