RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639007.1

SPIN3-218, Transcript of spindlin family member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 4 BASIC

Gene SPIN3, Length 4,277 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3-218ENST00000639007 NLRP13Q86W25 1043 aa13.19□□□□□ -0.3
SPIN3-218ENST00000639007 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa13.18□□□□□ -0.3
SPIN3-218ENST00000639007 MAPKBP1O60336 1514 aa13.18□□□□□ -0.3
SPIN3-218ENST00000639007 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
SPIN3-218ENST00000639007 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
SPIN3-218ENST00000639007 CHMP5Q9NZZ3 219 aa13.18□□□□□ -0.3
SPIN3-218ENST00000639007 DDX11L8A8MPP1 907 aa13.17□□□□□ -0.3
SPIN3-218ENST00000639007 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
SPIN3-218ENST00000639007 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa13.17□□□□□ -0.3
SPIN3-218ENST00000639007 TSPY4P0CV99 314 aa13.17□□□□□ -0.3
SPIN3-218ENST00000639007 TSPY10P0CW01 314 aa13.17□□□□□ -0.3
SPIN3-218ENST00000639007 RALBP1Q15311 655 aa13.17□□□□□ -0.3
SPIN3-218ENST00000639007 CCDC146Q8IYE0 955 aa13.17□□□□□ -0.3
SPIN3-218ENST00000639007 COG6Q9Y2V7 657 aa13.17□□□□□ -0.3
SPIN3-218ENST00000639007 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
SPIN3-218ENST00000639007 NBPF8Q3BBV2 869 aa13.16□□□□□ -0.3
SPIN3-218ENST00000639007 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa13.16□□□□□ -0.3
SPIN3-218ENST00000639007 FYCO1Q9BQS8 1478 aa13.16□□□□□ -0.3
SPIN3-218ENST00000639007 CUL7Q14999 1698 aa13.15□□□□□ -0.3
SPIN3-218ENST00000639007 CCDC18Q5T9S5 1454 aa13.15□□□□□ -0.3
SPIN3-218ENST00000639007 NASPP49321 788 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
SPIN3-218ENST00000639007 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
SPIN3-218ENST00000639007 MRC2Q9UBG0 1479 aa13.14□□□□□ -0.31
SPIN3-218ENST00000639007 MAP3K1Q13233 1512 aa13.14□□□□□ -0.31
SPIN3-218ENST00000639007 GOLGA2Q08379 1002 aa13.14□□□□□ -0.31
SPIN3-218ENST00000639007 MPNDQ8N594 471 aa13.14□□□□□ -0.31
SPIN3-218ENST00000639007 UQCRHLA0A096LP55 91 aa13.13□□□□□ -0.31
SPIN3-218ENST00000639007 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa13.13□□□□□ -0.31
SPIN3-218ENST00000639007 UQCRHP07919 91 aa13.13□□□□□ -0.31
SPIN3-218ENST00000639007 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
SPIN3-218ENST00000639007 MAP7D2Q96T17 732 aa13.13□□□□□ -0.31
SPIN3-218ENST00000639007 BCL2L13Q9BXK5 485 aa13.12□□□□□ -0.31
SPIN3-218ENST00000639007 GRIN2BQ13224 1484 aa13.12□□□□□ -0.31
SPIN3-218ENST00000639007 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
SPIN3-218ENST00000639007 KNSTRNQ9Y448 316 aa13.12□□□□□ -0.31
SPIN3-218ENST00000639007 PRDM2Q13029 1718 aa13.12□□□□□ -0.31
SPIN3-218ENST00000639007 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
SPIN3-218ENST00000639007 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
SPIN3-218ENST00000639007 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
SPIN3-218ENST00000639007 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
SPIN3-218ENST00000639007 TIAM1Q13009 1591 aa13.1□□□□□ -0.31
SPIN3-218ENST00000639007 C8orf34Q49A92 452 aa13.1□□□□□ -0.31
SPIN3-218ENST00000639007 IFT140Q96RY7 1462 aa13.09□□□□□ -0.31
SPIN3-218ENST00000639007 KIF15Q9NS87 1388 aa13.09□□□□□ -0.31
SPIN3-218ENST00000639007 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
SPIN3-218ENST00000639007 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa13.09□□□□□ -0.31
SPIN3-218ENST00000639007 PANK1Q8TE04 598 aa13.08□□□□□ -0.31
SPIN3-218ENST00000639007 CBX1P83916 185 aa13.08□□□□□ -0.32
SPIN3-218ENST00000639007 USP47Q96K76 1375 aa13.08□□□□□ -0.32
SPIN3-218ENST00000639007 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP13.08□□□□□ -0.32
