RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611640.4

KDM4B-211, Transcript of lysine demethylase 4B, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene KDM4B, Length 5,703 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4B-211ENST00000611640 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa20.69■□□□□ 0.9
KDM4B-211ENST00000611640 USP35Q9P2H5 1018 aa20.69■□□□□ 0.9
KDM4B-211ENST00000611640 FAM161AQ3B820 660 aa20.69■□□□□ 0.9
KDM4B-211ENST00000611640 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
KDM4B-211ENST00000611640 FOXD4L1Q9NU39 408 aa20.68■□□□□ 0.9
KDM4B-211ENST00000611640 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
KDM4B-211ENST00000611640 CHMP4AQ9BY43 222 aa20.68■□□□□ 0.9
KDM4B-211ENST00000611640 LMOD3Q0VAK6 560 aa20.68■□□□□ 0.9
KDM4B-211ENST00000611640 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
KDM4B-211ENST00000611640 SLC4A10Q6U841 1118 aa20.66■□□□□ 0.9
KDM4B-211ENST00000611640 CRBNQ96SW2 442 aa20.66■□□□□ 0.9
KDM4B-211ENST00000611640 TRAK1Q9UPV9 953 aa20.65■□□□□ 0.9
KDM4B-211ENST00000611640 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
KDM4B-211ENST00000611640 GPATCH3Q96I76 525 aa20.65■□□□□ 0.9
KDM4B-211ENST00000611640 E9PSI1 815 aa20.64■□□□□ 0.9
KDM4B-211ENST00000611640 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa20.64■□□□□ 0.89
KDM4B-211ENST00000611640 FANCIQ9NVI1 1328 aa20.62■□□□□ 0.89
KDM4B-211ENST00000611640 JPH4Q96JJ6 628 aa20.62■□□□□ 0.89
KDM4B-211ENST00000611640 ST18O60284 1047 aa20.61■□□□□ 0.89
KDM4B-211ENST00000611640 SLC4A3P48751 1232 aa20.61■□□□□ 0.89
KDM4B-211ENST00000611640 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP20.61■□□□□ 0.89
KDM4B-211ENST00000611640 DDX11L8A8MPP1 907 aa20.61■□□□□ 0.89
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KDM4B-211ENST00000611640 HDAC5Q9UQL6 1122 aa20.6■□□□□ 0.89
KDM4B-211ENST00000611640 BCL2L13Q9BXK5 485 aa20.6■□□□□ 0.89
KDM4B-211ENST00000611640 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa20.6■□□□□ 0.89
KDM4B-211ENST00000611640 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa20.59■□□□□ 0.89
KDM4B-211ENST00000611640 UACAQ9BZF9 1416 aa20.59■□□□□ 0.89
KDM4B-211ENST00000611640 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa20.58■□□□□ 0.89
KDM4B-211ENST00000611640 ARID3AQ99856 593 aa20.58■□□□□ 0.88
KDM4B-211ENST00000611640 CGNL1Q0VF96 1302 aa20.58■□□□□ 0.88
KDM4B-211ENST00000611640 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
KDM4B-211ENST00000611640 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
KDM4B-211ENST00000611640 GSE1Q14687 1217 aa20.56■□□□□ 0.88
KDM4B-211ENST00000611640 COG6Q9Y2V7 657 aa20.56■□□□□ 0.88
KDM4B-211ENST00000611640 TPM4P67936 248 aa20.55■□□□□ 0.88
KDM4B-211ENST00000611640 GORABQ5T7V8 394 aa20.54■□□□□ 0.88
KDM4B-211ENST00000611640 ANKRD45Q5TZF3 282 aa20.54■□□□□ 0.88
KDM4B-211ENST00000611640 AMPHP49418 695 aa20.54■□□□□ 0.88
KDM4B-211ENST00000611640 CHMP3Q9Y3E7 222 aa20.54■□□□□ 0.88
KDM4B-211ENST00000611640 FANCD2Q9BXW9 1451 aa20.54■□□□□ 0.88
KDM4B-211ENST00000611640 APAF1O14727 1248 aa20.54■□□□□ 0.88
KDM4B-211ENST00000611640 PHF14O94880 888 aa20.53■□□□□ 0.88
KDM4B-211ENST00000611640 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
KDM4B-211ENST00000611640 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
KDM4B-211ENST00000611640 CCDC7Q96M83 1385 aa20.52■□□□□ 0.88
KDM4B-211ENST00000611640 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
