RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606714.5

TRAM2-AS1-204, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 2,453 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 BCORL1Q5H9F3 1711 aa29.96■■■□□ 2.39
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NEFLP07196 543 aa29.96■■■□□ 2.39
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KDM5CP41229 1560 aa29.96■■■□□ 2.39
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CCDC144AA2RUR9 1427 aa29.95■■■□□ 2.39
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ANP32EQ9BTT0 268 aa29.94■■■□□ 2.38
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa29.91■■■□□ 2.38
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.91■■■□□ 2.38
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PLA2R1Q13018 1463 aa29.9■■■□□ 2.38
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 UNC13BO14795 1591 aa29.89■■■□□ 2.38
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PLXNC1O60486 1568 aa29.89■■■□□ 2.38
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 AFAP1Q8N556 730 aa29.87■■■□□ 2.37
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DUOX2Q9NRD8 1548 aa29.87■■■□□ 2.37
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ABCC1P33527 1531 aa29.84■■■□□ 2.37
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ERBINQ96RT1 1412 aa29.81■■■□□ 2.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NBPF1Q3BBV0 1214 aa29.81■■■□□ 2.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PRAG1Q86YV5 1406 aa29.79■■■□□ 2.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IQGAP3Q86VI3 1631 aa29.79■■■□□ 2.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 A2MP01023 1474 aa29.76■■■□□ 2.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 WDR7Q9Y4E6 1490 aa29.75■■■□□ 2.35
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MYT1LQ9UL68 1186 aa29.72■■■□□ 2.35
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MAGI2Q86UL8 1455 aa29.72■■■□□ 2.35
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa29.67■■■□□ 2.34
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FANCAO15360 1455 aa29.67■■■□□ 2.34
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZBED9Q6R2W3 1325 aa29.66■■■□□ 2.34
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa29.65■■■□□ 2.34
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa29.64■■■□□ 2.34
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa29.64■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ATP10AO60312 1499 aa29.63■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ARAP3Q8WWN8 1544 aa29.63■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ASXL2Q76L83 1435 aa29.61■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GPRASP1Q5JY77 1395 aa29.6■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SCAPERQ9BY12 1400 aa29.6■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TMC1Q8TDI8 760 aa29.59■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KIF3BO15066 747 aa29.58■■■□□ 2.33
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ADGRL1O94910 1474 aa29.57■■■□□ 2.32
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ABCA9Q8IUA7 1624 aa29.55■■■□□ 2.32
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ATP7AQ04656 1500 aa29.55■■■□□ 2.32
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TESK2Q96S53 571 aa29.53■■■□□ 2.32
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 E9PCH4 1651 aa29.53■■■□□ 2.32
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DISP3Q9P2K9 1392 aa29.53■■■□□ 2.32
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 OSCARQ8IYS5 282 aa29.52■■■□□ 2.32
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 BCL11AQ9H165 835 aa29.51■■■□□ 2.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29.5■■■□□ 2.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KANK1Q14678 1352 aa29.49■■■□□ 2.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RALBP1Q15311 655 aa29.48■■■□□ 2.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TRPM2O94759 1503 aa29.45■■■□□ 2.3
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TMF1P82094 1093 aa29.44■■■□□ 2.3
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PTPRTO14522 1441 aa29.43■■■□□ 2.3
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LAMC1P11047 1609 aa29.43■■■□□ 2.3
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DEPDC5O75140 1603 aa29.42■■■□□ 2.3
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PANK3Q9H999 370 aa29.42■■■□□ 2.3
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CLTCL1P53675 1640 aa29.4■■■□□ 2.3
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa29.38■■■□□ 2.29
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TET3O43151 1660 aa29.37■■■□□ 2.29
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PARD3Q8TEW0 1356 aa29.36■■■□□ 2.29
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MADDQ8WXG6 1647 aa29.36■■■□□ 2.29
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NLRP13Q86W25 1043 aa29.35■■■□□ 2.29
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 VWDEQ8N2E2 1590 aa29.34■■■□□ 2.29
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NUDCQ9Y266 331 aa29.34■■■□□ 2.29
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CD109Q6YHK3 1445 aa29.33■■■□□ 2.29
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 UGGT1Q9NYU2 1555 aa29.33■■■□□ 2.29
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MROH1Q8NDA8 1641 aa29.31■■■□□ 2.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CEP152O94986 1710 aa29.31■■■□□ 2.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa29.31■■■□□ 2.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PPP4R2Q9NY27 417 aa29.3■■■□□ 2.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa29.29■■■□□ 2.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ERICH6BQ5W0A0 696 aa29.29■■■□□ 2.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa29.26■■■□□ 2.27
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GGT6Q6P531 493 aa29.26■■■□□ 2.27
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 STAC3Q96MF2 364 aa29.25■■■□□ 2.27
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CFAP70Q5T0N1 1121 aa29.25■■■□□ 2.27
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa29.23■■■□□ 2.27
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CHGAP10645 457 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa29.22■■■□□ 2.27
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 POGZQ7Z3K3 1410 aa29.21■■■□□ 2.27
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 EFCAB6Q5THR3 1501 aa29.21■■■□□ 2.27
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IQGAP1P46940 1657 aa29.2■■■□□ 2.26
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RAPGEF3O95398 923 aa29.19■■■□□ 2.26
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