RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa10.72□□□□□ -0.69
PTPRT-211ENST00000618610 MS4A1P11836 297 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRT-211ENST00000618610 RRP9O43818 475 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.7
PTPRT-211ENST00000618610 RGS3P49796 1198 aa10.71□□□□□ -0.7
PTPRT-211ENST00000618610 JPH4Q96JJ6 628 aa10.71□□□□□ -0.7
PTPRT-211ENST00000618610 RCAN3Q9UKA8 241 aa10.71□□□□□ -0.7
PTPRT-211ENST00000618610 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRT-211ENST00000618610 ARID3AQ99856 593 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRT-211ENST00000618610 KIF7Q2M1P5 1343 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRT-211ENST00000618610 NUP160Q12769 1436 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRT-211ENST00000618610 GRIN2AQ12879 1464 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRT-211ENST00000618610 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
PTPRT-211ENST00000618610 TMC1Q8TDI8 760 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRT-211ENST00000618610 PLB1Q6P1J6 1458 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRT-211ENST00000618610 CRBNQ96SW2 442 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRT-211ENST00000618610 PKD2Q13563 968 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRT-211ENST00000618610 UGGT2Q9NYU1 1516 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRT-211ENST00000618610 CDCA7LQ96GN5 454 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRT-211ENST00000618610 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
PTPRT-211ENST00000618610 KDM6BO15054 1643 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRT-211ENST00000618610 ZBTB22O15209 634 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRT-211ENST00000618610 SAMD9Q5K651 1589 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRT-211ENST00000618610 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRT-211ENST00000618610 KDM5BQ9UGL1 1544 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRT-211ENST00000618610 C20orf194Q5TEA3 1177 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRT-211ENST00000618610 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP10.65□□□□□ -0.7
PTPRT-211ENST00000618610 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
PTPRT-211ENST00000618610 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
PTPRT-211ENST00000618610 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRT-211ENST00000618610 ARHGEF11O15085 1522 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRT-211ENST00000618610 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa10.65□□□□□ -0.71
PTPRT-211ENST00000618610 NCOA1Q15788 1441 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRT-211ENST00000618610 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
PTPRT-211ENST00000618610 MIA2Q96PC5 1412 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRT-211ENST00000618610 OSCARQ8IYS5 282 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRT-211ENST00000618610 HECW1Q76N89 1606 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRT-211ENST00000618610 DAPK1P53355 1430 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRT-211ENST00000618610 AAMPQ13685 434 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRT-211ENST00000618610 C8orf34Q49A92 452 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRT-211ENST00000618610 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
PTPRT-211ENST00000618610 CARD11Q9BXL7 1154 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRT-211ENST00000618610 CHGAP10645 457 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
PTPRT-211ENST00000618610 CLCN1P35523 988 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRT-211ENST00000618610 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
PTPRT-211ENST00000618610 ABCC5O15440 1437 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRT-211ENST00000618610 FAM161AQ3B820 660 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRT-211ENST00000618610 IQGAP2Q13576 1575 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRT-211ENST00000618610 USP47Q96K76 1375 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRT-211ENST00000618610 PLEKHD1A6NEE1 506 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRT-211ENST00000618610 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
PTPRT-211ENST00000618610 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRT-211ENST00000618610 NBPF1Q3BBV0 1214 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRT-211ENST00000618610 ERBB4Q15303 1308 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRT-211ENST00000618610 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
PTPRT-211ENST00000618610 ERCC6L2Q5T890 1561 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRT-211ENST00000618610 TSPY4P0CV99 314 aa10.57□□□□□ -0.72
PTPRT-211ENST00000618610 TSPY10P0CW01 314 aa10.57□□□□□ -0.72
PTPRT-211ENST00000618610 NUP155O75694 1391 aa10.57□□□□□ -0.72
PTPRT-211ENST00000618610 SEC24BO95487 1268 aa10.57□□□□□ -0.72
PTPRT-211ENST00000618610 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
PTPRT-211ENST00000618610 AFAP1Q8N556 730 aa10.57□□□□□ -0.72
PTPRT-211ENST00000618610 PRDM4Q9UKN5 801 aa10.57□□□□□ -0.72
PTPRT-211ENST00000618610 GCC2Q8IWJ2 1684 aa10.57□□□□□ -0.72
PTPRT-211ENST00000618610 ROCK1Q13464 1354 aa10.57□□□□□ -0.72
PTPRT-211ENST00000618610 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa10.56□□□□□ -0.72
PTPRT-211ENST00000618610 FGD1P98174 961 aa10.56□□□□□ -0.72
PTPRT-211ENST00000618610 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP10.56□□□□□ -0.72
PTPRT-211ENST00000618610 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
PTPRT-211ENST00000618610 PRDM10Q9NQV6 1147 aa10.56□□□□□ -0.72
PTPRT-211ENST00000618610 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
PTPRT-211ENST00000618610 TEX14Q8IWB6 1497 aa10.55□□□□□ -0.72
PTPRT-211ENST00000618610 ESPNB1AK53 854 aa10.55□□□□□ -0.72
PTPRT-211ENST00000618610 PPP6R1Q9UPN7 881 aa10.55□□□□□ -0.72
PTPRT-211ENST00000618610 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa10.54□□□□□ -0.72
PTPRT-211ENST00000618610 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa10.54□□□□□ -0.72
PTPRT-211ENST00000618610 PDE4CQ08493 712 aa10.54□□□□□ -0.72
PTPRT-211ENST00000618610 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRT-211ENST00000618610 FAM13BQ9NYF5 915 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRT-211ENST00000618610 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
PTPRT-211ENST00000618610 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRT-211ENST00000618610 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
PTPRT-211ENST00000618610 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRT-211ENST00000618610 PDCL3Q9H2J4 239 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRT-211ENST00000618610 MYH16Q9H6N6 1097 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRT-211ENST00000618610 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRT-211ENST00000618610 KDM2BQ8NHM5 1336 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRT-211ENST00000618610 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRT-211ENST00000618610 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
PTPRT-211ENST00000618610 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
PTPRT-211ENST00000618610 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
PTPRT-211ENST00000618610 PZPP20742 1482 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRT-211ENST00000618610 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
PTPRT-211ENST00000618610 USP19O94966 1318 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRT-211ENST00000618610 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
PTPRT-211ENST00000618610 FSD2A1L4K1 749 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRT-211ENST00000618610 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
PTPRT-211ENST00000618610 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
PTPRT-211ENST00000618610 DISP1Q96F81 1524 aa10.48□□□□□ -0.73
PTPRT-211ENST00000618610 KIF15Q9NS87 1388 aa10.48□□□□□ -0.73
PTPRT-211ENST00000618610 ZBTB7CA1YPR0 619 aa10.48□□□□□ -0.73
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