KDM4B-211ENST00000611640 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
KDM4B-211ENST00000611640 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
KDM4B-211ENST00000611640 FGD6Q6ZV73 1430 aa20.51■□□□□ 0.87
KDM4B-211ENST00000611640 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
KDM4B-211ENST00000611640 EVC2Q86UK5 1308 aa20.51■□□□□ 0.87
KDM4B-211ENST00000611640 KIF16BQ96L93 1317 aa20.5■□□□□ 0.87
KDM4B-211ENST00000611640 KIF21BO75037 1637 aa20.5■□□□□ 0.87
KDM4B-211ENST00000611640 KIF7Q2M1P5 1343 aa20.49■□□□□ 0.87
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KDM4B-211ENST00000611640 EID1Q9Y6B2 187 aa20.48■□□□□ 0.87
KDM4B-211ENST00000611640 MYOM3Q5VTT5 1437 aa20.48■□□□□ 0.87
KDM4B-211ENST00000611640 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
KDM4B-211ENST00000611640 IGF1RP08069 1367 aa20.48■□□□□ 0.87
KDM4B-211ENST00000611640 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
KDM4B-211ENST00000611640 TAF7LQ5H9L4 462 aa20.47■□□□□ 0.87
KDM4B-211ENST00000611640 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
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KDM4B-211ENST00000611640 RILPL2Q969X0 211 aa20.46■□□□□ 0.87
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KDM4B-211ENST00000611640 NUTM2FA1L443 756 aa20.45■□□□□ 0.86
KDM4B-211ENST00000611640 DDX19BQ9UMR2 479 aa20.45■□□□□ 0.86
KDM4B-211ENST00000611640 COG3Q96JB2 828 aa20.44■□□□□ 0.86
KDM4B-211ENST00000611640 CCDC34Q96HJ3 373 aa20.44■□□□□ 0.86
KDM4B-211ENST00000611640 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.43■□□□□ 0.86
KDM4B-211ENST00000611640 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.43■□□□□ 0.86
KDM4B-211ENST00000611640 CLSTN1O94985 981 aa20.43■□□□□ 0.86
KDM4B-211ENST00000611640 PTPRGP23470 1445 aa20.43■□□□□ 0.86
KDM4B-211ENST00000611640 RSPH6AQ9H0K4 717 aa20.42■□□□□ 0.86
KDM4B-211ENST00000611640 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
KDM4B-211ENST00000611640 KIF3AQ9Y496 699 aa20.41■□□□□ 0.86
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KDM4B-211ENST00000611640 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
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KDM4B-211ENST00000611640 RUNDC1Q96C34 613 aa20.38■□□□□ 0.85
KDM4B-211ENST00000611640 WASHC2AQ641Q2 1341 aa20.37■□□□□ 0.85
KDM4B-211ENST00000611640 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.37■□□□□ 0.85
KDM4B-211ENST00000611640 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
KDM4B-211ENST00000611640 RIPK4P57078 832 aa20.37■□□□□ 0.85
KDM4B-211ENST00000611640 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
KDM4B-211ENST00000611640 H3BQV1 296 aa20.36■□□□□ 0.85
KDM4B-211ENST00000611640 IFFO2Q5TF58 517 aa20.36■□□□□ 0.85
KDM4B-211ENST00000611640 REC8O95072 547 aa20.36■□□□□ 0.85
KDM4B-211ENST00000611640 CHMP5Q9NZZ3 219 aa20.36■□□□□ 0.85
KDM4B-211ENST00000611640 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
KDM4B-211ENST00000611640 MIA2Q96PC5 1412 aa20.35■□□□□ 0.85
KDM4B-211ENST00000611640 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
KDM4B-211ENST00000611640 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
KDM4B-211ENST00000611640 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
KDM4B-211ENST00000611640 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.33■□□□□ 0.85
KDM4B-211ENST00000611640 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
KDM4B-211ENST00000611640 RASSF8Q8NHQ8 419 aa20.33■□□□□ 0.84
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