SPIN3-218ENST00000639007 AAMPQ13685 434 aa13.08□□□□□ -0.32
SPIN3-218ENST00000639007 TBC1D2Q9BYX2 928 aa13.08□□□□□ -0.32
SPIN3-218ENST00000639007 KIAA2012Q0VF49 1180 aa13.07□□□□□ -0.32
SPIN3-218ENST00000639007 RNF214Q8ND24 703 aa13.07□□□□□ -0.32
SPIN3-218ENST00000639007 ZSCAN30Q86W11 494 aa13.07□□□□□ -0.32
SPIN3-218ENST00000639007 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP13.07□□□□□ -0.32
SPIN3-218ENST00000639007 C22orf23Q9BZE7 217 aa13.07□□□□□ -0.32
SPIN3-218ENST00000639007 PLCD3Q8N3E9 789 aa13.06□□□□□ -0.32
SPIN3-218ENST00000639007 SEC24BO95487 1268 aa13.06□□□□□ -0.32
SPIN3-218ENST00000639007 UACAQ9BZF9 1416 aa13.06□□□□□ -0.32
SPIN3-218ENST00000639007 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-218ENST00000639007 FGD6Q6ZV73 1430 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-218ENST00000639007 BCAR3O75815 825 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-218ENST00000639007 PKD2Q13563 968 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-218ENST00000639007 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-218ENST00000639007 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-218ENST00000639007 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-218ENST00000639007 IGSF3O75054 1194 aa13.04□□□□□ -0.32
SPIN3-218ENST00000639007 FGD1P98174 961 aa13.04□□□□□ -0.32
SPIN3-218ENST00000639007 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
SPIN3-218ENST00000639007 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
SPIN3-218ENST00000639007 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP13.04□□□□□ -0.32
SPIN3-218ENST00000639007 CCDC173Q0VFZ6 552 aa13.04□□□□□ -0.32
SPIN3-218ENST00000639007 MYOM3Q5VTT5 1437 aa13.03□□□□□ -0.32
SPIN3-218ENST00000639007 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
SPIN3-218ENST00000639007 ADAMTS8Q9UP79 889 aa13.03□□□□□ -0.32
SPIN3-218ENST00000639007 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.32
SPIN3-218ENST00000639007 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa13.02□□□□□ -0.32
SPIN3-218ENST00000639007 RNF123Q5XPI4 1314 aa13.02□□□□□ -0.32
SPIN3-218ENST00000639007 APAF1O14727 1248 aa13.02□□□□□ -0.32
SPIN3-218ENST00000639007 VGLL3A8MV65 326 aa13.02□□□□□ -0.33
SPIN3-218ENST00000639007 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
SPIN3-218ENST00000639007 JPH4Q96JJ6 628 aa13.01□□□□□ -0.33
SPIN3-218ENST00000639007 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
SPIN3-218ENST00000639007 MCTP1Q6DN14 999 aa13.01□□□□□ -0.33
SPIN3-218ENST00000639007 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
SPIN3-218ENST00000639007 PANK3Q9H999 370 aa13.01□□□□□ -0.33
SPIN3-218ENST00000639007 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP13□□□□□ -0.33
SPIN3-218ENST00000639007 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
SPIN3-218ENST00000639007 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
SPIN3-218ENST00000639007 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa13□□□□□ -0.33
SPIN3-218ENST00000639007 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
SPIN3-218ENST00000639007 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa12.99□□□□□ -0.33
SPIN3-218ENST00000639007 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa12.98□□□□□ -0.33
SPIN3-218ENST00000639007 PTMSP20962 102 aa12.98□□□□□ -0.33
SPIN3-218ENST00000639007 NCOA2Q15596 1464 aa12.98□□□□□ -0.33
SPIN3-218ENST00000639007 CGNL1Q0VF96 1302 aa12.98□□□□□ -0.33
SPIN3-218ENST00000639007 SPDYE4A6NLX3 237 aa12.98□□□□□ -0.33
SPIN3-218ENST00000639007 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
SPIN3-218ENST00000639007 IGHDP01880 384 aa12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.5 ms