RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NBPF1Q3BBV0 1214 aa16.16■□□□□ 0.18
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CCDC144AA2RUR9 1427 aa16.15■□□□□ 0.18
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PLA2R1Q13018 1463 aa16.14■□□□□ 0.17
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZBED9Q6R2W3 1325 aa16.12■□□□□ 0.17
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AFAP1Q8N556 730 aa16.12■□□□□ 0.17
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MYO5CQ9NQX4 1742 aa16.1■□□□□ 0.17
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PLCH2O75038 1416 aa16.1■□□□□ 0.17
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa16.1■□□□□ 0.17
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MAST1Q9Y2H9 1570 aa16.07■□□□□ 0.16
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A2MP01023 1474 aa16.06■□□□□ 0.16
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UNC13BO14795 1591 aa16.05■□□□□ 0.16
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DUOX2Q9NRD8 1548 aa16.04■□□□□ 0.16
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PLXNC1O60486 1568 aa16.03■□□□□ 0.16
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MYT1LQ9UL68 1186 aa16.02■□□□□ 0.15
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa16.01■□□□□ 0.15
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IQGAP3Q86VI3 1631 aa16.01■□□□□ 0.15
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ERBINQ96RT1 1412 aa16■□□□□ 0.15
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa16■□□□□ 0.15
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ABCC1P33527 1531 aa16■□□□□ 0.15
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TESK2Q96S53 571 aa15.99■□□□□ 0.15
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa15.99■□□□□ 0.15
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DISP3Q9P2K9 1392 aa15.99■□□□□ 0.15
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PPP4R2Q9NY27 417 aa15.97■□□□□ 0.15
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GPRASP1Q5JY77 1395 aa15.97■□□□□ 0.15
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RALBP1Q15311 655 aa15.96■□□□□ 0.15
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MAGI2Q86UL8 1455 aa15.96■□□□□ 0.15
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PANK3Q9H999 370 aa15.95■□□□□ 0.14
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NUDCQ9Y266 331 aa15.94■□□□□ 0.14
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ATP10AO60312 1499 aa15.94■□□□□ 0.14
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SCAPERQ9BY12 1400 aa15.93■□□□□ 0.14
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 WDR7Q9Y4E6 1490 aa15.92■□□□□ 0.14
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FANCAO15360 1455 aa15.92■□□□□ 0.14
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ERICH6BQ5W0A0 696 aa15.91■□□□□ 0.14
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMF1P82094 1093 aa15.91■□□□□ 0.14
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa15.91■□□□□ 0.14
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NLRP13Q86W25 1043 aa15.9■□□□□ 0.14
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 E9PCH4 1651 aa15.9■□□□□ 0.14
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa15.89■□□□□ 0.13
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PARD3Q8TEW0 1356 aa15.89■□□□□ 0.13
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ADGRL1O94910 1474 aa15.87■□□□□ 0.13
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ASXL2Q76L83 1435 aa15.87■□□□□ 0.13
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ATP7AQ04656 1500 aa15.85■□□□□ 0.13
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ARAP3Q8WWN8 1544 aa15.84■□□□□ 0.13
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KANK1Q14678 1352 aa15.84■□□□□ 0.13
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PTPRTO14522 1441 aa15.83■□□□□ 0.13
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRPM2O94759 1503 aa15.82■□□□□ 0.12
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RNF123Q5XPI4 1314 aa15.82■□□□□ 0.12
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LAMC1P11047 1609 aa15.82■□□□□ 0.12
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CLTCL1P53675 1640 aa15.82■□□□□ 0.12
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CDCA7LQ96GN5 454 aa15.82■□□□□ 0.12
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UGGT1Q9NYU2 1555 aa15.82■□□□□ 0.12
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ABCA9Q8IUA7 1624 aa15.81■□□□□ 0.12
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CFAP70Q5T0N1 1121 aa15.81■□□□□ 0.12
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MADDQ8WXG6 1647 aa15.8■□□□□ 0.12
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP15.8■□□□□ 0.12
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa15.8■□□□□ 0.12
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa15.8■□□□□ 0.12
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa15.8■□□□□ 0.12
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KNSTRNQ9Y448 316 aa15.79■□□□□ 0.12
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OSCARQ8IYS5 282 aa15.79■□□□□ 0.12
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CCDC136Q96JN2 1154 aa15.79■□□□□ 0.12
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DEPDC5O75140 1603 aa15.78■□□□□ 0.12
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CHGAP10645 457 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GGT6Q6P531 493 aa15.78■□□□□ 0.12
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ANP32EQ9BTT0 268 aa15.78■□□□□ 0.12
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MSH5O43196 834 aa15.77■□□□□ 0.12
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TET3O43151 1660 aa15.77■□□□□ 0.12
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CEP152O94986 1710 aa15.76■□□□□ 0.11
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ADAMTS8Q9UP79 889 aa15.76■□□□□ 0.11
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RCAN3Q9UKA8 241 aa15.75■□□□□ 0.11
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 VWDEQ8N2E2 1590 aa15.75■□□□□ 0.11
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MROH1Q8NDA8 1641 aa15.74■□□□□ 0.11
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PPP2R1AP30153 589 aa15.74■□□□□ 0.11
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