RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216487.11

RIN3-201, Transcript of Ras and Rab interactor 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RIN3, Length 3,859 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIN3-201ENST00000216487 MMP13P45452 471 aa14.8□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 BCAMP50895 628 aa14.8□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 TFAP4Q01664 338 aa14.8□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 BNIP1Q12981 228 aa14.8□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 IKQ13123 557 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 ALX1Q15699 326 aa14.8□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 KYNUQ16719 465 aa14.8□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 GPBP1Q86WP2 473 aa14.8□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 TPCN2Q8NHX9 752 aa14.8□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 TTC8Q8TAM2 541 aa14.8□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 RMI1Q9H9A7 625 aa14.8□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 NPHS2Q9NP85 383 aa14.8□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 FBXO3Q9UK99 471 aa14.8□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 LRRN2O75325 713 aa14.8□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 TMCC1O94876 653 aa14.8□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 LMNB1P20700 586 aa14.8□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 CHRNA3P32297 505 aa14.8□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 PIGWQ7Z7B1 504 aa14.8□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 RASSF3Q86WH2 238 aa14.8□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 GLYCTKQ8IVS8 523 aa14.8□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 TTLL11Q8NHH1 800 aa14.8□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 E7ENQ6 273 aa14.8□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 NMT2O60551 498 aa14.8□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 GRAMD1BQ3KR37 738 aa14.8□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 MIIPQ5JXC2 388 aa14.8□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 SMC1BQ8NDV3 1235 aa14.8□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa14.8□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 MYLK2Q9H1R3 596 aa14.8□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 GCNT4Q9P109 453 aa14.8□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 ANAPC4Q9UJX5 808 aa14.8□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 DIP2AQ14689 1571 aa14.79□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 ABCD1P33897 745 aa14.79□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 CCNJLQ8IV13 435 aa14.79□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa14.79□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 NAGPAQ9UK23 515 aa14.79□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 ABCC6O95255 1503 aa14.79□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 CCDC22O60826 627 aa14.79□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 PGM1P36871 562 aa14.79□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 GALCP54803 685 aa14.79□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 MCL1Q07820 350 aa14.79□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 MAP7D1Q3KQU3 841 aa14.79□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 CLMNQ96JQ2 1002 aa14.79□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa14.79□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 TTYH3Q9C0H2 523 aa14.79□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 WDR35Q9P2L0 1181 aa14.79□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 JAG2Q9Y219 1238 aa14.79□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 SIK3Q9Y2K2 1263 aa14.79□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 PXDNQ92626 1479 aa14.79□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 MAPK7Q13164 816 aa14.79□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 SLC44A4Q53GD3 710 aa14.79□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 RDH13Q8NBN7 331 aa14.79□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 GJA10Q969M2 543 aa14.79□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 C18orf8Q96DM3 657 aa14.79□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 PICK1Q9NRD5 415 aa14.79□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 KBTBD4Q9NVX7 518 aa14.79□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa14.79□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 ZWINTO95229 277 aa14.78□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 RCAN1P53805 252 aa14.78□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 C1orf146Q5VVC0 180 aa14.78□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 UCMAQ8WVF2 138 aa14.78□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 DIP2BQ9P265 1576 aa14.78□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 ABLIM1O14639 778 aa14.78□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 SUPT3HO75486 399 aa14.78□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 TRPA1O75762 1119 aa14.78□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 RASGRF1Q13972 1273 aa14.78□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 LBRQ14739 615 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 TBCKQ8TEA7 893 aa14.78□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 TUBB6Q9BUF5 446 aa14.78□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 EMILIN3Q9NT22 766 aa14.78□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 STK17AQ9UEE5 414 aa14.78□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 A0A1B0GVG6 124 aa14.78□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 NBPF26B4DH59 902 aa14.78□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 CALUO43852 315 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 SLC9A1P19634 815 aa14.78□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 MED21Q13503 144 aa14.78□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 EMC10Q5UCC4 262 aa14.78□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 GRAMD4Q6IC98 578 aa14.78□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 NBPF15Q8N660 670 aa14.78□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 FAM13CQ8NE31 585 aa14.78□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 NMRK1Q9NWW6 199 aa14.78□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 PHTF1Q9UMS5 762 aa14.78□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 PEAK1Q9H792 1746 aa14.78□□□□□ -0.04
RIN3-201ENST00000216487 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms